More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2953 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2953  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  404  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2816  YceI  80.1 
 
 		 196 aa  322  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2717  signal peptide protein  69.23 
 
 		 198 aa  265  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.999831  normal  0.128957 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2961  YceI family protein  66.84 
 
 		 198 aa  264  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2551  YceI family protein  69.23 
 
 		 198 aa  259  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.298445 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0704  YceI family protein  61.05 
 
 		 193 aa  249  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  normal  0.494453 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  60.42 
 
 		 189 aa  243  9e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3995  hypothetical protein  58.73 
 
 		 189 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645736  normal  0.347265 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3804  hypothetical protein  63.22 
 
 		 211 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7381  YceI  63.53 
 
 		 187 aa  231  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398085  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0232  YceI  62.07 
 
 		 193 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145864  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0607  YceI family protein  62.07 
 
 		 195 aa  229  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0716  YceI family protein  62.07 
 
 		 193 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.943663  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0683  YceI family protein  62.07 
 
 		 193 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0631  YceI family protein  62.64 
 
 		 193 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  57.14 
 
 		 192 aa  228  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2669  YceI family protein  60.34 
 
 		 193 aa  226  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3333  YceI  61.85 
 
 		 192 aa  225  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1160  YceI-like family protein  61.99 
 
 		 192 aa  224  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3367  hypothetical protein  61.99 
 
 		 192 aa  224  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2568  hypothetical protein  61.99 
 
 		 192 aa  224  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0298  hypothetical protein  61.99 
 
 		 192 aa  224  6e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2382  YceI-like family protein  61.99 
 
 		 187 aa  224  8e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3377  YceI-like family protein  61.99 
 
 		 187 aa  224  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1273  YceI-like family protein  61.99 
 
 		 187 aa  223  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5860  YceI family protein  58.58 
 
 		 192 aa  218  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2066  hypothetical protein  58.58 
 
 		 192 aa  218  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0648985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0457  YceI family protein  46.35 
 
 		 189 aa  174  6e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  43.62 
 
 		 196 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3578  YceI family protein  45.24 
 
 		 192 aa  162  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1028  YceI family protein  43.86 
 
 		 191 aa  160  8.000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3505  YceI family protein  43.45 
 
 		 191 aa  156  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.781833 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1463  putative signal peptide protein  50.34 
 
 		 151 aa  155  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.036668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1519  YceI family protein  41.15 
 
 		 191 aa  147  7e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0469  YceI family protein  40.54 
 
 		 211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730302  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2226  YceI family protein  41.97 
 
 		 192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000678562  decreased coverage  0.00447323 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3508  periplasmic protein  42.69 
 
 		 196 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.234261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3736  YceI  42.6 
 
 		 218 aa  143  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.192641 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  42.17 
 
 		 189 aa  141  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  42.86 
 
 		 192 aa  141  7e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3154  YceI  34.72 
 
 		 192 aa  127  9.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0257242  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3992  YceI family protein  35.42 
 
 		 188 aa  121  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3509  hypothetical protein  35.12 
 
 		 198 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.137598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0912  YceI  33.91 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580537  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1536  YceI family protein  34.25 
 
 		 191 aa  114  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1738  YceI family protein  34.25 
 
 		 188 aa  114  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1721  YceI family protein  34.25 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  39.46 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1735  hypothetical protein  34.5 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1799  hypothetical protein  34.12 
 
 		 188 aa  111  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2217  YceI family protein  33.86 
 
 		 199 aa  105  5e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  34.04 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  36.26 
 
 		 196 aa  101  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1150  periplasmic protein  32.57 
 
 		 206 aa  99  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.138125  normal  0.79265 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0815  hypothetical protein  36.05 
 
 		 197 aa  95.9  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  35.19 
 
 		 205 aa  95.9  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1782  YceI  30.77 
 
 		 204 aa  95.5  5e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0100028 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  33.51 
 
 		 179 aa  94.7  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  37.84 
 
 		 201 aa  94  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0892  YceI family protein  35.2 
 
 		 193 aa  94  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  36.76 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  32.11 
 
 		 199 aa  92.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  36.11 
 
 		 201 aa  92  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  37.84 
 
 		 213 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  34.68 
 
 		 200 aa  91.3  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  36.46 
 
 		 183 aa  90.9  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3229  hypothetical protein  31.63 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.474421  normal  0.780413 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  34.29 
 
 		 195 aa  90.1  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  32.95 
 
 		 205 aa  89.7  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  32.95 
 
 		 182 aa  89.4  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  33.95 
 
 		 209 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  34.46 
 
 		 201 aa  88.6  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0830  YceI  31.58 
 
 		 199 aa  88.6  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0387934  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  34.07 
 
 		 197 aa  88.6  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  34.3 
 
 		 182 aa  88.2  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  35.03 
 
 		 201 aa  87.8  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  33.9 
 
 		 182 aa  87  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  33.52 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  33.9 
 
 		 182 aa  87  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  33.9 
 
 		 182 aa  87  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  33.53 
 
 		 237 aa  87.4  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  33.51 
 
 		 214 aa  86.3  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  30.3 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  35.57 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  32.89 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3701  YceI  32.58 
 
 		 187 aa  87  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  30.3 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  31.21 
 
 		 177 aa  85.9  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  31.91 
 
 		 186 aa  86.3  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  32.94 
 
 		 237 aa  85.9  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  29.52 
 
 		 195 aa  85.1  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  34.05 
 
 		 196 aa  85.1  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  33.33 
 
 		 178 aa  84.7  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  31.43 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  32.89 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  32.11 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  32.11 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  35.06 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  34.66 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  34.23 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>