More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2961 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2961  YceI family protein  100 
 
 		 198 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2551  YceI family protein  97.47 
 
 		 198 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.298445 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2717  signal peptide protein  87.88 
 
 		 198 aa  339  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.999831  normal  0.128957 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2953  hypothetical protein  66.33 
 
 		 196 aa  263  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0704  YceI family protein  65.28 
 
 		 193 aa  263  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  normal  0.494453 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2816  YceI  66.33 
 
 		 196 aa  258  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  63.68 
 
 		 189 aa  256  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3333  YceI  68.97 
 
 		 192 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2382  YceI-like family protein  69.19 
 
 		 187 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3377  YceI-like family protein  69.19 
 
 		 187 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1160  YceI-like family protein  69.19 
 
 		 192 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3367  hypothetical protein  69.19 
 
 		 192 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2568  hypothetical protein  69.19 
 
 		 192 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0298  hypothetical protein  69.19 
 
 		 192 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1273  YceI-like family protein  69.19 
 
 		 187 aa  250  8.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  62.5 
 
 		 192 aa  249  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0683  YceI family protein  68.57 
 
 		 193 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3995  hypothetical protein  62.5 
 
 		 189 aa  249  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645736  normal  0.347265 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0232  YceI  68.57 
 
 		 193 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0716  YceI family protein  68.57 
 
 		 193 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.943663  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3804  hypothetical protein  67.43 
 
 		 211 aa  247  8e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2669  YceI family protein  67.43 
 
 		 193 aa  247  9e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0607  YceI family protein  67.43 
 
 		 195 aa  246  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0631  YceI family protein  67.43 
 
 		 193 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7381  YceI  69.05 
 
 		 187 aa  243  9e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398085  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5860  YceI family protein  61.99 
 
 		 192 aa  235  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2066  hypothetical protein  59.88 
 
 		 192 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0648985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  47.45 
 
 		 196 aa  181  7e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1028  YceI family protein  48.26 
 
 		 191 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0457  YceI family protein  48.13 
 
 		 189 aa  170  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1463  putative signal peptide protein  51.01 
 
 		 151 aa  167  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.036668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3505  YceI family protein  47.93 
 
 		 191 aa  166  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.781833 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3578  YceI family protein  46.75 
 
 		 192 aa  161  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2226  YceI family protein  43.23 
 
 		 192 aa  158  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000678562  decreased coverage  0.00447323 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1519  YceI family protein  41.54 
 
 		 191 aa  154  6e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  45.58 
 
 		 189 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3508  periplasmic protein  41.28 
 
 		 196 aa  143  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.234261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  46.53 
 
 		 192 aa  141  7e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0469  YceI family protein  36.9 
 
 		 211 aa  139  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730302  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3509  hypothetical protein  39.88 
 
 		 198 aa  137  7e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.137598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  39.78 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3154  YceI  37.35 
 
 		 192 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0257242  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0912  YceI  36.9 
 
 		 188 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580537  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3736  YceI  36.31 
 
 		 218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.192641 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3992  YceI family protein  33.86 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2217  YceI family protein  32.09 
 
 		 199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1738  YceI family protein  34.03 
 
 		 188 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1536  YceI family protein  34.03 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1721  YceI family protein  34.03 
 
 		 188 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  39.13 
 
 		 201 aa  104  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0815  hypothetical protein  38.1 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  38.55 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  35.18 
 
 		 199 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1735  hypothetical protein  33.53 
 
 		 188 aa  101  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1799  hypothetical protein  33.53 
 
 		 188 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  34.78 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  37.43 
 
 		 205 aa  97.8  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  35.91 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  32.98 
 
 		 214 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0830  YceI  34.17 
 
 		 199 aa  97.1  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0387934  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  35.57 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0892  YceI family protein  35.45 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  33.93 
 
 		 197 aa  96.3  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  34.91 
 
 		 237 aa  96.3  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0806  YceI family protein  34.52 
 
 		 187 aa  96.3  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  33.93 
 
 		 197 aa  95.5  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  34.64 
 
 		 206 aa  95.9  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  34.12 
 
 		 210 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  34.32 
 
 		 237 aa  95.1  6e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  32.97 
 
 		 179 aa  94.7  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  37.33 
 
 		 196 aa  94.7  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0736  YceI family protein  34.52 
 
 		 187 aa  94.4  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.193865  normal  0.716983 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  33.33 
 
 		 196 aa  94  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  35.71 
 
 		 191 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  35.71 
 
 		 191 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  35.71 
 
 		 191 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  33.91 
 
 		 200 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  35.98 
 
 		 205 aa  92.4  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  35.2 
 
 		 191 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  34.32 
 
 		 201 aa  92.4  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  31.68 
 
 		 213 aa  91.7  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  31.68 
 
 		 213 aa  91.7  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  35.2 
 
 		 191 aa  91.7  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  32.77 
 
 		 197 aa  91.3  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  32.77 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  31.03 
 
 		 195 aa  89.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  34.69 
 
 		 192 aa  89.7  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  29.89 
 
 		 182 aa  89.4  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  36.53 
 
 		 254 aa  89  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  35.37 
 
 		 235 aa  88.6  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  33.53 
 
 		 201 aa  88.2  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  36.3 
 
 		 213 aa  88.2  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  36.49 
 
 		 182 aa  88.2  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0687  hypothetical protein  34.09 
 
 		 234 aa  87.8  9e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  34.69 
 
 		 191 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  34.69 
 
 		 191 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  34.69 
 
 		 191 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  34.69 
 
 		 191 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  33.53 
 
 		 182 aa  87.4  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  34.69 
 
 		 191 aa  87.8  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>