More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0457 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0457  YceI family protein  100 
 
 		 189 aa  388  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3578  YceI family protein  68.82 
 
 		 192 aa  266  8.999999999999999e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1028  YceI family protein  67.84 
 
 		 191 aa  256  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3508  periplasmic protein  67.25 
 
 		 196 aa  246  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.234261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3505  YceI family protein  63.53 
 
 		 191 aa  241  6e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.781833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2226  YceI family protein  57.07 
 
 		 192 aa  229  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000678562  decreased coverage  0.00447323 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0469  YceI family protein  52.91 
 
 		 211 aa  220  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730302  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3992  YceI family protein  48.68 
 
 		 188 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0704  YceI family protein  47.67 
 
 		 193 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  normal  0.494453 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  48.96 
 
 		 192 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0232  YceI  50.58 
 
 		 193 aa  168  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0716  YceI family protein  50.58 
 
 		 193 aa  168  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.943663  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0683  YceI family protein  50.58 
 
 		 193 aa  168  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2953  hypothetical protein  47.65 
 
 		 196 aa  167  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3995  hypothetical protein  45.74 
 
 		 189 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645736  normal  0.347265 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2669  YceI family protein  48.84 
 
 		 193 aa  165  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2551  YceI family protein  49.4 
 
 		 198 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.298445 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2816  YceI  44.32 
 
 		 196 aa  162  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0631  YceI family protein  49.42 
 
 		 193 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0607  YceI family protein  49.42 
 
 		 195 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2961  YceI family protein  48.81 
 
 		 198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2217  YceI family protein  45.83 
 
 		 199 aa  161  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3804  hypothetical protein  47.67 
 
 		 211 aa  160  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7381  YceI  47.95 
 
 		 187 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398085  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1273  YceI-like family protein  47.67 
 
 		 187 aa  157  8e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2382  YceI-like family protein  47.09 
 
 		 187 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3333  YceI  47.09 
 
 		 192 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3377  YceI-like family protein  47.09 
 
 		 187 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3367  hypothetical protein  47.09 
 
 		 192 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0298  hypothetical protein  47.09 
 
 		 192 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2568  hypothetical protein  47.09 
 
 		 192 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1160  YceI-like family protein  47.09 
 
 		 192 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5860  YceI family protein  46.47 
 
 		 192 aa  155  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1536  YceI family protein  41.8 
 
 		 191 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3509  hypothetical protein  43.03 
 
 		 198 aa  155  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.137598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1738  YceI family protein  41.8 
 
 		 188 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2066  hypothetical protein  44.77 
 
 		 192 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0648985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1721  YceI family protein  41.27 
 
 		 188 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  40.86 
 
 		 189 aa  149  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1735  hypothetical protein  42.11 
 
 		 188 aa  148  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282306  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2717  signal peptide protein  42.86 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.999831  normal  0.128957 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1799  hypothetical protein  41.76 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1150  periplasmic protein  41.88 
 
 		 206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.138125  normal  0.79265 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1519  YceI family protein  41.27 
 
 		 191 aa  140  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  40.43 
 
 		 196 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  42.86 
 
 		 192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  44.05 
 
 		 189 aa  137  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1782  YceI  39.15 
 
 		 204 aa  137  7.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0100028 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0912  YceI  36.51 
 
 		 188 aa  131  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580537  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3736  YceI  38.1 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.192641 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0815  hypothetical protein  41.78 
 
 		 197 aa  127  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0806  YceI family protein  40.62 
 
 		 187 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0830  YceI  39.05 
 
 		 199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0387934  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0736  YceI family protein  40 
 
 		 187 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.193865  normal  0.716983 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3154  YceI  35.79 
 
 		 192 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0257242  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0790  signal peptide protein  39.66 
 
 		 189 aa  118  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  38.14 
 
 		 199 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  39.46 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1463  putative signal peptide protein  36 
 
 		 151 aa  100  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.036668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  38.26 
 
 		 205 aa  98.2  7e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  34.91 
 
 		 237 aa  97.1  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  34.68 
 
 		 213 aa  96.7  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  34.68 
 
 		 213 aa  96.7  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  37.8 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  34.32 
 
 		 237 aa  95.9  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  34.91 
 
 		 216 aa  95.1  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  34.32 
 
 		 216 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  35.75 
 
 		 191 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  35.75 
 
 		 191 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  35.09 
 
 		 196 aa  92.8  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  35.23 
 
 		 191 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  35.23 
 
 		 191 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  35.23 
 
 		 191 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  35.23 
 
 		 191 aa  91.7  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  35.37 
 
 		 206 aa  92  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  36.24 
 
 		 202 aa  91.3  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  35.23 
 
 		 191 aa  91.3  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  37.75 
 
 		 213 aa  90.9  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  35.23 
 
 		 191 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  35.23 
 
 		 191 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  35.23 
 
 		 191 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  35.23 
 
 		 191 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  35.23 
 
 		 191 aa  90.9  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  35.23 
 
 		 191 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  32.07 
 
 		 197 aa  89.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  32.07 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  35.83 
 
 		 183 aa  89.7  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  34.72 
 
 		 191 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  33.53 
 
 		 254 aa  89.4  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4161  YceI family protein  34.32 
 
 		 211 aa  89  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1680  YceI family protein  31.82 
 
 		 200 aa  88.2  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  33.33 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  32.4 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  35.05 
 
 		 192 aa  87  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  29.94 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  34.5 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  30.86 
 
 		 207 aa  86.7  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  33.52 
 
 		 191 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  31.22 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  33.33 
 
 		 182 aa  85.1  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>