More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1859 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  100 
 
 
192 aa  387  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  74.7 
 
 
189 aa  264  5e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  56.54 
 
 
196 aa  231  7.000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1519  YceI family protein  56.22 
 
 
191 aa  217  6e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3154  YceI  42.49 
 
 
192 aa  168  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0257242  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3333  YceI  52.98 
 
 
192 aa  162  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3367  hypothetical protein  52.7 
 
 
192 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0298  hypothetical protein  52.7 
 
 
192 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1273  YceI-like family protein  53.38 
 
 
187 aa  159  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2568  hypothetical protein  52.7 
 
 
192 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1160  YceI-like family protein  52.7 
 
 
192 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  47.88 
 
 
189 aa  159  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2382  YceI-like family protein  52.7 
 
 
187 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3377  YceI-like family protein  52.7 
 
 
187 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2669  YceI family protein  52 
 
 
193 aa  158  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0704  YceI family protein  47.31 
 
 
193 aa  156  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  normal  0.494453 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3995  hypothetical protein  49.33 
 
 
189 aa  155  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645736  normal  0.347265 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0232  YceI  50 
 
 
193 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145864  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  46.63 
 
 
192 aa  153  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0683  YceI family protein  50 
 
 
193 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246292  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0716  YceI family protein  50 
 
 
193 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.943663  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0631  YceI family protein  50.67 
 
 
193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0607  YceI family protein  50.67 
 
 
195 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3804  hypothetical protein  49.33 
 
 
211 aa  150  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7381  YceI  50.69 
 
 
187 aa  149  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398085  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1028  YceI family protein  44.77 
 
 
191 aa  148  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2717  signal peptide protein  48.28 
 
 
198 aa  148  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.999831  normal  0.128957 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5860  YceI family protein  44.91 
 
 
192 aa  147  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2066  hypothetical protein  46.94 
 
 
192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0648985  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3505  YceI family protein  44.64 
 
 
191 aa  144  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.781833 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3508  periplasmic protein  40.59 
 
 
196 aa  143  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.234261  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0457  YceI family protein  42.55 
 
 
189 aa  143  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3578  YceI family protein  45.24 
 
 
192 aa  143  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728206  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  44.56 
 
 
201 aa  141  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2953  hypothetical protein  42.86 
 
 
196 aa  141  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386991  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2961  YceI family protein  46.85 
 
 
198 aa  140  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2551  YceI family protein  45.45 
 
 
198 aa  137  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.298445 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2226  YceI family protein  38.71 
 
 
192 aa  135  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000678562  decreased coverage  0.00447323 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2816  YceI  40.48 
 
 
196 aa  134  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0469  YceI family protein  34.05 
 
 
211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730302  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0892  YceI family protein  42.61 
 
 
193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3509  hypothetical protein  35.15 
 
 
198 aa  124  9e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.137598  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3736  YceI  33.33 
 
 
218 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.192641 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  40.12 
 
 
205 aa  123  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  38.01 
 
 
237 aa  122  5e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  42.6 
 
 
254 aa  122  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  37.29 
 
 
237 aa  121  6e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  36.69 
 
 
196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  39.23 
 
 
205 aa  119  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  36.65 
 
 
197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  36.65 
 
 
197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  41.46 
 
 
235 aa  118  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2217  YceI family protein  37.7 
 
 
199 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275332  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3992  YceI family protein  37.58 
 
 
188 aa  114  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0806  YceI family protein  35.36 
 
 
187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1401  YceI family protein  38.18 
 
 
190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  37.78 
 
 
202 aa  112  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0912  YceI  36.09 
 
 
188 aa  112  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580537  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0736  YceI family protein  34.24 
 
 
187 aa  111  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.193865  normal  0.716983 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2185  hypothetical protein  35.45 
 
 
194 aa  110  9e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1721  YceI family protein  37.72 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1047  YceI  35.12 
 
 
191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.151047 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  37.7 
 
 
214 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1536  YceI family protein  36.9 
 
 
191 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  34.95 
 
 
207 aa  109  3e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  34.55 
 
 
210 aa  109  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  42.59 
 
 
205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1738  YceI family protein  38.85 
 
 
188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  36.22 
 
 
199 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1735  hypothetical protein  39.04 
 
 
188 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282306  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  37.43 
 
 
201 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  34.41 
 
 
207 aa  107  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1799  hypothetical protein  39.72 
 
 
188 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0790  signal peptide protein  32.6 
 
 
189 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534784  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  37.21 
 
 
201 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  39.25 
 
 
183 aa  106  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  35.98 
 
 
206 aa  105  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0830  YceI  31.55 
 
 
199 aa  104  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0387934  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  37.08 
 
 
201 aa  104  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  35.19 
 
 
212 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1032  hypothetical protein  42.5 
 
 
132 aa  103  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.955101  normal  0.0986762 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  36.95 
 
 
201 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  31 
 
 
216 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  36.9 
 
 
182 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0815  hypothetical protein  32.14 
 
 
197 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  34.72 
 
 
195 aa  102  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  32.76 
 
 
206 aa  100  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  37.16 
 
 
201 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  34.39 
 
 
207 aa  100  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  30.1 
 
 
216 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  37.79 
 
 
182 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  37.79 
 
 
182 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  37.79 
 
 
182 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  36.96 
 
 
196 aa  99.4  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  35.19 
 
 
213 aa  98.6  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  34.07 
 
 
179 aa  99  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  34.57 
 
 
209 aa  98.2  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1463  putative signal peptide protein  38.67 
 
 
151 aa  97.8  8e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.036668  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  34.86 
 
 
213 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  35.19 
 
 
213 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>