More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1463 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1463  putative signal peptide protein  100 
 
 		 151 aa  313  4e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.036668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2551  YceI family protein  51.68 
 
 		 198 aa  169  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.298445 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2669  YceI family protein  55.03 
 
 		 193 aa  168  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2717  signal peptide protein  51.68 
 
 		 198 aa  168  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.999831  normal  0.128957 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2961  YceI family protein  51.01 
 
 		 198 aa  167  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2382  YceI-like family protein  52.35 
 
 		 187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3333  YceI  52.35 
 
 		 192 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3377  YceI-like family protein  52.35 
 
 		 187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2568  hypothetical protein  52.35 
 
 		 192 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7381  YceI  53.69 
 
 		 187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398085  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3804  hypothetical protein  53.69 
 
 		 211 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1273  YceI-like family protein  52.35 
 
 		 187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3367  hypothetical protein  52.35 
 
 		 192 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1160  YceI-like family protein  52.35 
 
 		 192 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0298  hypothetical protein  52.35 
 
 		 192 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0683  YceI family protein  53.02 
 
 		 193 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0232  YceI  53.02 
 
 		 193 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0716  YceI family protein  53.02 
 
 		 193 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.943663  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0631  YceI family protein  52.35 
 
 		 193 aa  159  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0607  YceI family protein  52.35 
 
 		 195 aa  159  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2066  hypothetical protein  48 
 
 		 192 aa  156  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0648985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  48.99 
 
 		 189 aa  155  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0704  YceI family protein  49.66 
 
 		 193 aa  155  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  normal  0.494453 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2953  hypothetical protein  50.34 
 
 		 196 aa  155  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5860  YceI family protein  47.33 
 
 		 192 aa  154  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2816  YceI  51.02 
 
 		 196 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  48.67 
 
 		 192 aa  149  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3995  hypothetical protein  46.98 
 
 		 189 aa  148  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645736  normal  0.347265 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  37.09 
 
 		 196 aa  105  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3578  YceI family protein  38 
 
 		 192 aa  105  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1028  YceI family protein  37.33 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3505  YceI family protein  39.74 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.781833 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  38.41 
 
 		 189 aa  104  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0457  YceI family protein  36 
 
 		 189 aa  100  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  38.67 
 
 		 192 aa  97.8  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0469  YceI family protein  35.06 
 
 		 211 aa  93.6  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730302  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3509  hypothetical protein  36.42 
 
 		 198 aa  93.6  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.137598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3508  periplasmic protein  35.62 
 
 		 196 aa  89.7  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.234261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3736  YceI  34.69 
 
 		 218 aa  88.2  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.192641 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2226  YceI family protein  35.1 
 
 		 192 aa  87.4  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000678562  decreased coverage  0.00447323 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1519  YceI family protein  33.56 
 
 		 191 aa  86.7  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1536  YceI family protein  30.66 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1738  YceI family protein  30.66 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1799  hypothetical protein  30.66 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1735  hypothetical protein  30.66 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1721  YceI family protein  29.93 
 
 		 188 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3154  YceI  34.11 
 
 		 192 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0257242  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  31.97 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0830  YceI  31.94 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0387934  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0912  YceI  33.33 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580537  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0815  hypothetical protein  30.71 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  30.46 
 
 		 237 aa  71.6  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  34.88 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  30.46 
 
 		 237 aa  71.2  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1782  YceI  25.97 
 
 		 204 aa  70.5  0.000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0100028 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2217  YceI family protein  31.11 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  33.08 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  31.82 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1032  hypothetical protein  34.51 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.955101  normal  0.0986762 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  28.39 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  28.39 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1150  periplasmic protein  27.81 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.138125  normal  0.79265 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  34 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  34.18 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  29.73 
 
 		 199 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3992  YceI family protein  27.89 
 
 		 188 aa  67  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  29.69 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  31.78 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  33.55 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  32.67 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8737  YceI  30.57 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  29.93 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  34.31 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  30.67 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  29.45 
 
 		 182 aa  63.9  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  33.85 
 
 		 183 aa  63.5  0.0000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1026  YceI family protein  29.94 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  29.25 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  31.13 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  30.2 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  32 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  31.41 
 
 		 214 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  33.33 
 
 		 178 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  28.95 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  34.58 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0009  YceI like family protein  33.04 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  32.28 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  32.24 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  35.2 
 
 		 181 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  31.01 
 
 		 177 aa  60.5  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  29.41 
 
 		 195 aa  60.5  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0892  YceI family protein  30.46 
 
 		 193 aa  60.1  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  28.91 
 
 		 202 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  26.85 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  29.41 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0268  hypothetical protein  31.3 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  30.57 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  28.48 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  29.69 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  33.97 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>