More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0268 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0268  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  480  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4157  YceI family protein  64.55 
 
 		 202 aa  258  5.0000000000000005e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8737  YceI  40.34 
 
 		 194 aa  125  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  39.2 
 
 		 182 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  39.2 
 
 		 182 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  39.2 
 
 		 182 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  39.89 
 
 		 186 aa  122  5e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  41.62 
 
 		 181 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  39.41 
 
 		 183 aa  117  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  37.57 
 
 		 182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  38.51 
 
 		 183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  35.52 
 
 		 183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  38.76 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  38.59 
 
 		 197 aa  113  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  35.83 
 
 		 187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  37.93 
 
 		 181 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  33.85 
 
 		 219 aa  112  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  38.04 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  37.71 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  36.93 
 
 		 181 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  37.36 
 
 		 178 aa  108  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  36.07 
 
 		 182 aa  108  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  39.44 
 
 		 182 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3514  YceI family protein  32.7 
 
 		 285 aa  108  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0872  YceI family protein  34.48 
 
 		 180 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467624  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  34.25 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  37.14 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24290  hypothetical protein  35.23 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0570577  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  36.42 
 
 		 182 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  34.64 
 
 		 181 aa  105  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  35.71 
 
 		 214 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  32.57 
 
 		 182 aa  105  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  37.36 
 
 		 183 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  33.72 
 
 		 181 aa  104  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  36.21 
 
 		 183 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  36.99 
 
 		 182 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  34.44 
 
 		 200 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  33.14 
 
 		 180 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4591  YceI family protein  29.63 
 
 		 190 aa  101  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  34.88 
 
 		 183 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0195  YceI family protein  34.86 
 
 		 187 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  36.99 
 
 		 195 aa  101  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7583  YceI-like family protein  36.61 
 
 		 202 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.94246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  34.39 
 
 		 189 aa  99.8  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  34.1 
 
 		 181 aa  99.8  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  35.36 
 
 		 188 aa  99.4  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  35 
 
 		 201 aa  99  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  36.63 
 
 		 182 aa  98.6  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1264  YceI family protein  33.53 
 
 		 185 aa  98.2  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  37.24 
 
 		 196 aa  97.8  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2737  YceI family protein  33.33 
 
 		 181 aa  98.2  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0292655  normal  0.091865 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  33.33 
 
 		 182 aa  96.7  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  33.33 
 
 		 201 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  33.33 
 
 		 182 aa  96.7  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  35.26 
 
 		 177 aa  96.7  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  36.11 
 
 		 198 aa  96.3  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  32.39 
 
 		 213 aa  95.9  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  32.37 
 
 		 209 aa  96.3  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  32.39 
 
 		 213 aa  95.9  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  34.05 
 
 		 187 aa  95.9  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  37.36 
 
 		 186 aa  95.9  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1380  YceI family protein  30.94 
 
 		 187 aa  95.9  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181422  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2875  hypothetical protein  37.06 
 
 		 191 aa  95.9  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367031  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  36.52 
 
 		 196 aa  95.1  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  32.78 
 
 		 201 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  33.33 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  37.06 
 
 		 192 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  36.24 
 
 		 179 aa  94.7  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  36.36 
 
 		 192 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  32.16 
 
 		 193 aa  94  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  39.6 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7029  YceI family protein  31.43 
 
 		 183 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  36.36 
 
 		 192 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  36.36 
 
 		 204 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  37.76 
 
 		 192 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  37.76 
 
 		 192 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  34.72 
 
 		 212 aa  93.6  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  31.61 
 
 		 196 aa  93.6  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  32.56 
 
 		 184 aa  92.8  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  34.32 
 
 		 178 aa  92.8  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4058  YceI family protein  33.14 
 
 		 176 aa  92.4  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.675999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  35.12 
 
 		 189 aa  92.4  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  33.88 
 
 		 201 aa  92.4  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  32.63 
 
 		 216 aa  92  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3033  YceI family protein  32.54 
 
 		 224 aa  92  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0441  YceI family protein  33.71 
 
 		 183 aa  92  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.886129  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  32.14 
 
 		 195 aa  92  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1121  hypothetical protein  38.46 
 
 		 177 aa  91.7  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000345646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3198  hypothetical protein  33.94 
 
 		 191 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0518  YceI family protein  31.25 
 
 		 181 aa  91.3  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000120674  hitchhiker  0.000476131 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  30 
 
 		 205 aa  91.3  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3701  YceI  33.52 
 
 		 187 aa  91.3  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3055  hypothetical protein  33.94 
 
 		 191 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0011163  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1323  hypothetical protein  33.94 
 
 		 191 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00141701  normal  0.012746 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  33.91 
 
 		 199 aa  90.5  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  32.24 
 
 		 201 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  33.56 
 
 		 189 aa  89.7  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2885  YceI family protein  33.83 
 
 		 229 aa  89.4  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.265419  normal  0.0897618 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  34.64 
 
 		 216 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1179  hypothetical protein  32.73 
 
 		 191 aa  89  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000115477  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>