More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0366 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  100 
 
 		 189 aa  384  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  56.77 
 
 		 199 aa  228  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  53.65 
 
 		 193 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  52.38 
 
 		 190 aa  208  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0564  hypothetical protein  53.25 
 
 		 174 aa  186  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0475935  normal  0.512882 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  49.14 
 
 		 189 aa  176  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  43.86 
 
 		 175 aa  144  8.000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  44.05 
 
 		 182 aa  143  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  40.64 
 
 		 214 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  43.68 
 
 		 177 aa  139  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  40.94 
 
 		 177 aa  138  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  38.6 
 
 		 182 aa  135  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  43.26 
 
 		 201 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0067  YceI family protein  42.86 
 
 		 171 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  43.6 
 
 		 174 aa  134  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  44.12 
 
 		 201 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  43.02 
 
 		 201 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  43.53 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  42.44 
 
 		 183 aa  132  3e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  46.53 
 
 		 223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  43.45 
 
 		 204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  41.01 
 
 		 196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3656  YceI family protein  39.53 
 
 		 180 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0464334  normal  0.0393691 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  43.06 
 
 		 183 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  42.36 
 
 		 183 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  38.01 
 
 		 182 aa  127  7.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  40.97 
 
 		 182 aa  127  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  41.9 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  42.36 
 
 		 183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2505  YceI family protein  36.99 
 
 		 179 aa  125  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0958427 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  38.95 
 
 		 175 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  35.67 
 
 		 182 aa  124  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  41.67 
 
 		 175 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  37.21 
 
 		 188 aa  124  8.000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4058  YceI family protein  40.94 
 
 		 176 aa  123  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.675999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  35.67 
 
 		 177 aa  122  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  39.46 
 
 		 212 aa  122  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  38.82 
 
 		 200 aa  121  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  41.67 
 
 		 182 aa  121  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  38.07 
 
 		 187 aa  120  8e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  41.67 
 
 		 182 aa  120  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0469  hypothetical protein  37.23 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.189395  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  44.44 
 
 		 198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4627  YceI family protein  38.73 
 
 		 175 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  36.69 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  36.63 
 
 		 187 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  40.28 
 
 		 183 aa  118  4.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  38.95 
 
 		 191 aa  117  7e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  38.95 
 
 		 191 aa  117  7e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  38.95 
 
 		 191 aa  117  7e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  38.95 
 
 		 191 aa  117  7e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  38.95 
 
 		 191 aa  117  7e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  40.99 
 
 		 201 aa  117  7e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  38.95 
 
 		 191 aa  117  7e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  38.95 
 
 		 191 aa  117  7e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  38.95 
 
 		 191 aa  117  7e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  40.85 
 
 		 177 aa  117  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1536  hypothetical protein  36.61 
 
 		 190 aa  117  9e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  36.6 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  38.95 
 
 		 191 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  37.16 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  39.23 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  36.9 
 
 		 180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  38.67 
 
 		 197 aa  115  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  38.2 
 
 		 237 aa  115  3e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  38.6 
 
 		 237 aa  115  3e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  34.36 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  38.95 
 
 		 181 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  38.1 
 
 		 186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0443  hypothetical protein  36.17 
 
 		 190 aa  114  6.9999999999999995e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  37.79 
 
 		 191 aa  114  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  37.79 
 
 		 191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  38.95 
 
 		 181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  37.79 
 
 		 191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  37.79 
 
 		 191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  37.79 
 
 		 191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  36.63 
 
 		 195 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  35.81 
 
 		 178 aa  112  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0727  conserved hypothetical protein, YceI family  32.8 
 
 		 190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0212414  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  39.76 
 
 		 254 aa  112  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  37.32 
 
 		 187 aa  112  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  33.16 
 
 		 213 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  36.05 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_003296  RS03182  signal peptide protein  33.13 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  35.54 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  33.33 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2685  YceI family protein  35.84 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2032  YceI  38.95 
 
 		 192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.267829  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  35.26 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8737  YceI  35.58 
 
 		 194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  35.86 
 
 		 195 aa  109  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1334  YceI  37.2 
 
 		 189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000025527  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  38.32 
 
 		 183 aa  108  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  37.8 
 
 		 181 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  38.36 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  34.48 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  33.15 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3514  YceI family protein  38.19 
 
 		 285 aa  106  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  34.73 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2768  hypothetical protein  38.62 
 
 		 171 aa  106  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000157098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>