More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2217 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2217  YceI family protein  100 
 
 		 199 aa  411  1e-114  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1536  YceI family protein  50 
 
 		 191 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3992  YceI family protein  50.81 
 
 		 188 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1721  YceI family protein  50.83 
 
 		 188 aa  191  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1738  YceI family protein  50.83 
 
 		 188 aa  191  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1735  hypothetical protein  51.48 
 
 		 188 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1799  hypothetical protein  50.9 
 
 		 188 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1150  periplasmic protein  46.89 
 
 		 206 aa  175  5e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.138125  normal  0.79265 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1782  YceI  44.09 
 
 		 204 aa  174  6e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0100028 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2226  YceI family protein  49.16 
 
 		 192 aa  173  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000678562  decreased coverage  0.00447323 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3578  YceI family protein  48.48 
 
 		 192 aa  162  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0457  YceI family protein  45.83 
 
 		 189 aa  161  6e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1028  YceI family protein  44.81 
 
 		 191 aa  159  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3508  periplasmic protein  48.21 
 
 		 196 aa  159  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.234261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3505  YceI family protein  45.45 
 
 		 191 aa  155  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.781833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0469  YceI family protein  44.24 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730302  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3509  hypothetical protein  38.69 
 
 		 198 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.137598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3736  YceI  35.09 
 
 		 218 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.192641 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2717  signal peptide protein  36.09 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.999831  normal  0.128957 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  38.59 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  38.04 
 
 		 192 aa  111  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0704  YceI family protein  35.75 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  normal  0.494453 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  35.64 
 
 		 192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  35.96 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3995  hypothetical protein  35.84 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645736  normal  0.347265 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2669  YceI family protein  36.42 
 
 		 193 aa  105  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2551  YceI family protein  34.32 
 
 		 198 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.298445 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2961  YceI family protein  33.73 
 
 		 198 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  33.16 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2816  YceI  34.91 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2953  hypothetical protein  35.12 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2066  hypothetical protein  36.42 
 
 		 192 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0648985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5860  YceI family protein  36.42 
 
 		 192 aa  101  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  31.22 
 
 		 196 aa  101  8e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  32.63 
 
 		 207 aa  101  8e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  35.58 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0830  YceI  31.52 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0387934  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3333  YceI  35.06 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1273  YceI-like family protein  36.09 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2382  YceI-like family protein  35.5 
 
 		 187 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3377  YceI-like family protein  35.5 
 
 		 187 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3804  hypothetical protein  35.26 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0683  YceI family protein  35.26 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2568  hypothetical protein  35.5 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3367  hypothetical protein  35.5 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0232  YceI  35.26 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145864  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1519  YceI family protein  32.29 
 
 		 191 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0716  YceI family protein  35.26 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.943663  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1160  YceI-like family protein  35.5 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0298  hypothetical protein  35.5 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0631  YceI family protein  35.26 
 
 		 193 aa  99  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0607  YceI family protein  35.26 
 
 		 195 aa  98.6  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7381  YceI  35.98 
 
 		 187 aa  98.2  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398085  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  35.09 
 
 		 213 aa  97.4  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  35.09 
 
 		 213 aa  97.4  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  36.24 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0790  signal peptide protein  31.84 
 
 		 189 aa  96.7  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  33.51 
 
 		 179 aa  95.1  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  33.92 
 
 		 254 aa  95.1  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3154  YceI  31.02 
 
 		 192 aa  94  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0257242  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2451  YceI family protein  31.31 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  31.61 
 
 		 237 aa  92.8  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  31.61 
 
 		 237 aa  92.4  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  34.15 
 
 		 235 aa  92.4  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  35.5 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0736  YceI family protein  28.65 
 
 		 187 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.193865  normal  0.716983 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0806  YceI family protein  29.94 
 
 		 187 aa  89.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0815  hypothetical protein  26.67 
 
 		 197 aa  89.4  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0912  YceI  31.18 
 
 		 188 aa  88.6  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580537  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  30.06 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1680  YceI family protein  32.58 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0892  YceI family protein  31.15 
 
 		 193 aa  86.3  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  35.95 
 
 		 205 aa  85.9  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  37.22 
 
 		 201 aa  84.7  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  34.08 
 
 		 201 aa  84.7  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  32.16 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  30.26 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  31.71 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0765  YceI family protein  32.07 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  35.81 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  29.34 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  32.74 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  33.52 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  35.63 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  34.27 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  31.94 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  31.29 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  30.86 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  35.26 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  39.07 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  39.07 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  32.54 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4161  YceI family protein  32.14 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  32.74 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  29.8 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  33.14 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  39.07 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  31.1 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  32.78 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  31.68 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>