More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0736 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0736  YceI family protein  100 
 
 		 187 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.193865  normal  0.716983 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0806  YceI family protein  95.19 
 
 		 187 aa  366  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0790  signal peptide protein  78.07 
 
 		 189 aa  304  4.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0830  YceI  64.29 
 
 		 199 aa  216  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0387934  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0815  hypothetical protein  61.68 
 
 		 197 aa  216  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3508  periplasmic protein  41.86 
 
 		 196 aa  135  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.234261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1028  YceI family protein  45.33 
 
 		 191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0457  YceI family protein  40 
 
 		 189 aa  125  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3578  YceI family protein  40.94 
 
 		 192 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3992  YceI family protein  34.74 
 
 		 188 aa  111  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3505  YceI family protein  40.82 
 
 		 191 aa  111  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.781833 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1519  YceI family protein  31.89 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0469  YceI family protein  37.79 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730302  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2226  YceI family protein  37.31 
 
 		 192 aa  107  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000678562  decreased coverage  0.00447323 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  35.71 
 
 		 189 aa  107  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  36.7 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3154  YceI  35.14 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0257242  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3736  YceI  36.09 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.192641 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  33.94 
 
 		 192 aa  104  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  38.2 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0912  YceI  29.95 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580537  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  29.63 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3509  hypothetical protein  34.15 
 
 		 198 aa  96.3  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.137598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1721  YceI family protein  33.7 
 
 		 188 aa  95.9  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1738  YceI family protein  34.24 
 
 		 188 aa  95.9  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1799  hypothetical protein  34.34 
 
 		 188 aa  95.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1536  YceI family protein  33.7 
 
 		 191 aa  94.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  34.3 
 
 		 205 aa  94.4  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  31.02 
 
 		 179 aa  94.4  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1735  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  35.15 
 
 		 213 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  32.35 
 
 		 237 aa  92.4  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  31.76 
 
 		 237 aa  91.3  8e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2217  YceI family protein  28.65 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  35.62 
 
 		 192 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0704  YceI family protein  34.03 
 
 		 193 aa  89.4  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  normal  0.494453 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  30.58 
 
 		 213 aa  89  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  30.58 
 
 		 213 aa  89  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0631  YceI family protein  38.71 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0232  YceI  38.06 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145864  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0607  YceI family protein  38.71 
 
 		 195 aa  87  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0716  YceI family protein  38.06 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.943663  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0683  YceI family protein  38.06 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2961  YceI family protein  34.69 
 
 		 198 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3995  hypothetical protein  35.4 
 
 		 189 aa  85.9  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645736  normal  0.347265 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1334  YceI  32.6 
 
 		 189 aa  85.1  6e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000025527  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  33.73 
 
 		 189 aa  84.3  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  30.18 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3804  hypothetical protein  37.42 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  32.95 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  30.18 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  36.27 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2551  YceI family protein  33.33 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.298445 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7381  YceI  37.58 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398085  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  34.03 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  33.94 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5860  YceI family protein  34.21 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2717  signal peptide protein  32.65 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.999831  normal  0.128957 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0890  YceI  29.71 
 
 		 220 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2066  hypothetical protein  33.56 
 
 		 192 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0648985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  29.31 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2669  YceI family protein  36.13 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1782  YceI  26.06 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0100028 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  33.33 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  30.95 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2953  hypothetical protein  31.14 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  34.12 
 
 		 196 aa  77.8  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1273  YceI-like family protein  35.76 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  33.53 
 
 		 180 aa  77.8  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  29.26 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3333  YceI  34.84 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  33.15 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  33.73 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  32.94 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  30.3 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  32.53 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2382  YceI-like family protein  35.1 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1150  periplasmic protein  26.98 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.138125  normal  0.79265 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3377  YceI-like family protein  35.1 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1513  YceI-like family protein  32.14 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.137036  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2568  hypothetical protein  35.1 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3367  hypothetical protein  35.1 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  32.75 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1160  YceI-like family protein  35.1 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  28.48 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  29.84 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0298  hypothetical protein  35.1 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  35.07 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4161  YceI family protein  32.16 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  30.11 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0007  YceI like family protein  31.55 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  31.48 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0008  YceI like family protein  31.55 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  28.57 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1154  putative lipoprotein  31.55 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0009  putative lipoprotein  31.55 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.686573  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1434  YceI like family protein  31.55 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.311091  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  33.69 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0008  putative lipoprotein  31.55 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  32.61 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>