More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_3333 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_3333  YceI  100 
 
 
192 aa  396  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3367  hypothetical protein  99.48 
 
 
192 aa  394  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1160  YceI-like family protein  99.48 
 
 
192 aa  394  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2568  hypothetical protein  99.48 
 
 
192 aa  394  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0298  hypothetical protein  99.48 
 
 
192 aa  394  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2382  YceI-like family protein  99.47 
 
 
187 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3377  YceI-like family protein  99.47 
 
 
187 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1273  YceI-like family protein  98.4 
 
 
187 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2669  YceI family protein  88.02 
 
 
193 aa  335  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0683  YceI family protein  86.98 
 
 
193 aa  325  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246292  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0232  YceI  86.98 
 
 
193 aa  325  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0716  YceI family protein  86.98 
 
 
193 aa  325  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.943663  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0631  YceI family protein  86.98 
 
 
193 aa  323  8.000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0607  YceI family protein  87.43 
 
 
195 aa  323  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3804  hypothetical protein  84.38 
 
 
211 aa  316  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7381  YceI  88.02 
 
 
187 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398085  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0704  YceI family protein  69.43 
 
 
193 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  normal  0.494453 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  69.95 
 
 
192 aa  276  9e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3995  hypothetical protein  67.2 
 
 
189 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645736  normal  0.347265 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  67.02 
 
 
189 aa  262  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2066  hypothetical protein  66.84 
 
 
192 aa  256  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0648985  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5860  YceI family protein  68.91 
 
 
192 aa  256  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2717  signal peptide protein  68.82 
 
 
198 aa  247  7e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.999831  normal  0.128957 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2961  YceI family protein  68.45 
 
 
198 aa  243  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2551  YceI family protein  67.26 
 
 
198 aa  239  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.298445 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2953  hypothetical protein  62.5 
 
 
196 aa  223  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386991  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2816  YceI  60.69 
 
 
196 aa  220  9e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1028  YceI family protein  51.45 
 
 
191 aa  181  8.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3505  YceI family protein  50.3 
 
 
191 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.781833 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3578  YceI family protein  49.11 
 
 
192 aa  169  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728206  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  45.6 
 
 
196 aa  167  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1463  putative signal peptide protein  52.35 
 
 
151 aa  162  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.036668  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0457  YceI family protein  45.88 
 
 
189 aa  160  8.000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2226  YceI family protein  43.62 
 
 
192 aa  160  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000678562  decreased coverage  0.00447323 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  52.08 
 
 
192 aa  153  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  49.66 
 
 
189 aa  153  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1519  YceI family protein  41.76 
 
 
191 aa  144  6e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3508  periplasmic protein  44.51 
 
 
196 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.234261  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0469  YceI family protein  39.88 
 
 
211 aa  141  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730302  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  46.67 
 
 
201 aa  131  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3154  YceI  40.35 
 
 
192 aa  127  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0257242  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  45.56 
 
 
205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3509  hypothetical protein  37.35 
 
 
198 aa  123  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.137598  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1536  YceI family protein  36.96 
 
 
191 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1738  YceI family protein  36.96 
 
 
188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1721  YceI family protein  36.96 
 
 
188 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3736  YceI  36.69 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.192641 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1735  hypothetical protein  37.93 
 
 
188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282306  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1799  hypothetical protein  37.72 
 
 
188 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3992  YceI family protein  36.26 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  40.27 
 
 
205 aa  109  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  39.13 
 
 
205 aa  108  6e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  39.66 
 
 
237 aa  106  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  39.08 
 
 
237 aa  105  4e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  40 
 
 
196 aa  105  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2217  YceI family protein  35.26 
 
 
199 aa  104  7e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275332  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  38.51 
 
 
200 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0892  YceI family protein  39.77 
 
 
193 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  40.12 
 
 
196 aa  102  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  36.87 
 
 
199 aa  101  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  35.2 
 
 
193 aa  99  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  35.47 
 
 
213 aa  98.6  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  35.47 
 
 
213 aa  98.6  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  36.99 
 
 
214 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  35.22 
 
 
207 aa  96.7  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  39.61 
 
 
213 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  33.54 
 
 
212 aa  95.9  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  37.91 
 
 
202 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  37.33 
 
 
195 aa  94.7  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  37.35 
 
 
198 aa  93.6  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  37.06 
 
 
235 aa  94.4  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  38.73 
 
 
254 aa  94  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  37.91 
 
 
206 aa  94  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  36.76 
 
 
201 aa  93.2  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  35.76 
 
 
197 aa  93.6  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  35.19 
 
 
207 aa  93.6  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3229  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  93.2  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.474421  normal  0.780413 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0976  YceI  40.85 
 
 
213 aa  92.8  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1334  YceI  40.44 
 
 
189 aa  93.2  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000025527  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  38.33 
 
 
182 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  38.33 
 
 
182 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  33.54 
 
 
210 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  38.33 
 
 
182 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  38.82 
 
 
177 aa  91.7  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  37.21 
 
 
182 aa  90.9  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  34.81 
 
 
201 aa  90.5  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  34.15 
 
 
197 aa  90.9  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  38.71 
 
 
201 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  36.31 
 
 
216 aa  90.5  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  34.34 
 
 
178 aa  90.9  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  31.74 
 
 
195 aa  90.5  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  35.62 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  37.33 
 
 
183 aa  89.7  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  37.02 
 
 
201 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0912  YceI  34.46 
 
 
188 aa  90.5  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580537  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0815  hypothetical protein  35.37 
 
 
197 aa  90.1  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  36.54 
 
 
197 aa  90.1  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  36.54 
 
 
197 aa  90.1  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  35.52 
 
 
206 aa  90.1  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0830  YceI  35.57 
 
 
199 aa  89.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0387934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>