293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1782 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1782  YceI  100 
 
 		 204 aa  420  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0100028 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1150  periplasmic protein  83.5 
 
 		 206 aa  352  2.9999999999999997e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.138125  normal  0.79265 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2217  YceI family protein  44.09 
 
 		 199 aa  174  6e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3992  YceI family protein  44.44 
 
 		 188 aa  167  7e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1536  YceI family protein  40.96 
 
 		 191 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1738  YceI family protein  40.96 
 
 		 188 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1721  YceI family protein  40.96 
 
 		 188 aa  157  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1735  hypothetical protein  40.91 
 
 		 188 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1799  hypothetical protein  41.62 
 
 		 188 aa  154  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0457  YceI family protein  39.15 
 
 		 189 aa  137  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1028  YceI family protein  38.37 
 
 		 191 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3505  YceI family protein  37.21 
 
 		 191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.781833 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3578  YceI family protein  38.37 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2226  YceI family protein  36.07 
 
 		 192 aa  122  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000678562  decreased coverage  0.00447323 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3508  periplasmic protein  36.99 
 
 		 196 aa  121  8e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.234261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0469  YceI family protein  35.5 
 
 		 211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730302  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0815  hypothetical protein  31.58 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0830  YceI  32.35 
 
 		 199 aa  101  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0387934  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1519  YceI family protein  33.33 
 
 		 191 aa  101  9e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  34.38 
 
 		 189 aa  97.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  31.35 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3154  YceI  31.05 
 
 		 192 aa  96.3  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0257242  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3736  YceI  32.95 
 
 		 218 aa  95.5  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.192641 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2953  hypothetical protein  31.21 
 
 		 196 aa  95.1  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2066  hypothetical protein  31.07 
 
 		 192 aa  94.7  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0648985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3509  hypothetical protein  28.99 
 
 		 198 aa  94.7  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.137598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5860  YceI family protein  30.46 
 
 		 192 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  31.77 
 
 		 196 aa  93.2  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  28.8 
 
 		 189 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0704  YceI family protein  28.87 
 
 		 193 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  normal  0.494453 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  30.95 
 
 		 192 aa  88.6  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0912  YceI  29.19 
 
 		 188 aa  88.2  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580537  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3995  hypothetical protein  27.98 
 
 		 189 aa  85.5  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645736  normal  0.347265 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2816  YceI  29.55 
 
 		 196 aa  85.1  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  32.48 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2717  signal peptide protein  27.91 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.999831  normal  0.128957 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  32.53 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7381  YceI  29.31 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398085  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0806  YceI family protein  26.6 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2669  YceI family protein  30.73 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0736  YceI family protein  26.06 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.193865  normal  0.716983 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3804  hypothetical protein  30.17 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1273  YceI-like family protein  29.89 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  31.61 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3367  hypothetical protein  29.48 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2382  YceI-like family protein  29.31 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3333  YceI  29.48 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3377  YceI-like family protein  29.31 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0631  YceI family protein  30.73 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2568  hypothetical protein  29.48 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0232  YceI  30.73 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145864  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0298  hypothetical protein  29.48 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1160  YceI-like family protein  29.48 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0716  YceI family protein  30.73 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.943663  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0683  YceI family protein  30.73 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0607  YceI family protein  30.73 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  31.82 
 
 		 213 aa  77.8  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2551  YceI family protein  27.33 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.298445 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  32.2 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  30.41 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3297  hypothetical protein  31.82 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.019174  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  32.26 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2961  YceI family protein  26.74 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  32.74 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  27.81 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0790  signal peptide protein  25.81 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1401  YceI family protein  28.49 
 
 		 190 aa  72  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  28.65 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  25.95 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2451  YceI family protein  26.44 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1463  putative signal peptide protein  25.97 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.036668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  30.37 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  28.25 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  27.22 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  25.41 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  27.75 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0892  YceI family protein  28.42 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  27.22 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0834  YceI family protein  29.05 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.929023  hitchhiker  0.00225936 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  28.25 
 
 		 183 aa  67  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  29.68 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  33.33 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1032  hypothetical protein  31.93 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.955101  normal  0.0986762 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  25.57 
 
 		 182 aa  64.7  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  27.32 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  28.25 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  27.12 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  26.67 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  26.67 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  26.67 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  29.03 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4591  YceI family protein  29.19 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0604  YceI family protein  26.63 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  27.17 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  29.94 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1047  YceI  29.41 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151047 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  29.24 
 
 		 254 aa  62  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>