More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3154 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3154  YceI  100 
 
 		 192 aa  394  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0257242  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  43.78 
 
 		 196 aa  174  6e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1519  YceI family protein  43.09 
 
 		 191 aa  174  8e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  44.79 
 
 		 189 aa  160  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  43.71 
 
 		 192 aa  159  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  40.48 
 
 		 189 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3995  hypothetical protein  36.17 
 
 		 189 aa  136  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645736  normal  0.347265 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3736  YceI  40.49 
 
 		 218 aa  134  7.000000000000001e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.192641 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2669  YceI family protein  43.79 
 
 		 193 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0631  YceI family protein  43.79 
 
 		 193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0607  YceI family protein  43.79 
 
 		 195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0232  YceI  43.14 
 
 		 193 aa  131  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145864  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0683  YceI family protein  43.14 
 
 		 193 aa  131  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0716  YceI family protein  43.14 
 
 		 193 aa  131  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.943663  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3804  hypothetical protein  43.14 
 
 		 211 aa  131  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0704  YceI family protein  35.38 
 
 		 193 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  normal  0.494453 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3578  YceI family protein  41.67 
 
 		 192 aa  130  7.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7381  YceI  43.15 
 
 		 187 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398085  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3508  periplasmic protein  40.36 
 
 		 196 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.234261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3333  YceI  42.11 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1028  YceI family protein  42.07 
 
 		 191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1273  YceI-like family protein  42 
 
 		 187 aa  125  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2382  YceI-like family protein  42 
 
 		 187 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1160  YceI-like family protein  42 
 
 		 192 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3377  YceI-like family protein  42 
 
 		 187 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3367  hypothetical protein  42 
 
 		 192 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2568  hypothetical protein  42 
 
 		 192 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0298  hypothetical protein  42 
 
 		 192 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  34.69 
 
 		 192 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2816  YceI  37.85 
 
 		 196 aa  121  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2066  hypothetical protein  37.78 
 
 		 192 aa  120  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0648985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5860  YceI family protein  36.99 
 
 		 192 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2953  hypothetical protein  36.31 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0457  YceI family protein  35.79 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3509  hypothetical protein  35.93 
 
 		 198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.137598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  38.95 
 
 		 196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  38.41 
 
 		 237 aa  118  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  36.53 
 
 		 254 aa  118  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  38.18 
 
 		 237 aa  118  6e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2717  signal peptide protein  35.88 
 
 		 198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.999831  normal  0.128957 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0912  YceI  32.63 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580537  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  36.97 
 
 		 235 aa  115  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3505  YceI family protein  38.62 
 
 		 191 aa  115  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.781833 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2961  YceI family protein  38.36 
 
 		 198 aa  115  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0892  YceI family protein  38.46 
 
 		 193 aa  115  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1401  YceI family protein  37.72 
 
 		 190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  37.04 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  39.51 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3992  YceI family protein  33.16 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0806  YceI family protein  36.76 
 
 		 187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0815  hypothetical protein  37.72 
 
 		 197 aa  112  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2551  YceI family protein  36.99 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.298445 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0830  YceI  37.5 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0387934  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2226  YceI family protein  35.42 
 
 		 192 aa  108  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000678562  decreased coverage  0.00447323 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0469  YceI family protein  35.42 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730302  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0736  YceI family protein  35.14 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.193865  normal  0.716983 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  38.27 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  35.58 
 
 		 205 aa  106  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1738  YceI family protein  33.68 
 
 		 188 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1536  YceI family protein  33.16 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  33.33 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0790  signal peptide protein  33.68 
 
 		 189 aa  102  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1721  YceI family protein  32.63 
 
 		 188 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1047  YceI  34.55 
 
 		 191 aa  101  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151047 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  35.15 
 
 		 199 aa  101  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1799  hypothetical protein  32.54 
 
 		 188 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1735  hypothetical protein  31.98 
 
 		 188 aa  98.6  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282306  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03182  signal peptide protein  34.13 
 
 		 195 aa  97.1  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1782  YceI  31.05 
 
 		 204 aa  96.3  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0100028 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  33.54 
 
 		 207 aa  95.9  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  42.11 
 
 		 195 aa  95.1  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  33.33 
 
 		 197 aa  94.7  8e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  34.9 
 
 		 193 aa  94.4  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2217  YceI family protein  31.02 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275332  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  33.33 
 
 		 197 aa  94.4  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  34.38 
 
 		 213 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  35.03 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  31.64 
 
 		 207 aa  92.4  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1150  periplasmic protein  27.55 
 
 		 206 aa  91.3  7e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.138125  normal  0.79265 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  36.14 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2185  hypothetical protein  31.25 
 
 		 194 aa  90.9  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  32.94 
 
 		 216 aa  90.1  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  31.1 
 
 		 210 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0890  YceI  28.82 
 
 		 220 aa  89  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  31.76 
 
 		 207 aa  89  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  33.33 
 
 		 205 aa  88.6  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  36.67 
 
 		 182 aa  88.2  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  32.74 
 
 		 216 aa  88.2  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  35.67 
 
 		 201 aa  87.8  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4023  YceI family protein  33.72 
 
 		 242 aa  87.8  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  29.89 
 
 		 179 aa  87.8  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4488  YceI family protein  34.68 
 
 		 252 aa  86.3  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.644863  normal  0.336697 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  34.15 
 
 		 212 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  34.9 
 
 		 195 aa  86.3  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  34.39 
 
 		 201 aa  85.1  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2032  YceI  34.12 
 
 		 192 aa  85.5  5e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.267829  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  33.68 
 
 		 191 aa  85.1  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  33.12 
 
 		 212 aa  85.1  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  33.68 
 
 		 191 aa  85.1  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  33.68 
 
 		 191 aa  85.1  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>