More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03182 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03182  signal peptide protein  100 
 
 		 195 aa  395  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  39.78 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  37.5 
 
 		 177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  36.36 
 
 		 180 aa  115  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  33.87 
 
 		 189 aa  115  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  37.06 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  35.52 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  37.43 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  35 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0564  hypothetical protein  32.73 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0475935  normal  0.512882 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  34.88 
 
 		 182 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  35.62 
 
 		 206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  33.52 
 
 		 207 aa  108  5e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  35.03 
 
 		 182 aa  108  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  33.88 
 
 		 182 aa  108  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  35.52 
 
 		 179 aa  107  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  35.26 
 
 		 195 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  34.97 
 
 		 196 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  33.12 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  34.22 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  37.1 
 
 		 192 aa  105  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  33.71 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  37.1 
 
 		 192 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  37.1 
 
 		 192 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  35.06 
 
 		 197 aa  104  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  33.33 
 
 		 214 aa  104  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1380  YceI family protein  33.15 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181422  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3154  YceI  34.57 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0257242  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  32.04 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  35.83 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  34.97 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  35.06 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  36.84 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  32.57 
 
 		 199 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  36.46 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  35.26 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  35.26 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  35.26 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  34.97 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  36.41 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  36.41 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  35.26 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  35.26 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  35.26 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  34.97 
 
 		 192 aa  102  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  36.41 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  36.81 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  34.67 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  34.08 
 
 		 201 aa  102  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  37.42 
 
 		 191 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  36.14 
 
 		 192 aa  101  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  37.42 
 
 		 191 aa  101  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  31.28 
 
 		 190 aa  101  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  36.14 
 
 		 192 aa  101  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1178  hypothetical protein  33.85 
 
 		 191 aa  101  8e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000879388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  35.42 
 
 		 175 aa  100  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0890  YceI  30.05 
 
 		 220 aa  101  9e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  34.02 
 
 		 192 aa  100  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  33.71 
 
 		 187 aa  101  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  34.74 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  35.75 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  35.36 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1401  YceI family protein  32.73 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  34.74 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  34.74 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  30.81 
 
 		 182 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1179  hypothetical protein  33.85 
 
 		 191 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000115477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  33.33 
 
 		 175 aa  99.4  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  31.4 
 
 		 177 aa  99.4  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  31.58 
 
 		 189 aa  99.4  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  36.2 
 
 		 191 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  34.94 
 
 		 213 aa  99.4  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  34.1 
 
 		 200 aa  99.4  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4058  YceI family protein  34.46 
 
 		 176 aa  99.4  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.675999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  32.96 
 
 		 209 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  32.45 
 
 		 187 aa  99  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2505  YceI family protein  34.3 
 
 		 179 aa  99  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0958427 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1249  hypothetical protein  33.68 
 
 		 191 aa  99  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00199018  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1121  hypothetical protein  33.33 
 
 		 177 aa  98.2  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000345646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  31.69 
 
 		 201 aa  98.6  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  31.95 
 
 		 254 aa  97.8  9e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  34.24 
 
 		 213 aa  97.4  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  38.89 
 
 		 199 aa  97.1  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  34.24 
 
 		 213 aa  97.4  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  32.57 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2702  hypothetical protein  32.81 
 
 		 191 aa  97.8  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.120827  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  31.61 
 
 		 181 aa  97.1  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  31.98 
 
 		 184 aa  97.1  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  34.87 
 
 		 181 aa  96.3  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0009  YceI like family protein  33.52 
 
 		 216 aa  96.7  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  40.27 
 
 		 183 aa  96.7  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  30.27 
 
 		 189 aa  96.3  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  29.38 
 
 		 182 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  33.12 
 
 		 207 aa  95.9  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  28.74 
 
 		 216 aa  95.9  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  41.78 
 
 		 196 aa  96.3  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3598  hypothetical protein  29.21 
 
 		 199 aa  95.5  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  30.86 
 
 		 235 aa  95.5  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3041  hypothetical protein  32.81 
 
 		 191 aa  95.5  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000749458  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3055  hypothetical protein  32.81 
 
 		 191 aa  95.5  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0011163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>