More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2185 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2185  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  391  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1047  YceI  80.59 
 
 		 191 aa  285  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151047 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1401  YceI family protein  76.19 
 
 		 190 aa  260  8e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0892  YceI family protein  47.85 
 
 		 193 aa  179  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  47.06 
 
 		 196 aa  151  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  43.03 
 
 		 235 aa  134  6.0000000000000005e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  39.02 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  36.26 
 
 		 237 aa  125  5e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  36.75 
 
 		 237 aa  125  6e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  39.76 
 
 		 254 aa  124  7e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  37.3 
 
 		 197 aa  124  9e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  36.87 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  36.76 
 
 		 197 aa  121  5e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  39.62 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  37.27 
 
 		 207 aa  117  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  37.58 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  36.97 
 
 		 206 aa  115  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  37.58 
 
 		 213 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  35.39 
 
 		 199 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  40 
 
 		 205 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  33.93 
 
 		 205 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  38.6 
 
 		 209 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  36.93 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  40.78 
 
 		 191 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  37.65 
 
 		 213 aa  112  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  36.67 
 
 		 213 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2265  YceI  37.43 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  40.96 
 
 		 192 aa  109  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  33.33 
 
 		 207 aa  108  5e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  35 
 
 		 205 aa  108  7.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0976  YceI  37.43 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  36.08 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  39.16 
 
 		 192 aa  105  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  38.8 
 
 		 192 aa  104  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  32.26 
 
 		 207 aa  104  9e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  38.07 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  38.64 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  38.64 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  35.33 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  38.07 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  38.64 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  38.64 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  38.64 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  38.64 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  35.12 
 
 		 189 aa  102  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  38.64 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  38.64 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  38.64 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  38.64 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  38.64 
 
 		 191 aa  102  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  37.95 
 
 		 192 aa  101  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  38.07 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  37.06 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  38.07 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  38.07 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  37.13 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  36.47 
 
 		 192 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4023  YceI family protein  36.84 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  36.47 
 
 		 192 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3043  YceI family protein  33.15 
 
 		 210 aa  97.1  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  36.41 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  35.88 
 
 		 192 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  36.41 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  36.41 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  37.28 
 
 		 182 aa  95.5  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  35.29 
 
 		 204 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  35.29 
 
 		 192 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  34.2 
 
 		 196 aa  94.4  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  37.57 
 
 		 195 aa  94  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7029  YceI family protein  36.26 
 
 		 183 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  35.76 
 
 		 180 aa  92.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  31.58 
 
 		 214 aa  92  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0950  hypothetical protein  33.53 
 
 		 190 aa  91.7  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000269923  normal  0.477847 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1249  hypothetical protein  34.41 
 
 		 191 aa  91.3  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00199018  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2359  YceI family protein  35.48 
 
 		 193 aa  91.3  8e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  32.16 
 
 		 187 aa  90.9  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  35.96 
 
 		 182 aa  90.9  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3154  YceI  31.25 
 
 		 192 aa  90.9  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0257242  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1519  YceI family protein  30.16 
 
 		 191 aa  90.9  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  33.33 
 
 		 200 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0765  YceI family protein  32.79 
 
 		 204 aa  90.5  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  35.4 
 
 		 193 aa  90.1  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  35.39 
 
 		 179 aa  89.7  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8737  YceI  34.08 
 
 		 194 aa  89.4  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1026  YceI family protein  29.9 
 
 		 225 aa  89.7  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5284  hypothetical protein  34.83 
 
 		 208 aa  89  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.547725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1179  hypothetical protein  33.72 
 
 		 191 aa  89  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000115477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1178  hypothetical protein  33.72 
 
 		 191 aa  88.6  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000879388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0687  hypothetical protein  32.34 
 
 		 234 aa  88.6  5e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1323  hypothetical protein  33.69 
 
 		 191 aa  88.2  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00141701  normal  0.012746 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3055  hypothetical protein  33.69 
 
 		 191 aa  88.2  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0011163  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3198  hypothetical protein  33.69 
 
 		 191 aa  88.2  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3041  hypothetical protein  33.69 
 
 		 191 aa  87.8  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000749458  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2702  hypothetical protein  33.69 
 
 		 191 aa  88.2  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.120827  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  33.92 
 
 		 189 aa  87.4  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0604  YceI family protein  31.74 
 
 		 234 aa  87.4  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  38.15 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03828  YceI  33.53 
 
 		 188 aa  86.3  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  35.06 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  34.71 
 
 		 187 aa  85.9  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>