More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1887 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  100 
 
 		 192 aa  391  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  79.17 
 
 		 192 aa  324  4.0000000000000003e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  79.17 
 
 		 192 aa  324  4.0000000000000003e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  79.17 
 
 		 192 aa  324  4.0000000000000003e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  78.01 
 
 		 192 aa  313  9.999999999999999e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  78.01 
 
 		 191 aa  310  9e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  78.01 
 
 		 191 aa  310  9e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  78.01 
 
 		 191 aa  310  9e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  77.49 
 
 		 191 aa  310  1e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  78.01 
 
 		 191 aa  309  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  77.49 
 
 		 191 aa  310  1e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  82.29 
 
 		 192 aa  310  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  77.49 
 
 		 191 aa  308  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  76.96 
 
 		 191 aa  308  4e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  76.96 
 
 		 191 aa  308  4e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  76.96 
 
 		 191 aa  308  4e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  76.96 
 
 		 191 aa  308  4e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  76.96 
 
 		 191 aa  308  4e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  76.96 
 
 		 191 aa  308  4e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  76.44 
 
 		 191 aa  307  6.999999999999999e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  81.77 
 
 		 192 aa  307  6.999999999999999e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  72.4 
 
 		 192 aa  294  4e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  75.26 
 
 		 191 aa  294  6e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  75.26 
 
 		 191 aa  293  8e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  67.54 
 
 		 191 aa  269  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  67.02 
 
 		 192 aa  254  6e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1323  hypothetical protein  57.37 
 
 		 191 aa  225  4e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00141701  normal  0.012746 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3055  hypothetical protein  57.37 
 
 		 191 aa  225  4e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0011163  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3198  hypothetical protein  56.84 
 
 		 191 aa  223  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3041  hypothetical protein  56.84 
 
 		 191 aa  222  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000749458  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5284  hypothetical protein  55.05 
 
 		 208 aa  217  8.999999999999998e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.547725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1249  hypothetical protein  54.74 
 
 		 191 aa  217  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00199018  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1179  hypothetical protein  54.74 
 
 		 191 aa  217  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000115477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1178  hypothetical protein  54.74 
 
 		 191 aa  216  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000879388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  53.65 
 
 		 193 aa  213  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2702  hypothetical protein  54.74 
 
 		 191 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.120827  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1217  hypothetical protein  54.97 
 
 		 192 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000670198  normal  0.302127 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1121  hypothetical protein  58.96 
 
 		 177 aa  209  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000345646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0950  hypothetical protein  55.26 
 
 		 190 aa  207  6e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000269923  normal  0.477847 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03828  YceI  59.76 
 
 		 188 aa  207  7e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  57.51 
 
 		 192 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  58.55 
 
 		 192 aa  206  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  56.99 
 
 		 192 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  58.03 
 
 		 192 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2875  hypothetical protein  53.16 
 
 		 191 aa  206  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367031  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  56.99 
 
 		 204 aa  202  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3598  hypothetical protein  52.84 
 
 		 199 aa  202  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  56.99 
 
 		 192 aa  202  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1317  hypothetical protein  52.11 
 
 		 191 aa  201  5e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.269449  normal  0.532637 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  54.45 
 
 		 196 aa  200  9e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2890  hypothetical protein  53.76 
 
 		 189 aa  197  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.11559  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2128  hypothetical protein  57.4 
 
 		 191 aa  195  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000295006  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1739  hypothetical protein  49.24 
 
 		 203 aa  191  8e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000033243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  48.42 
 
 		 189 aa  190  9e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3370  hypothetical protein  54.21 
 
 		 191 aa  190  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  50.58 
 
 		 198 aa  181  7e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  47.37 
 
 		 189 aa  175  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05924  hypothetical protein  46.32 
 
 		 189 aa  174  8e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000194  hypothetical protein  50 
 
 		 176 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352716  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  41.81 
 
 		 201 aa  165  4e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  45.6 
 
 		 179 aa  158  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  41.72 
 
 		 183 aa  134  9e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  42.33 
 
 		 183 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  41.1 
 
 		 182 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  43.79 
 
 		 196 aa  132  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  43.92 
 
 		 201 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  42.59 
 
 		 183 aa  131  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  41.61 
 
 		 182 aa  127  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  39.59 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  39.59 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  41.86 
 
 		 182 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  40.27 
 
 		 196 aa  122  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  42.65 
 
 		 183 aa  118  6e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  41.77 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  43.8 
 
 		 183 aa  115  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  36.9 
 
 		 201 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  39.44 
 
 		 201 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1831  YceI  38.3 
 
 		 193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.033679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  38.78 
 
 		 181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3514  YceI family protein  40.3 
 
 		 285 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  39.76 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  35.63 
 
 		 187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1264  YceI family protein  37.93 
 
 		 185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  43.05 
 
 		 196 aa  111  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  38.15 
 
 		 204 aa  111  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  34.73 
 
 		 177 aa  111  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  36.32 
 
 		 214 aa  111  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  36.93 
 
 		 188 aa  111  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  38.18 
 
 		 202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  40.58 
 
 		 182 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  38.18 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  37.33 
 
 		 182 aa  109  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  41.01 
 
 		 195 aa  109  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  37.57 
 
 		 199 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  36.9 
 
 		 188 aa  109  3e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  37.78 
 
 		 197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  36.87 
 
 		 182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  37.58 
 
 		 184 aa  108  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  36.7 
 
 		 209 aa  108  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1026  YceI family protein  35.63 
 
 		 225 aa  108  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>