More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3514 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3514  YceI family protein  100 
 
 		 285 aa  559  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  45.56 
 
 		 183 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  45.4 
 
 		 181 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  44.71 
 
 		 182 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  45.29 
 
 		 183 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  44.77 
 
 		 186 aa  157  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  44.71 
 
 		 183 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  45.83 
 
 		 183 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  43.98 
 
 		 182 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  42.69 
 
 		 182 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8737  YceI  40.34 
 
 		 194 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  38.37 
 
 		 181 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0872  YceI family protein  39.77 
 
 		 180 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467624  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  43.6 
 
 		 182 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1264  YceI family protein  41.52 
 
 		 185 aa  143  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  37.21 
 
 		 181 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0195  YceI family protein  41.18 
 
 		 187 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  40.7 
 
 		 219 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  40.59 
 
 		 182 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  40.35 
 
 		 183 aa  136  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  39.88 
 
 		 178 aa  136  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  41.52 
 
 		 209 aa  136  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  42.51 
 
 		 183 aa  136  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  39.64 
 
 		 184 aa  135  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4591  YceI family protein  39.16 
 
 		 190 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  41.04 
 
 		 187 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  38.37 
 
 		 182 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  41.14 
 
 		 214 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0518  YceI family protein  38.24 
 
 		 181 aa  133  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000120674  hitchhiker  0.000476131 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  38.32 
 
 		 182 aa  132  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  40.12 
 
 		 188 aa  132  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  40.35 
 
 		 182 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  40.35 
 
 		 182 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  40.35 
 
 		 182 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  36.05 
 
 		 177 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  40.35 
 
 		 181 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  36.69 
 
 		 174 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  39.88 
 
 		 195 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  39.31 
 
 		 182 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0441  YceI family protein  39.18 
 
 		 183 aa  130  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.886129  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  41.86 
 
 		 180 aa  129  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  40.46 
 
 		 181 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  39.88 
 
 		 201 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  40.7 
 
 		 201 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  40.12 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  35.16 
 
 		 187 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2737  YceI family protein  38.46 
 
 		 181 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0292655  normal  0.091865 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  40.12 
 
 		 201 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  40.11 
 
 		 201 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  38.33 
 
 		 212 aa  127  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  37.79 
 
 		 196 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  41.18 
 
 		 201 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  41.18 
 
 		 201 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07170  hypothetical protein  36.69 
 
 		 181 aa  126  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  36.05 
 
 		 175 aa  125  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4627  YceI family protein  37.65 
 
 		 175 aa  125  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24290  hypothetical protein  38.1 
 
 		 176 aa  124  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0570577  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  44.06 
 
 		 179 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3701  YceI  39.66 
 
 		 187 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  37.13 
 
 		 182 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  39.08 
 
 		 195 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  40.59 
 
 		 201 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  37.06 
 
 		 186 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4058  YceI family protein  34.71 
 
 		 176 aa  122  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.675999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  39.73 
 
 		 201 aa  121  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  39.18 
 
 		 182 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2875  hypothetical protein  43.36 
 
 		 191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367031  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  40.91 
 
 		 196 aa  120  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  39.86 
 
 		 189 aa  120  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  38.99 
 
 		 191 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  38.99 
 
 		 191 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  38.99 
 
 		 191 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7029  YceI family protein  35.26 
 
 		 183 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  38.99 
 
 		 191 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  38.99 
 
 		 191 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  38.99 
 
 		 191 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  38.64 
 
 		 200 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  41.91 
 
 		 191 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  41.91 
 
 		 191 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  35.43 
 
 		 187 aa  119  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1217  hypothetical protein  40.54 
 
 		 192 aa  119  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000670198  normal  0.302127 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  36.99 
 
 		 196 aa  119  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  36.93 
 
 		 197 aa  118  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  38.36 
 
 		 191 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  36.93 
 
 		 197 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  34.5 
 
 		 177 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  39.41 
 
 		 198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1317  hypothetical protein  40.56 
 
 		 191 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.269449  normal  0.532637 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  36.26 
 
 		 189 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1380  YceI family protein  36.99 
 
 		 187 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181422  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05924  hypothetical protein  39.31 
 
 		 189 aa  116  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3656  YceI family protein  36.26 
 
 		 180 aa  115  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0464334  normal  0.0393691 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000194  hypothetical protein  39.31 
 
 		 176 aa  115  7.999999999999999e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352716  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  33.33 
 
 		 182 aa  115  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  40.44 
 
 		 192 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  39.71 
 
 		 192 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  39.71 
 
 		 191 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  39.71 
 
 		 192 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  39.71 
 
 		 192 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  39.43 
 
 		 193 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>