More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1264 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1264  YceI family protein  100 
 
 
185 aa  373  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  62.09 
 
 
186 aa  235  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  62.43 
 
 
181 aa  226  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8737  YceI  55.03 
 
 
194 aa  219  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  58.19 
 
 
209 aa  219  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0872  YceI family protein  63.47 
 
 
180 aa  213  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467624  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  60.56 
 
 
183 aa  201  4e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  57.78 
 
 
181 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  54.14 
 
 
183 aa  195  4.0000000000000005e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  56.9 
 
 
181 aa  192  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  54.44 
 
 
180 aa  191  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  54.7 
 
 
182 aa  189  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  52.49 
 
 
182 aa  189  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  55.62 
 
 
182 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  55.62 
 
 
182 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  55.62 
 
 
182 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1380  YceI family protein  51.37 
 
 
187 aa  177  9e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181422  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  50.3 
 
 
181 aa  174  7e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  49.43 
 
 
181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  50 
 
 
182 aa  166  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7029  YceI family protein  47.73 
 
 
183 aa  163  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  48.55 
 
 
183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07170  hypothetical protein  48.55 
 
 
181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0441  YceI family protein  46.93 
 
 
183 aa  160  8.000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.886129  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  45.7 
 
 
189 aa  159  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  47.06 
 
 
177 aa  159  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  46.43 
 
 
183 aa  158  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  44.51 
 
 
182 aa  157  6e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  47.75 
 
 
187 aa  157  9e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  45.71 
 
 
182 aa  157  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4591  YceI family protein  43.18 
 
 
190 aa  156  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  45.35 
 
 
196 aa  155  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2737  YceI family protein  45.66 
 
 
181 aa  155  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0292655  normal  0.091865 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  44.77 
 
 
187 aa  154  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  44.71 
 
 
181 aa  154  5.0000000000000005e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  44.58 
 
 
182 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  43.27 
 
 
187 aa  152  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  43.02 
 
 
183 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  44.19 
 
 
175 aa  151  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  43.02 
 
 
183 aa  151  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  45.18 
 
 
182 aa  151  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0195  YceI family protein  46.89 
 
 
187 aa  150  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  42.6 
 
 
178 aa  150  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  44.92 
 
 
196 aa  149  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  42.44 
 
 
212 aa  149  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  40.76 
 
 
219 aa  149  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  46.29 
 
 
214 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  43.6 
 
 
188 aa  147  9e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  47.13 
 
 
201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  41.71 
 
 
184 aa  146  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  47.13 
 
 
223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  46.55 
 
 
201 aa  144  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  45.7 
 
 
201 aa  143  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  41.25 
 
 
174 aa  144  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  39.23 
 
 
182 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  44.86 
 
 
201 aa  143  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0518  YceI family protein  44.32 
 
 
181 aa  143  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000120674  hitchhiker  0.000476131 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3514  YceI family protein  41.52 
 
 
285 aa  143  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  46.24 
 
 
200 aa  141  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4627  YceI family protein  41.67 
 
 
175 aa  141  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  44.69 
 
 
184 aa  140  8e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  43.45 
 
 
177 aa  140  9e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  44.64 
 
 
182 aa  140  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  39.66 
 
 
182 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  42.02 
 
 
186 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3701  YceI  44.44 
 
 
187 aa  138  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  44.57 
 
 
195 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  42.2 
 
 
199 aa  137  7e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  37.87 
 
 
182 aa  135  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24290  hypothetical protein  41.04 
 
 
176 aa  134  7.000000000000001e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0570577  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  42.13 
 
 
195 aa  131  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  43.43 
 
 
197 aa  130  9e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  35.5 
 
 
177 aa  130  9e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  43.43 
 
 
197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  38.95 
 
 
177 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1711  YceI family protein  42.17 
 
 
188 aa  129  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4058  YceI family protein  37.28 
 
 
176 aa  129  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.675999  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2435  YceI family protein  40.59 
 
 
188 aa  127  9.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.832405  normal  0.0582212 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  42.86 
 
 
201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  42.86 
 
 
201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  42.86 
 
 
201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  44.02 
 
 
198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3656  YceI family protein  36.09 
 
 
180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0464334  normal  0.0393691 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2505  YceI family protein  39.41 
 
 
179 aa  125  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0958427 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1960  hypothetical protein  41.3 
 
 
196 aa  124  6e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2885  YceI family protein  37.13 
 
 
229 aa  124  6e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.265419  normal  0.0897618 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  38.25 
 
 
188 aa  124  9e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  37.2 
 
 
195 aa  121  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  40.78 
 
 
204 aa  120  9e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  40.12 
 
 
175 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  41.32 
 
 
179 aa  119  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  39.05 
 
 
193 aa  119  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  39.04 
 
 
192 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3033  YceI family protein  35.35 
 
 
224 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1334  YceI  36.9 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000025527  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  38.04 
 
 
178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  40 
 
 
192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  38.15 
 
 
196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3297  hypothetical protein  37.5 
 
 
191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.019174  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  37.67 
 
 
192 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>