More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0950 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0950  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  384  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000269923  normal  0.477847 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1323  hypothetical protein  69.11 
 
 		 191 aa  273  8e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00141701  normal  0.012746 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3055  hypothetical protein  69.11 
 
 		 191 aa  273  8e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0011163  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3198  hypothetical protein  68.59 
 
 		 191 aa  271  3e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3041  hypothetical protein  68.59 
 
 		 191 aa  271  3e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000749458  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2702  hypothetical protein  69.11 
 
 		 191 aa  271  4.0000000000000004e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.120827  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1179  hypothetical protein  69.11 
 
 		 191 aa  271  6e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000115477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1178  hypothetical protein  68.59 
 
 		 191 aa  268  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000879388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1249  hypothetical protein  68.59 
 
 		 191 aa  268  4e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00199018  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1217  hypothetical protein  67.02 
 
 		 192 aa  263  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000670198  normal  0.302127 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1121  hypothetical protein  70.62 
 
 		 177 aa  263  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000345646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2875  hypothetical protein  65.45 
 
 		 191 aa  260  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367031  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1317  hypothetical protein  63.35 
 
 		 191 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.269449  normal  0.532637 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3370  hypothetical protein  69.63 
 
 		 191 aa  256  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03828  YceI  65.5 
 
 		 188 aa  239  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2128  hypothetical protein  65.7 
 
 		 191 aa  234  4e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000295006  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  59.16 
 
 		 191 aa  229  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  63.53 
 
 		 191 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  63.53 
 
 		 191 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  58.64 
 
 		 189 aa  221  4.9999999999999996e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  61.18 
 
 		 192 aa  219  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3598  hypothetical protein  57.4 
 
 		 199 aa  218  3.9999999999999997e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  55.5 
 
 		 191 aa  216  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  55.5 
 
 		 191 aa  216  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  55.5 
 
 		 191 aa  215  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  55.5 
 
 		 191 aa  215  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  55.5 
 
 		 191 aa  216  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  55.5 
 
 		 191 aa  216  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  55.5 
 
 		 191 aa  216  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  55.5 
 
 		 191 aa  216  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  54.97 
 
 		 191 aa  215  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  54.69 
 
 		 192 aa  213  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  56.25 
 
 		 189 aa  212  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  54.45 
 
 		 191 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  56.12 
 
 		 192 aa  211  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  54.64 
 
 		 191 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  54.64 
 
 		 191 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  54.64 
 
 		 191 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  56.52 
 
 		 192 aa  209  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  56.52 
 
 		 192 aa  209  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  56.52 
 
 		 192 aa  209  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05924  hypothetical protein  56.25 
 
 		 189 aa  209  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  55.5 
 
 		 192 aa  208  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  54.12 
 
 		 191 aa  208  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  52.2 
 
 		 196 aa  207  5e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  55.26 
 
 		 192 aa  207  6e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2890  hypothetical protein  57.65 
 
 		 189 aa  207  6e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.11559  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000194  hypothetical protein  58.43 
 
 		 176 aa  206  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352716  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  55.21 
 
 		 192 aa  204  6e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  49.48 
 
 		 193 aa  199  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5284  hypothetical protein  48.21 
 
 		 208 aa  191  6e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.547725  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  52.94 
 
 		 192 aa  188  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  52.94 
 
 		 192 aa  187  8e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  50.87 
 
 		 198 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  52.33 
 
 		 204 aa  181  7e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  52.33 
 
 		 192 aa  181  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  51.74 
 
 		 192 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  42.93 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  51.16 
 
 		 192 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1739  hypothetical protein  45.13 
 
 		 203 aa  171  6.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000033243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  41.15 
 
 		 179 aa  142  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  36.63 
 
 		 196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  39.29 
 
 		 183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  40 
 
 		 183 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  40 
 
 		 183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  37.72 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  37.24 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  36.67 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  34.51 
 
 		 182 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  36.11 
 
 		 196 aa  108  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  35.17 
 
 		 182 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  37.32 
 
 		 219 aa  108  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3514  YceI family protein  35.1 
 
 		 285 aa  108  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  32.37 
 
 		 213 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  32.37 
 
 		 213 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  35.84 
 
 		 201 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  32 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  34.46 
 
 		 199 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  37.5 
 
 		 201 aa  105  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  38.06 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  34.1 
 
 		 186 aa  106  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  37.5 
 
 		 201 aa  105  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  38.06 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  32 
 
 		 188 aa  105  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1264  YceI family protein  33.73 
 
 		 185 aa  104  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  33.99 
 
 		 182 aa  104  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  33.33 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7029  YceI family protein  32.18 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  37.84 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  35.67 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3229  hypothetical protein  35.12 
 
 		 197 aa  102  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.474421  normal  0.780413 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  32.77 
 
 		 196 aa  100  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1026  YceI family protein  33.14 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  34.81 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  34.81 
 
 		 207 aa  99.4  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  31.49 
 
 		 182 aa  99.4  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  36.59 
 
 		 201 aa  99  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  34.46 
 
 		 184 aa  99.4  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  36.59 
 
 		 201 aa  99  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  35.29 
 
 		 177 aa  98.6  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>