More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1314 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  402  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  54.92 
 
 
191 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  56.32 
 
 
191 aa  204  9e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3041  hypothetical protein  51.3 
 
 
191 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000749458  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  54.6 
 
 
192 aa  201  7e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3055  hypothetical protein  51.3 
 
 
191 aa  201  8e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0011163  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1323  hypothetical protein  51.3 
 
 
191 aa  201  8e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00141701  normal  0.012746 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1739  hypothetical protein  48.5 
 
 
203 aa  200  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000033243  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3198  hypothetical protein  51.3 
 
 
191 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  54.6 
 
 
191 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  51.81 
 
 
189 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1179  hypothetical protein  48.7 
 
 
191 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000115477  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  51.81 
 
 
189 aa  196  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2702  hypothetical protein  49.22 
 
 
191 aa  195  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.120827  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1178  hypothetical protein  48.7 
 
 
191 aa  196  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000879388  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1249  hypothetical protein  48.7 
 
 
191 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00199018  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  54.02 
 
 
192 aa  194  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03828  YceI  55.81 
 
 
188 aa  194  7e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  54.02 
 
 
192 aa  194  9e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2875  hypothetical protein  46.11 
 
 
191 aa  193  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367031  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  46.97 
 
 
192 aa  192  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  52.94 
 
 
192 aa  190  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  49.49 
 
 
196 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  47.67 
 
 
191 aa  188  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3598  hypothetical protein  51.11 
 
 
199 aa  188  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  47.67 
 
 
191 aa  188  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  47.67 
 
 
191 aa  188  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  49.74 
 
 
201 aa  188  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  49.48 
 
 
192 aa  188  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  49.45 
 
 
191 aa  188  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  51.72 
 
 
204 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1121  hypothetical protein  51.4 
 
 
177 aa  186  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000345646  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  48.9 
 
 
191 aa  186  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  48.9 
 
 
191 aa  186  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  47.4 
 
 
192 aa  186  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  47.94 
 
 
192 aa  186  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  47.15 
 
 
191 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  48.9 
 
 
191 aa  186  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  47.4 
 
 
192 aa  186  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  47.4 
 
 
192 aa  186  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  48.9 
 
 
191 aa  186  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  48.9 
 
 
191 aa  186  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  51.72 
 
 
192 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  48.9 
 
 
191 aa  186  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  48.9 
 
 
191 aa  186  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  51.72 
 
 
192 aa  185  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  48.9 
 
 
191 aa  186  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  48.9 
 
 
191 aa  186  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  49.23 
 
 
193 aa  186  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  51.15 
 
 
192 aa  184  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  51.18 
 
 
192 aa  184  6e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2890  hypothetical protein  51.15 
 
 
189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.11559  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5284  hypothetical protein  45.69 
 
 
208 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.547725  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0950  hypothetical protein  50 
 
 
190 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000269923  normal  0.477847 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2128  hypothetical protein  50.28 
 
 
191 aa  181  7e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000295006  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3370  hypothetical protein  48.19 
 
 
191 aa  180  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1317  hypothetical protein  48.62 
 
 
191 aa  180  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.269449  normal  0.532637 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05924  hypothetical protein  48.19 
 
 
189 aa  176  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1217  hypothetical protein  46.63 
 
 
192 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000670198  normal  0.302127 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000194  hypothetical protein  50.87 
 
 
176 aa  172  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352716  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  42.93 
 
 
179 aa  137  7e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  34.9 
 
 
213 aa  128  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  34.9 
 
 
213 aa  128  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  44.44 
 
 
196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  38.29 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  39.46 
 
 
187 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  37.58 
 
 
183 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  42.34 
 
 
183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  38.18 
 
 
183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  36.91 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  36.69 
 
 
205 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  41.78 
 
 
182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  35.88 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  41.3 
 
 
187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1831  YceI  35.5 
 
 
193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.033679  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  38.31 
 
 
202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1026  YceI family protein  34.81 
 
 
225 aa  112  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  39.44 
 
 
195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  36.52 
 
 
199 aa  111  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  39.07 
 
 
201 aa  111  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  39.52 
 
 
201 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  37.24 
 
 
182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  37.01 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  34.1 
 
 
182 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2451  YceI family protein  34.48 
 
 
205 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  35.95 
 
 
186 aa  107  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  40.15 
 
 
182 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  36.91 
 
 
196 aa  105  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1680  YceI family protein  36.36 
 
 
200 aa  105  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  37.09 
 
 
201 aa  105  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  38.67 
 
 
182 aa  104  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3514  YceI family protein  39.01 
 
 
285 aa  104  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  37.96 
 
 
182 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  35.84 
 
 
201 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  37.97 
 
 
189 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  37.42 
 
 
201 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  37.57 
 
 
188 aa  102  3e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1334  YceI  34.81 
 
 
189 aa  102  4e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000025527  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  35.26 
 
 
212 aa  102  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  36.97 
 
 
195 aa  101  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.460798 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>