More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1334 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1334  YceI  100 
 
 
189 aa  376  1e-103  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000025527  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0443  hypothetical protein  50.79 
 
 
190 aa  184  5e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0469  hypothetical protein  50.26 
 
 
190 aa  182  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.189395  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1536  hypothetical protein  49.74 
 
 
190 aa  181  7e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  48.11 
 
 
188 aa  178  4e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0727  conserved hypothetical protein, YceI family  46.56 
 
 
190 aa  162  2.0000000000000002e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0212414  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1711  YceI family protein  44.21 
 
 
188 aa  142  3e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  44.44 
 
 
199 aa  133  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  41.67 
 
 
183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  40.83 
 
 
183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  40.24 
 
 
183 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  38.69 
 
 
182 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  39.18 
 
 
198 aa  125  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  38.1 
 
 
177 aa  125  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  36.53 
 
 
182 aa  124  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  36.46 
 
 
195 aa  123  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  41.36 
 
 
193 aa  122  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  37.5 
 
 
182 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  36.53 
 
 
182 aa  121  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  39.55 
 
 
196 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  40.12 
 
 
183 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  41.71 
 
 
201 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  37.1 
 
 
189 aa  118  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  39.41 
 
 
196 aa  117  7.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2032  YceI  37.89 
 
 
192 aa  117  9e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.267829  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1264  YceI family protein  36.9 
 
 
185 aa  117  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  37.5 
 
 
214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  38.41 
 
 
190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  39.18 
 
 
175 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  45.16 
 
 
177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  41.95 
 
 
201 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  41.14 
 
 
201 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  38.73 
 
 
200 aa  114  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  39.88 
 
 
183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  39.88 
 
 
195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  37.58 
 
 
180 aa  112  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  37.65 
 
 
201 aa  110  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  38.1 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  37.35 
 
 
223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  38.55 
 
 
182 aa  109  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  39.29 
 
 
174 aa  108  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  37.2 
 
 
189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  37.79 
 
 
209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  33.14 
 
 
187 aa  108  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  36.42 
 
 
212 aa  107  9.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  36.31 
 
 
201 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  36.63 
 
 
186 aa  107  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  40.7 
 
 
187 aa  106  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  35 
 
 
201 aa  106  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  32.93 
 
 
182 aa  106  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  34.22 
 
 
189 aa  106  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  34.91 
 
 
188 aa  106  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  34.68 
 
 
187 aa  105  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  38.29 
 
 
204 aa  105  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  36.42 
 
 
197 aa  105  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  36.84 
 
 
181 aa  105  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  36.42 
 
 
197 aa  105  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0872  YceI family protein  34.64 
 
 
180 aa  104  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467624  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  35.98 
 
 
191 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  33.93 
 
 
199 aa  103  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  30.95 
 
 
182 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  34.94 
 
 
182 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8737  YceI  34.44 
 
 
194 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  32.11 
 
 
189 aa  102  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  35.45 
 
 
191 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  35.45 
 
 
191 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  34.13 
 
 
177 aa  102  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  40 
 
 
186 aa  102  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  35.45 
 
 
191 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  34.88 
 
 
198 aa  101  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  35.58 
 
 
175 aa  101  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2768  hypothetical protein  42.86 
 
 
171 aa  101  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000157098  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2711  hypothetical protein  42.86 
 
 
171 aa  101  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.440921  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  34.62 
 
 
183 aa  101  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4023  YceI family protein  33.92 
 
 
242 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2451  YceI family protein  32.98 
 
 
205 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  34.92 
 
 
191 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  34.52 
 
 
184 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  35.12 
 
 
196 aa  99.8  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  35.6 
 
 
191 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  34.76 
 
 
199 aa  99.4  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  34.88 
 
 
178 aa  99  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  33.72 
 
 
181 aa  99.4  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  35.6 
 
 
191 aa  99  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  35.6 
 
 
191 aa  99  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  35.6 
 
 
191 aa  99  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  35.6 
 
 
191 aa  99  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05924  hypothetical protein  32.98 
 
 
189 aa  99  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  35.6 
 
 
191 aa  99  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  35.6 
 
 
191 aa  99  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  35.6 
 
 
191 aa  98.2  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  35.6 
 
 
191 aa  98.2  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  34.34 
 
 
181 aa  98.2  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0195  YceI family protein  37.87 
 
 
187 aa  98.2  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2702  hypothetical protein  31.72 
 
 
191 aa  97.8  7e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.120827  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  36.41 
 
 
182 aa  98.2  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  35.48 
 
 
179 aa  97.8  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0067  YceI family protein  31.52 
 
 
171 aa  97.4  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000194  hypothetical protein  33.53 
 
 
176 aa  96.7  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352716  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1323  hypothetical protein  33.33 
 
 
191 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00141701  normal  0.012746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>