More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2036 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  100 
 
 		 195 aa  392  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  47.95 
 
 		 182 aa  144  6e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  47.93 
 
 		 186 aa  142  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  44.57 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  44.57 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  45.03 
 
 		 180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  44 
 
 		 201 aa  138  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  40.88 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  42.5 
 
 		 201 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  44.51 
 
 		 181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  45.66 
 
 		 182 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  45.66 
 
 		 182 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  45.66 
 
 		 182 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  40.44 
 
 		 189 aa  134  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  43.89 
 
 		 181 aa  134  8e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  46.86 
 
 		 201 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  43.96 
 
 		 183 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  43.65 
 
 		 196 aa  132  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  44.69 
 
 		 201 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  41.28 
 
 		 182 aa  131  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  39.58 
 
 		 198 aa  131  5e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  40.78 
 
 		 199 aa  131  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1264  YceI family protein  42.13 
 
 		 185 aa  131  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  38.82 
 
 		 177 aa  131  7.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  40.82 
 
 		 204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  44.05 
 
 		 182 aa  129  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1831  YceI  42.94 
 
 		 193 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.033679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  42.51 
 
 		 187 aa  128  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  40.74 
 
 		 193 aa  125  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  39.68 
 
 		 190 aa  125  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  40.86 
 
 		 188 aa  125  5e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  43.1 
 
 		 201 aa  124  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  41.04 
 
 		 182 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1334  YceI  36.46 
 
 		 189 aa  123  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000025527  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  46.15 
 
 		 209 aa  122  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  42.86 
 
 		 181 aa  122  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  40.12 
 
 		 182 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  36.93 
 
 		 183 aa  121  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  41.21 
 
 		 187 aa  121  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  41.01 
 
 		 200 aa  120  9e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  40.35 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  43.6 
 
 		 191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8737  YceI  43.26 
 
 		 194 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  36.93 
 
 		 183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  39.66 
 
 		 196 aa  119  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  37.79 
 
 		 183 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  41.71 
 
 		 196 aa  119  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  36.36 
 
 		 182 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  37.16 
 
 		 189 aa  117  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  42.46 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  42.46 
 
 		 197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  40 
 
 		 183 aa  116  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  35.71 
 
 		 182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  39.41 
 
 		 184 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  37.64 
 
 		 195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0443  hypothetical protein  34.97 
 
 		 190 aa  115  5e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  41.95 
 
 		 178 aa  114  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  36.84 
 
 		 182 aa  114  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0872  YceI family protein  40.46 
 
 		 180 aa  114  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467624  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2737  YceI family protein  42.6 
 
 		 181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0292655  normal  0.091865 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  37.71 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1536  hypothetical protein  34.97 
 
 		 190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  37.71 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  39.66 
 
 		 212 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  36.99 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1380  YceI family protein  39.29 
 
 		 187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181422  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  38.15 
 
 		 181 aa  111  7.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  38.5 
 
 		 201 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  34.25 
 
 		 184 aa  111  8.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  34.5 
 
 		 182 aa  110  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0469  hypothetical protein  33.88 
 
 		 190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.189395  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  40.72 
 
 		 183 aa  110  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  37.56 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  40.37 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0441  YceI family protein  40.46 
 
 		 183 aa  109  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.886129  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  35.75 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  38.51 
 
 		 192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  33.33 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5284  hypothetical protein  41.67 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.547725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  41.24 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  37.36 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7029  YceI family protein  39.53 
 
 		 183 aa  106  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2851  YceI family protein  33.5 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344848  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  36.42 
 
 		 177 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  41.24 
 
 		 191 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  41.24 
 
 		 191 aa  106  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  41.24 
 
 		 191 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  41.24 
 
 		 191 aa  106  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  41.24 
 
 		 191 aa  106  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  41.24 
 
 		 191 aa  106  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  40.64 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  43.12 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  43.12 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  40.64 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  40.64 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  40.64 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  39.31 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  40.56 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  37.58 
 
 		 192 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  32.5 
 
 		 201 aa  105  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>