More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0727 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0727  conserved hypothetical protein, YceI family  100 
 
 		 190 aa  379  1e-104  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0212414  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0443  hypothetical protein  69.47 
 
 		 190 aa  274  6e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0469  hypothetical protein  68.42 
 
 		 190 aa  270  9e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.189395  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1536  hypothetical protein  67.37 
 
 		 190 aa  268  5e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1334  YceI  46.56 
 
 		 189 aa  162  3e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000025527  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  44.62 
 
 		 188 aa  159  2e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1711  YceI family protein  41.76 
 
 		 188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  36.84 
 
 		 182 aa  131  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3656  YceI family protein  36.75 
 
 		 180 aa  121  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0464334  normal  0.0393691 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2032  YceI  36.79 
 
 		 192 aa  121  8e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.267829  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  39.87 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  36.51 
 
 		 190 aa  119  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  38.1 
 
 		 193 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  37.35 
 
 		 175 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  36.22 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  33.33 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  34.29 
 
 		 177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  36.42 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  33.14 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  34.21 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  32.8 
 
 		 189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  33.14 
 
 		 187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2505  YceI family protein  31.58 
 
 		 179 aa  109  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0958427 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  35.71 
 
 		 187 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  33.7 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  31.52 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  33.73 
 
 		 183 aa  106  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  35.8 
 
 		 174 aa  106  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  34.55 
 
 		 177 aa  104  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  35.71 
 
 		 212 aa  104  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  33.88 
 
 		 196 aa  104  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  31.84 
 
 		 182 aa  104  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  30.49 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  29.82 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  30.59 
 
 		 183 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  32.95 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  30.86 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  34.36 
 
 		 175 aa  102  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  34.55 
 
 		 178 aa  102  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  33.33 
 
 		 189 aa  101  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  29.41 
 
 		 183 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0564  hypothetical protein  36.9 
 
 		 174 aa  101  8e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0475935  normal  0.512882 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  32.95 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4058  YceI family protein  35.8 
 
 		 176 aa  100  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.675999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  30.65 
 
 		 195 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  33.33 
 
 		 196 aa  99.8  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  29.41 
 
 		 183 aa  99.8  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  32.12 
 
 		 207 aa  99.4  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  33.13 
 
 		 175 aa  99.4  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4627  YceI family protein  31.52 
 
 		 175 aa  99.4  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  34.73 
 
 		 197 aa  99  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  32.14 
 
 		 200 aa  98.6  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  31.14 
 
 		 223 aa  98.2  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  31.14 
 
 		 201 aa  97.8  9e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  34.73 
 
 		 197 aa  97.1  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  33.53 
 
 		 195 aa  97.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  31.95 
 
 		 180 aa  96.7  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  31.91 
 
 		 191 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  32.39 
 
 		 201 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  34.76 
 
 		 183 aa  96.7  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  30.54 
 
 		 201 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  32.78 
 
 		 182 aa  96.7  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  33.33 
 
 		 181 aa  96.3  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  31.91 
 
 		 191 aa  95.9  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  31.91 
 
 		 191 aa  95.9  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  33.33 
 
 		 177 aa  96.3  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  31.91 
 
 		 191 aa  95.9  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  31.38 
 
 		 191 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  31.38 
 
 		 191 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  31.38 
 
 		 191 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  32.8 
 
 		 191 aa  95.5  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  31.38 
 
 		 191 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  30 
 
 		 207 aa  95.5  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  31.38 
 
 		 191 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  31.38 
 
 		 191 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  31.38 
 
 		 191 aa  95.5  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  31.38 
 
 		 191 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  31.38 
 
 		 191 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0067  YceI family protein  31.1 
 
 		 171 aa  95.1  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2890  hypothetical protein  28.07 
 
 		 189 aa  95.1  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.11559  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  30.46 
 
 		 187 aa  94.7  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  31.76 
 
 		 213 aa  94.4  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  31.76 
 
 		 213 aa  94.4  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0834  YceI family protein  28.34 
 
 		 201 aa  94.7  8e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.929023  hitchhiker  0.00225936 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  30.17 
 
 		 182 aa  94.4  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  30.77 
 
 		 192 aa  93.6  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  28.4 
 
 		 178 aa  93.2  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  33.53 
 
 		 182 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7029  YceI family protein  29.41 
 
 		 183 aa  92.8  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  33.53 
 
 		 182 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  33.53 
 
 		 182 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  29.69 
 
 		 193 aa  92.4  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  28.65 
 
 		 186 aa  92  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  31.91 
 
 		 192 aa  91.7  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0195  YceI family protein  30.18 
 
 		 187 aa  91.7  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  30.25 
 
 		 195 aa  91.7  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  29.55 
 
 		 201 aa  91.3  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  29.24 
 
 		 186 aa  91.3  9e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  29.55 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2685  YceI family protein  30.36 
 
 		 174 aa  90.9  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>