More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0469 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0469  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  377  1e-104  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.189395  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0443  hypothetical protein  98.42 
 
 
190 aa  372  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1536  hypothetical protein  95.79 
 
 
190 aa  365  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0727  conserved hypothetical protein, YceI family  68.42 
 
 
190 aa  270  9e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0212414  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1334  YceI  50.26 
 
 
189 aa  182  2.0000000000000003e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000025527  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  45.79 
 
 
188 aa  167  7e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  39.88 
 
 
204 aa  138  6e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1711  YceI family protein  42.11 
 
 
188 aa  137  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  36.7 
 
 
190 aa  129  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  41.04 
 
 
196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  36.51 
 
 
214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  38.34 
 
 
193 aa  124  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  39.36 
 
 
199 aa  123  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  35.71 
 
 
177 aa  123  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  34.13 
 
 
182 aa  123  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  35.93 
 
 
182 aa  123  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  41.28 
 
 
197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  37.23 
 
 
189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  35.12 
 
 
177 aa  117  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  33.93 
 
 
188 aa  117  9e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  33.93 
 
 
183 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  37.28 
 
 
175 aa  117  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3656  YceI family protein  36.69 
 
 
180 aa  117  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0464334  normal  0.0393691 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  33.33 
 
 
183 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  35.09 
 
 
182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  32.29 
 
 
198 aa  114  6e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  32.74 
 
 
183 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  40.12 
 
 
197 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2032  YceI  34.03 
 
 
192 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.267829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2685  YceI family protein  35.71 
 
 
174 aa  114  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  34.73 
 
 
177 aa  114  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  36.21 
 
 
196 aa  112  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  32.74 
 
 
187 aa  112  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  36.42 
 
 
187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  33.88 
 
 
195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  30.59 
 
 
182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  35.71 
 
 
181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  36.84 
 
 
178 aa  108  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  37.31 
 
 
191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  37.31 
 
 
191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  31.14 
 
 
182 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  31.79 
 
 
183 aa  108  5e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  32.99 
 
 
202 aa  108  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  36.97 
 
 
177 aa  108  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  36.79 
 
 
191 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  36.79 
 
 
191 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  36.79 
 
 
191 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  37.37 
 
 
191 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  31.72 
 
 
207 aa  107  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  36.79 
 
 
191 aa  107  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  32 
 
 
206 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  36.79 
 
 
191 aa  107  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  36.79 
 
 
191 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  36.79 
 
 
191 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  37.37 
 
 
191 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  37.37 
 
 
191 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  37.37 
 
 
191 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  35.88 
 
 
174 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  36.09 
 
 
195 aa  106  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  37.37 
 
 
191 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0564  hypothetical protein  38.69 
 
 
174 aa  105  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0475935  normal  0.512882 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  34.48 
 
 
181 aa  105  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  31.18 
 
 
207 aa  105  6e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  35.84 
 
 
201 aa  104  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  34.94 
 
 
183 aa  104  8e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0765  YceI family protein  31.64 
 
 
204 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  36.88 
 
 
201 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7029  YceI family protein  33.14 
 
 
183 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  32.97 
 
 
182 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  33.92 
 
 
187 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  36.88 
 
 
201 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  32.18 
 
 
182 aa  102  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  36.88 
 
 
223 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  35.26 
 
 
192 aa  102  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  31.58 
 
 
182 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  33.13 
 
 
182 aa  101  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  34.68 
 
 
201 aa  101  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  32.73 
 
 
199 aa  101  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  33.92 
 
 
201 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4488  YceI family protein  39.2 
 
 
252 aa  101  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.644863  normal  0.336697 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  32.95 
 
 
212 aa  101  8e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  38.22 
 
 
192 aa  100  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  34.5 
 
 
201 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  30.77 
 
 
199 aa  100  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  35.92 
 
 
175 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  30.11 
 
 
184 aa  100  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  30.51 
 
 
186 aa  100  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  35.75 
 
 
192 aa  100  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  35.21 
 
 
175 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0195  YceI family protein  32.97 
 
 
187 aa  99.8  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2890  hypothetical protein  32.34 
 
 
189 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.11559  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  36.81 
 
 
207 aa  99.8  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  37.7 
 
 
192 aa  99  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  35.09 
 
 
213 aa  99.4  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  35.09 
 
 
213 aa  99.4  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  30.77 
 
 
178 aa  99.4  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  34.86 
 
 
182 aa  99  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  34.86 
 
 
182 aa  99  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  30.72 
 
 
182 aa  99  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  34.86 
 
 
182 aa  99  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>