More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2283 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  100 
 
 
189 aa  389  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  50.78 
 
 
193 aa  204  6e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  47.15 
 
 
190 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  49.14 
 
 
189 aa  176  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  47.4 
 
 
199 aa  173  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0564  hypothetical protein  44.31 
 
 
174 aa  148  4e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0475935  normal  0.512882 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  46.15 
 
 
182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2505  YceI family protein  41.14 
 
 
179 aa  139  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0958427 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0067  YceI family protein  41.46 
 
 
171 aa  136  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  40.44 
 
 
195 aa  134  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  39.53 
 
 
175 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  40.68 
 
 
180 aa  132  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4627  YceI family protein  40.35 
 
 
175 aa  132  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  39.39 
 
 
196 aa  132  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  39.49 
 
 
214 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  38.25 
 
 
182 aa  131  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  40.94 
 
 
177 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  38.01 
 
 
182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  38.15 
 
 
200 aa  128  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  38.29 
 
 
177 aa  125  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  39.63 
 
 
187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  40.11 
 
 
186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  39.08 
 
 
195 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0872  YceI family protein  39.31 
 
 
180 aa  125  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467624  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  40.76 
 
 
183 aa  124  6e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  39.66 
 
 
201 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  34.69 
 
 
199 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  38.69 
 
 
206 aa  121  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  38.69 
 
 
205 aa  121  7e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4058  YceI family protein  39.43 
 
 
176 aa  121  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.675999  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  39.66 
 
 
201 aa  121  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  38.5 
 
 
188 aa  120  8e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  42.17 
 
 
201 aa  120  9e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  34.98 
 
 
202 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  36.9 
 
 
213 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  39.64 
 
 
223 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  36.78 
 
 
201 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  35.67 
 
 
177 aa  120  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  36.78 
 
 
201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  39.31 
 
 
182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  39.31 
 
 
182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  39.31 
 
 
182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  36.78 
 
 
201 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  44.76 
 
 
183 aa  118  3.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1334  YceI  37.1 
 
 
189 aa  118  4.9999999999999996e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000025527  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8737  YceI  36.52 
 
 
194 aa  118  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  34.01 
 
 
204 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  36.78 
 
 
181 aa  115  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  38.01 
 
 
183 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  35.96 
 
 
181 aa  115  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  38.6 
 
 
174 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  38.6 
 
 
183 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  39.16 
 
 
182 aa  114  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  36.84 
 
 
181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  37.43 
 
 
188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  38.98 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3656  YceI family protein  32.75 
 
 
180 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0464334  normal  0.0393691 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  37.64 
 
 
181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  39.31 
 
 
197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  37.43 
 
 
187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  40 
 
 
196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  34.32 
 
 
182 aa  111  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  36.42 
 
 
182 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  34.05 
 
 
186 aa  111  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  40.11 
 
 
179 aa  111  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  39.86 
 
 
181 aa  111  8.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  39.86 
 
 
182 aa  110  9e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  34.5 
 
 
182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  38.73 
 
 
197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  35.43 
 
 
177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  34.71 
 
 
175 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  35.47 
 
 
181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4591  YceI family protein  36.47 
 
 
190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  34.52 
 
 
207 aa  108  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  40.54 
 
 
183 aa  107  7.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  34.91 
 
 
175 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1264  YceI family protein  35.71 
 
 
185 aa  107  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  34.02 
 
 
207 aa  106  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  35.42 
 
 
207 aa  106  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  38.61 
 
 
182 aa  106  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  36.09 
 
 
183 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7029  YceI family protein  37.76 
 
 
183 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  37.71 
 
 
219 aa  105  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03182  signal peptide protein  34.52 
 
 
195 aa  104  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7583  YceI-like family protein  35.62 
 
 
202 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.94246  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  35.5 
 
 
182 aa  103  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3297  hypothetical protein  37.87 
 
 
191 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.019174  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  33.52 
 
 
201 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  33.89 
 
 
186 aa  102  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  32.82 
 
 
198 aa  103  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2435  YceI family protein  43.75 
 
 
188 aa  102  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.832405  normal  0.0582212 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  37.06 
 
 
189 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  38.42 
 
 
213 aa  102  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  38.42 
 
 
213 aa  102  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  36.99 
 
 
184 aa  102  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2685  YceI family protein  35.09 
 
 
174 aa  101  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0727  conserved hypothetical protein, YceI family  33.33 
 
 
190 aa  101  5e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0212414  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  34.21 
 
 
205 aa  102  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  34.91 
 
 
182 aa  101  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  36.05 
 
 
178 aa  101  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>