More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4763 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  100 
 
 		 213 aa  430  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  65.24 
 
 		 199 aa  268  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  55.45 
 
 		 202 aa  227  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  56.04 
 
 		 206 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  58.47 
 
 		 205 aa  207  7e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  50.49 
 
 		 205 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  52.72 
 
 		 207 aa  193  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  45.89 
 
 		 205 aa  171  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  45.86 
 
 		 209 aa  162  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  46.41 
 
 		 213 aa  161  7e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  47.65 
 
 		 196 aa  161  8.000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  46.37 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0976  YceI  50.28 
 
 		 213 aa  158  6e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  40.93 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  44.19 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  50.62 
 
 		 201 aa  152  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  43.68 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  40.59 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  46.11 
 
 		 254 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2265  YceI  44.86 
 
 		 219 aa  144  9e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5437  YceI family protein  42.13 
 
 		 193 aa  141  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  45.4 
 
 		 235 aa  140  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1401  YceI family protein  42.5 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0890  YceI  34.25 
 
 		 220 aa  129  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4023  YceI family protein  40.57 
 
 		 242 aa  129  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  34.16 
 
 		 216 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0892  YceI family protein  40.2 
 
 		 193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  40 
 
 		 193 aa  125  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  40.35 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  36.9 
 
 		 190 aa  122  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  33.66 
 
 		 216 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  38.36 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  36.9 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0008  putative lipoprotein  36.32 
 
 		 217 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1047  YceI  37.5 
 
 		 191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151047 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4161  YceI family protein  35.91 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  39.88 
 
 		 197 aa  119  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0008  YceI like family protein  36.65 
 
 		 199 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0007  YceI like family protein  35.82 
 
 		 217 aa  118  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1154  putative lipoprotein  35.82 
 
 		 217 aa  118  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0009  YceI like family protein  35 
 
 		 216 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  39.53 
 
 		 200 aa  118  9e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  37.11 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0009  putative lipoprotein  36.13 
 
 		 199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.686573  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1434  YceI like family protein  36.13 
 
 		 199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.311091  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1513  YceI-like family protein  37.43 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.137036  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0067  YceI family protein  35.58 
 
 		 171 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2185  hypothetical protein  37.58 
 
 		 194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0834  YceI family protein  37.95 
 
 		 201 aa  115  5e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.929023  hitchhiker  0.00225936 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  37.36 
 
 		 213 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  37.36 
 
 		 213 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  40.72 
 
 		 206 aa  114  8.999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4488  YceI family protein  34.11 
 
 		 252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.644863  normal  0.336697 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  35.47 
 
 		 187 aa  111  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  33.16 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  35.47 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  38.67 
 
 		 182 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  37.21 
 
 		 182 aa  108  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0604  YceI family protein  36.53 
 
 		 234 aa  108  6e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  36.11 
 
 		 193 aa  108  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3509  hypothetical protein  35.22 
 
 		 198 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.137598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  36.26 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  39.18 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  33.9 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  39.86 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0687  hypothetical protein  35.93 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  34.66 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  38.79 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3736  YceI  33.74 
 
 		 218 aa  105  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.192641 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  38.82 
 
 		 182 aa  105  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  43.48 
 
 		 196 aa  105  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  34.55 
 
 		 177 aa  105  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  32.37 
 
 		 182 aa  104  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  35.06 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  36.6 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  35.71 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  33.13 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  36.11 
 
 		 183 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  33.65 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  36.81 
 
 		 183 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  38.27 
 
 		 192 aa  101  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  38.27 
 
 		 189 aa  101  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  38.69 
 
 		 192 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  45.83 
 
 		 197 aa  101  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1026  YceI family protein  34.52 
 
 		 225 aa  101  9e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  39.04 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  36.16 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  36.81 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0564  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0475935  normal  0.512882 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3508  periplasmic protein  37.21 
 
 		 196 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.234261  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  37.5 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  38.1 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  37.5 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  34.95 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  38.27 
 
 		 191 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  38.27 
 
 		 191 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  38.27 
 
 		 191 aa  99.4  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  45 
 
 		 197 aa  99.8  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  38.27 
 
 		 191 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  38.27 
 
 		 191 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>