More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3509 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3509  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  392  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.137598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3508  periplasmic protein  46.75 
 
 		 196 aa  175  4e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.234261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0457  YceI family protein  42.33 
 
 		 189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3578  YceI family protein  46.75 
 
 		 192 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1028  YceI family protein  42.11 
 
 		 191 aa  161  5.0000000000000005e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0469  YceI family protein  38.8 
 
 		 211 aa  155  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730302  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3505  YceI family protein  41.18 
 
 		 191 aa  155  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.781833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2226  YceI family protein  39.25 
 
 		 192 aa  148  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000678562  decreased coverage  0.00447323 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2217  YceI family protein  37.11 
 
 		 199 aa  148  7e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3992  YceI family protein  36.7 
 
 		 188 aa  145  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1519  YceI family protein  34.92 
 
 		 191 aa  144  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2551  YceI family protein  40 
 
 		 198 aa  138  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.298445 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2961  YceI family protein  39.41 
 
 		 198 aa  138  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0704  YceI family protein  35.98 
 
 		 193 aa  135  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  normal  0.494453 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3995  hypothetical protein  37.36 
 
 		 189 aa  135  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645736  normal  0.347265 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2717  signal peptide protein  38.6 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.999831  normal  0.128957 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3333  YceI  38.29 
 
 		 192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  34.36 
 
 		 189 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  37.31 
 
 		 192 aa  131  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  33.92 
 
 		 196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2669  YceI family protein  38.51 
 
 		 193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2568  hypothetical protein  37.79 
 
 		 192 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1273  YceI-like family protein  37.21 
 
 		 187 aa  129  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3367  hypothetical protein  37.79 
 
 		 192 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0683  YceI family protein  39.08 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0232  YceI  39.08 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145864  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1160  YceI-like family protein  37.79 
 
 		 192 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0716  YceI family protein  39.08 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.943663  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0298  hypothetical protein  37.79 
 
 		 192 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2382  YceI-like family protein  37.79 
 
 		 187 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3377  YceI-like family protein  37.79 
 
 		 187 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0830  YceI  40.35 
 
 		 199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0387934  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2816  YceI  37.71 
 
 		 196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1536  YceI family protein  32.95 
 
 		 191 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1735  hypothetical protein  33.14 
 
 		 188 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1738  YceI family protein  32.95 
 
 		 188 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3804  hypothetical protein  37.93 
 
 		 211 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3154  YceI  34.69 
 
 		 192 aa  124  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0257242  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1721  YceI family protein  32.37 
 
 		 188 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  35.15 
 
 		 192 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1799  hypothetical protein  33.13 
 
 		 188 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0631  YceI family protein  36.78 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0607  YceI family protein  36.99 
 
 		 195 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2066  hypothetical protein  34.88 
 
 		 192 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0648985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5860  YceI family protein  35.33 
 
 		 192 aa  122  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  37.57 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7381  YceI  39.61 
 
 		 187 aa  121  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398085  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  33.13 
 
 		 189 aa  121  8e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2953  hypothetical protein  35.12 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0815  hypothetical protein  39.88 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  33.5 
 
 		 205 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3736  YceI  37.72 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.192641 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  33.9 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0912  YceI  34.55 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580537  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  31.69 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  37.58 
 
 		 210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0892  YceI family protein  33.16 
 
 		 193 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  38.24 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  29.44 
 
 		 237 aa  103  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  29.44 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  33.9 
 
 		 205 aa  102  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  36.98 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  31.77 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4488  YceI family protein  36.79 
 
 		 252 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.644863  normal  0.336697 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  34.86 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0736  YceI family protein  35.43 
 
 		 187 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.193865  normal  0.716983 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  32.65 
 
 		 202 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  34.29 
 
 		 213 aa  98.2  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0806  YceI family protein  35.43 
 
 		 187 aa  98.2  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  34.68 
 
 		 196 aa  97.8  8e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1782  YceI  28.42 
 
 		 204 aa  97.8  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0100028 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  33.71 
 
 		 213 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  32.99 
 
 		 191 aa  96.3  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1401  YceI family protein  31.95 
 
 		 190 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0790  signal peptide protein  34.21 
 
 		 189 aa  96.3  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534784  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  33.16 
 
 		 191 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  33.16 
 
 		 191 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  33.16 
 
 		 191 aa  95.9  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  33.16 
 
 		 191 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  33.16 
 
 		 191 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  33.16 
 
 		 191 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0976  YceI  37.13 
 
 		 213 aa  95.1  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1150  periplasmic protein  30.48 
 
 		 206 aa  95.1  6e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.138125  normal  0.79265 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  32.64 
 
 		 191 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  32.64 
 
 		 191 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1463  putative signal peptide protein  36.42 
 
 		 151 aa  94  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.036668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  29.03 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  33.71 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  33.84 
 
 		 179 aa  93.2  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  32.78 
 
 		 197 aa  92.4  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  28.95 
 
 		 216 aa  92.8  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  30.3 
 
 		 254 aa  92.4  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  35.26 
 
 		 206 aa  92.4  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  33.51 
 
 		 193 aa  92.4  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  32.09 
 
 		 193 aa  91.7  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0604  YceI family protein  33.92 
 
 		 234 aa  91.7  6e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0687  hypothetical protein  33.92 
 
 		 234 aa  91.7  7e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  29.59 
 
 		 235 aa  91.3  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  34.39 
 
 		 192 aa  91.3  9e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0008  putative lipoprotein  31.13 
 
 		 217 aa  91.3  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>