More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1613 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  405  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  97.97 
 
 
197 aa  395  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  48.44 
 
 
201 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  47.5 
 
 
202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  40.36 
 
 
210 aa  142  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  45.62 
 
 
206 aa  139  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  41.54 
 
 
199 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  42.5 
 
 
212 aa  138  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  46.25 
 
 
207 aa  136  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  43.79 
 
 
206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  42.42 
 
 
196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  43.12 
 
 
205 aa  129  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  42.24 
 
 
205 aa  129  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  39.31 
 
 
237 aa  127  9.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1401  YceI family protein  39.13 
 
 
190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  41.21 
 
 
205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  38.73 
 
 
237 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  40.37 
 
 
209 aa  124  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  37.37 
 
 
214 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  40 
 
 
213 aa  123  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  38.55 
 
 
189 aa  123  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  42.68 
 
 
254 aa  122  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2185  hypothetical protein  36.76 
 
 
194 aa  121  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0892  YceI family protein  42.01 
 
 
193 aa  121  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  40.48 
 
 
235 aa  120  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  39.38 
 
 
213 aa  119  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  39.88 
 
 
213 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  40.46 
 
 
201 aa  118  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1047  YceI  37.35 
 
 
191 aa  117  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.151047 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3043  YceI family protein  36.36 
 
 
210 aa  114  7.999999999999999e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  39.66 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  39.88 
 
 
223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  39.88 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  39.18 
 
 
201 aa  111  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0890  YceI  33.33 
 
 
220 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1519  YceI family protein  33.15 
 
 
191 aa  111  9e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0976  YceI  41.42 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  37.57 
 
 
201 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  37.28 
 
 
213 aa  108  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  37.28 
 
 
213 aa  108  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4023  YceI family protein  38.82 
 
 
242 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  36.36 
 
 
192 aa  106  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  35.75 
 
 
196 aa  105  5e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  32.12 
 
 
216 aa  104  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3736  YceI  31.95 
 
 
218 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.192641 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4161  YceI family protein  36.02 
 
 
211 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  36.31 
 
 
200 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  34.24 
 
 
196 aa  103  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4488  YceI family protein  36.47 
 
 
252 aa  102  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.644863  normal  0.336697 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  36.07 
 
 
207 aa  102  3e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  39.16 
 
 
192 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  38.46 
 
 
192 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  37.7 
 
 
196 aa  101  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  35.33 
 
 
201 aa  101  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  38.46 
 
 
192 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  38.46 
 
 
204 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  38.36 
 
 
192 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  37.11 
 
 
192 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  34.33 
 
 
201 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5284  hypothetical protein  35.75 
 
 
208 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.547725  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  31.52 
 
 
216 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  35.57 
 
 
193 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2875  hypothetical protein  32.09 
 
 
191 aa  99  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367031  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2265  YceI  38.1 
 
 
219 aa  98.6  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0469  YceI family protein  32.48 
 
 
211 aa  98.2  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730302  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  34.97 
 
 
207 aa  98.6  6e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  39.05 
 
 
195 aa  98.2  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2890  hypothetical protein  34.39 
 
 
189 aa  97.8  8e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.11559  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  35.29 
 
 
191 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  35.29 
 
 
191 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  35.62 
 
 
191 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  35.29 
 
 
191 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3598  hypothetical protein  34.68 
 
 
199 aa  95.9  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  35.71 
 
 
192 aa  95.9  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  35.29 
 
 
191 aa  95.9  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  35.62 
 
 
191 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1249  hypothetical protein  32.09 
 
 
191 aa  95.1  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00199018  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  33.33 
 
 
192 aa  95.1  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0687  hypothetical protein  35.8 
 
 
234 aa  95.1  6e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  34.81 
 
 
191 aa  94.7  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  36.25 
 
 
192 aa  94.7  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  36.25 
 
 
192 aa  94.7  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  34.81 
 
 
191 aa  94.7  7e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  36.25 
 
 
192 aa  94.7  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3154  YceI  33.33 
 
 
192 aa  94.7  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0257242  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  32.1 
 
 
201 aa  94.7  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3198  hypothetical protein  33.15 
 
 
191 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0009  YceI like family protein  31.91 
 
 
216 aa  94  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1026  YceI family protein  31.93 
 
 
225 aa  94.4  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  30.73 
 
 
190 aa  94.4  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  34.2 
 
 
186 aa  94.4  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  34.76 
 
 
191 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  31.11 
 
 
189 aa  94.4  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0604  YceI family protein  36.59 
 
 
234 aa  93.2  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  34.25 
 
 
191 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  32.99 
 
 
192 aa  92.8  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1323  hypothetical protein  33.52 
 
 
191 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00141701  normal  0.012746 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  34.02 
 
 
189 aa  92.8  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  34.25 
 
 
191 aa  92.8  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  33.17 
 
 
195 aa  92.4  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.460798 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>