More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3508 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3508  periplasmic protein  100 
 
 		 196 aa  403  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.234261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0457  YceI family protein  63.08 
 
 		 189 aa  253  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3578  YceI family protein  69.41 
 
 		 192 aa  252  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1028  YceI family protein  65.12 
 
 		 191 aa  240  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2226  YceI family protein  60.54 
 
 		 192 aa  222  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000678562  decreased coverage  0.00447323 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0469  YceI family protein  53.3 
 
 		 211 aa  213  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730302  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3505  YceI family protein  55.29 
 
 		 191 aa  209  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.781833 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3509  hypothetical protein  46.95 
 
 		 198 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.137598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2217  YceI family protein  47.25 
 
 		 199 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3992  YceI family protein  43.89 
 
 		 188 aa  158  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  43.88 
 
 		 192 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2669  YceI family protein  48.26 
 
 		 193 aa  156  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3736  YceI  44.91 
 
 		 218 aa  155  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.192641 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0232  YceI  47.67 
 
 		 193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145864  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0683  YceI family protein  47.67 
 
 		 193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0716  YceI family protein  47.67 
 
 		 193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.943663  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0704  YceI family protein  40.31 
 
 		 193 aa  151  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  normal  0.494453 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1519  YceI family protein  40.91 
 
 		 191 aa  149  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0631  YceI family protein  46.55 
 
 		 193 aa  148  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0607  YceI family protein  46.55 
 
 		 195 aa  148  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3804  hypothetical protein  45.93 
 
 		 211 aa  147  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  40.12 
 
 		 196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7381  YceI  46.2 
 
 		 187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398085  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3333  YceI  44.83 
 
 		 192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1273  YceI-like family protein  45.09 
 
 		 187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  42.7 
 
 		 189 aa  145  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2816  YceI  42.05 
 
 		 196 aa  144  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2568  hypothetical protein  44.51 
 
 		 192 aa  144  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1160  YceI-like family protein  44.51 
 
 		 192 aa  144  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3367  hypothetical protein  44.51 
 
 		 192 aa  144  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0298  hypothetical protein  44.51 
 
 		 192 aa  144  6e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2382  YceI-like family protein  44.51 
 
 		 187 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3377  YceI-like family protein  44.51 
 
 		 187 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  40.96 
 
 		 192 aa  142  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0830  YceI  43.37 
 
 		 199 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0387934  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3995  hypothetical protein  38.74 
 
 		 189 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645736  normal  0.347265 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2953  hypothetical protein  42.6 
 
 		 196 aa  143  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2551  YceI family protein  41.07 
 
 		 198 aa  141  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.298445 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2961  YceI family protein  41.07 
 
 		 198 aa  141  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  40.96 
 
 		 189 aa  140  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5860  YceI family protein  43.45 
 
 		 192 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2066  hypothetical protein  42.86 
 
 		 192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0648985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0806  YceI family protein  41.08 
 
 		 187 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0736  YceI family protein  41.86 
 
 		 187 aa  135  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.193865  normal  0.716983 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2717  signal peptide protein  38.69 
 
 		 198 aa  134  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.999831  normal  0.128957 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0790  signal peptide protein  40.66 
 
 		 189 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0815  hypothetical protein  40.61 
 
 		 197 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1536  YceI family protein  36.36 
 
 		 191 aa  130  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1150  periplasmic protein  39.36 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.138125  normal  0.79265 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1738  YceI family protein  36.36 
 
 		 188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3154  YceI  40.36 
 
 		 192 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0257242  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1721  YceI family protein  35.86 
 
 		 188 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  42.16 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0912  YceI  36.14 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580537  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1735  hypothetical protein  35.35 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1799  hypothetical protein  37.28 
 
 		 188 aa  124  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1782  YceI  36.99 
 
 		 204 aa  121  7e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0100028 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  37.72 
 
 		 205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  36.69 
 
 		 237 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  35.79 
 
 		 199 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  36.09 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  36 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  36 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  34.21 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  32.99 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  37.06 
 
 		 196 aa  106  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  35.09 
 
 		 254 aa  105  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  34.27 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  35.91 
 
 		 196 aa  105  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  35.26 
 
 		 206 aa  104  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  36.36 
 
 		 213 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  36.69 
 
 		 235 aa  102  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  30.85 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  34.94 
 
 		 202 aa  101  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  32.46 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  33.33 
 
 		 210 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3229  hypothetical protein  36.18 
 
 		 197 aa  99  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.474421  normal  0.780413 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  33.51 
 
 		 214 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03828  YceI  33.91 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  31.33 
 
 		 216 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  36.9 
 
 		 183 aa  96.3  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  34.05 
 
 		 205 aa  95.9  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  34.62 
 
 		 197 aa  95.9  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  41.07 
 
 		 178 aa  95.1  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  33.5 
 
 		 189 aa  95.1  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1680  YceI family protein  32.46 
 
 		 200 aa  95.1  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4161  YceI family protein  31.79 
 
 		 211 aa  95.1  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  32.43 
 
 		 212 aa  94.4  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  32.42 
 
 		 201 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  33.33 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  32.56 
 
 		 177 aa  93.6  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  30.73 
 
 		 197 aa  93.2  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  34.07 
 
 		 197 aa  93.6  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  35.47 
 
 		 183 aa  93.2  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0976  YceI  36.26 
 
 		 213 aa  93.2  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  32.04 
 
 		 188 aa  93.6  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  35.37 
 
 		 195 aa  93.2  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  31.79 
 
 		 193 aa  93.6  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  34.88 
 
 		 183 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0009  YceI like family protein  34.29 
 
 		 216 aa  92.8  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>