More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0359 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  100 
 
 		 235 aa  464  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  85.88 
 
 		 254 aa  302  3.0000000000000004e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  64.07 
 
 		 237 aa  282  3.0000000000000004e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  64.5 
 
 		 237 aa  281  7.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  52.15 
 
 		 201 aa  164  9e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1401  YceI family protein  48.78 
 
 		 190 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  46.2 
 
 		 206 aa  156  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  45.31 
 
 		 205 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  46.06 
 
 		 202 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0892  YceI family protein  47.56 
 
 		 193 aa  149  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  40.27 
 
 		 213 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  46.11 
 
 		 196 aa  149  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  45.45 
 
 		 205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  43.48 
 
 		 199 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1047  YceI  43.9 
 
 		 191 aa  144  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151047 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  42.26 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  42.08 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  41.07 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  39.23 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  42.77 
 
 		 205 aa  137  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2185  hypothetical protein  43.03 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  37.5 
 
 		 212 aa  135  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  39.46 
 
 		 213 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  41.92 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  42.01 
 
 		 193 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  42.54 
 
 		 214 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0976  YceI  43.68 
 
 		 213 aa  125  6e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  40.72 
 
 		 189 aa  122  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  37.5 
 
 		 213 aa  121  7e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  37.5 
 
 		 213 aa  121  7e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  40.68 
 
 		 196 aa  121  8e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  40.48 
 
 		 197 aa  120  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  43.6 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  40.48 
 
 		 197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  43.02 
 
 		 201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  41.01 
 
 		 200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  41.46 
 
 		 192 aa  118  7e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  32.47 
 
 		 216 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  33.33 
 
 		 216 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4023  YceI family protein  40.34 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3154  YceI  36.97 
 
 		 192 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0257242  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  43.62 
 
 		 195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3043  YceI family protein  36.09 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  37.87 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  42.44 
 
 		 201 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  40.12 
 
 		 180 aa  116  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  38.27 
 
 		 207 aa  115  6e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1519  YceI family protein  35.39 
 
 		 191 aa  115  7.999999999999999e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  36.57 
 
 		 177 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4161  YceI family protein  34.32 
 
 		 211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2265  YceI  40.45 
 
 		 219 aa  112  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  37.27 
 
 		 186 aa  112  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  40.22 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  39.66 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  39.66 
 
 		 223 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  38.65 
 
 		 179 aa  108  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  38.36 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0007  YceI like family protein  33.33 
 
 		 217 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  39.43 
 
 		 196 aa  105  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  36.72 
 
 		 187 aa  106  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  36.31 
 
 		 193 aa  106  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1154  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 217 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  36.84 
 
 		 182 aa  105  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0008  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 217 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0009  YceI like family protein  32.56 
 
 		 216 aa  105  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  38.82 
 
 		 183 aa  104  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3508  periplasmic protein  36.63 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.234261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  39.11 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1513  YceI-like family protein  34.46 
 
 		 185 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.137036  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0008  YceI like family protein  33.9 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0009  putative lipoprotein  33.9 
 
 		 199 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.686573  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1434  YceI like family protein  33.9 
 
 		 199 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.311091  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  36.53 
 
 		 195 aa  102  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  37.36 
 
 		 201 aa  102  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  39.47 
 
 		 204 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  38.55 
 
 		 201 aa  102  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  39.47 
 
 		 192 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  33.33 
 
 		 190 aa  101  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1028  YceI family protein  43.45 
 
 		 191 aa  101  9e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  38.82 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  35.29 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  35.76 
 
 		 189 aa  101  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  34.76 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  38.82 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  37.43 
 
 		 183 aa  101  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  34.64 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  34.23 
 
 		 182 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4488  YceI family protein  35.05 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.644863  normal  0.336697 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  42.76 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  42.76 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3514  YceI family protein  35.86 
 
 		 285 aa  99.8  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0687  hypothetical protein  33.14 
 
 		 234 aa  99.8  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  38.96 
 
 		 187 aa  99.4  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000194  hypothetical protein  38.41 
 
 		 176 aa  99  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352716  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0890  YceI  27.98 
 
 		 220 aa  99  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  35.76 
 
 		 189 aa  99  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  37.68 
 
 		 189 aa  98.6  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5437  YceI family protein  32.95 
 
 		 193 aa  98.6  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  36.84 
 
 		 182 aa  98.6  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  34.72 
 
 		 182 aa  98.6  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>