More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1519 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1519  YceI family protein  100 
 
 		 191 aa  390  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  60.61 
 
 		 189 aa  215  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  52.43 
 
 		 196 aa  214  5.9999999999999996e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  58.79 
 
 		 192 aa  204  4e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3154  YceI  43.09 
 
 		 192 aa  174  8e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0257242  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3508  periplasmic protein  41.76 
 
 		 196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.234261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0704  YceI family protein  40.59 
 
 		 193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  normal  0.494453 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  39.36 
 
 		 192 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  40.96 
 
 		 189 aa  142  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3995  hypothetical protein  39.76 
 
 		 189 aa  141  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645736  normal  0.347265 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2816  YceI  40.59 
 
 		 196 aa  140  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2953  hypothetical protein  41.42 
 
 		 196 aa  140  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0457  YceI family protein  41.27 
 
 		 189 aa  140  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2568  hypothetical protein  43.33 
 
 		 192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3367  hypothetical protein  43.33 
 
 		 192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2382  YceI-like family protein  43.33 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1160  YceI-like family protein  43.33 
 
 		 192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3377  YceI-like family protein  43.33 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1273  YceI-like family protein  44 
 
 		 187 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0298  hypothetical protein  43.33 
 
 		 192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3333  YceI  43.33 
 
 		 192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2961  YceI family protein  41.52 
 
 		 198 aa  138  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2717  signal peptide protein  39.53 
 
 		 198 aa  137  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.999831  normal  0.128957 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2551  YceI family protein  41.52 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.298445 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0631  YceI family protein  40.68 
 
 		 193 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3804  hypothetical protein  39.55 
 
 		 211 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3509  hypothetical protein  35.54 
 
 		 198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.137598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0607  YceI family protein  40.11 
 
 		 195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7381  YceI  43.84 
 
 		 187 aa  135  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398085  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0232  YceI  39.55 
 
 		 193 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145864  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1028  YceI family protein  40.1 
 
 		 191 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0716  YceI family protein  39.55 
 
 		 193 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.943663  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0683  YceI family protein  39.55 
 
 		 193 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2669  YceI family protein  38.46 
 
 		 193 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0912  YceI  35.98 
 
 		 188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580537  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3578  YceI family protein  40.24 
 
 		 192 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3736  YceI  34.73 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.192641 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  38.17 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0892  YceI family protein  39.06 
 
 		 193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3505  YceI family protein  38.69 
 
 		 191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.781833 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5860  YceI family protein  37.13 
 
 		 192 aa  124  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2066  hypothetical protein  36.31 
 
 		 192 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0648985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0469  YceI family protein  35.76 
 
 		 211 aa  123  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730302  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  37.06 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  36.47 
 
 		 237 aa  122  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2226  YceI family protein  35.98 
 
 		 192 aa  120  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000678562  decreased coverage  0.00447323 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  39.41 
 
 		 196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  38.24 
 
 		 254 aa  118  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0790  signal peptide protein  33.52 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1401  YceI family protein  37.72 
 
 		 190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0806  YceI family protein  31.72 
 
 		 187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  35.98 
 
 		 235 aa  112  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  33.15 
 
 		 197 aa  111  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  33.15 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0736  YceI family protein  31.89 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.193865  normal  0.716983 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0815  hypothetical protein  33.13 
 
 		 197 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  38.98 
 
 		 201 aa  108  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  38.42 
 
 		 201 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1047  YceI  34.72 
 
 		 191 aa  107  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151047 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  32.99 
 
 		 199 aa  104  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  32.64 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0830  YceI  30.99 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0387934  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1721  YceI family protein  31.55 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  31.55 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  37.27 
 
 		 205 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1738  YceI family protein  31.55 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1536  YceI family protein  31.55 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  34.83 
 
 		 206 aa  101  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  31.28 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1782  YceI  33.33 
 
 		 204 aa  101  8e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0100028 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1735  hypothetical protein  32.34 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1799  hypothetical protein  32.72 
 
 		 188 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2217  YceI family protein  32.29 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  36.21 
 
 		 201 aa  98.6  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  33.51 
 
 		 207 aa  98.6  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  34.34 
 
 		 202 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  36.21 
 
 		 223 aa  98.2  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  36 
 
 		 201 aa  97.8  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  32.58 
 
 		 186 aa  97.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  34.87 
 
 		 191 aa  96.3  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  34.87 
 
 		 191 aa  96.3  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  34.44 
 
 		 179 aa  95.9  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  35.12 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  34.16 
 
 		 207 aa  95.5  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3992  YceI family protein  30.91 
 
 		 188 aa  95.5  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  34.36 
 
 		 191 aa  94.7  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  34.36 
 
 		 191 aa  94.7  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  34.36 
 
 		 191 aa  94.7  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1032  hypothetical protein  39.17 
 
 		 132 aa  94.7  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.955101  normal  0.0986762 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  34.36 
 
 		 191 aa  94.7  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  34.36 
 
 		 191 aa  94.7  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  34.36 
 
 		 191 aa  94.7  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  34.36 
 
 		 191 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  29.7 
 
 		 210 aa  94.7  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  33.52 
 
 		 201 aa  94.4  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  34.36 
 
 		 191 aa  94.4  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1150  periplasmic protein  30.53 
 
 		 206 aa  93.6  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.138125  normal  0.79265 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  31.21 
 
 		 195 aa  93.6  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  33.85 
 
 		 191 aa  92.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  33.85 
 
 		 191 aa  92.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>