More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2265 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2265  YceI  100 
 
 		 219 aa  434  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0976  YceI  66.67 
 
 		 213 aa  251  7e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  49.26 
 
 		 202 aa  180  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  48.15 
 
 		 206 aa  180  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  49.28 
 
 		 205 aa  170  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  43.14 
 
 		 207 aa  154  9e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  41.78 
 
 		 199 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  44.86 
 
 		 213 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  43.41 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  42.2 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  43.41 
 
 		 213 aa  142  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  42.46 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  41.44 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  42.63 
 
 		 205 aa  137  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  40.88 
 
 		 212 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  41.28 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  41.28 
 
 		 237 aa  119  3e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0892  YceI family protein  42.01 
 
 		 193 aa  119  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1401  YceI family protein  39.88 
 
 		 190 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  38.21 
 
 		 201 aa  112  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1047  YceI  37.87 
 
 		 191 aa  111  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151047 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  35.96 
 
 		 196 aa  111  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  41.52 
 
 		 235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  41.38 
 
 		 191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  41.38 
 
 		 191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  41.38 
 
 		 191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2185  hypothetical protein  37.57 
 
 		 194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  41.38 
 
 		 191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  41.38 
 
 		 191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  41.38 
 
 		 191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4488  YceI family protein  40 
 
 		 252 aa  109  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.644863  normal  0.336697 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  40.8 
 
 		 191 aa  109  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  41.95 
 
 		 254 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  40.8 
 
 		 191 aa  108  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  40.8 
 
 		 191 aa  108  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  39.66 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  38.73 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  38.15 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  38.51 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  38.51 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  38.51 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  38.51 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5437  YceI family protein  36.41 
 
 		 193 aa  102  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4023  YceI family protein  39.78 
 
 		 242 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  37.93 
 
 		 191 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  37.36 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  36.53 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  36.53 
 
 		 192 aa  99.8  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  38.1 
 
 		 197 aa  99.4  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  32.55 
 
 		 201 aa  99  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  36.99 
 
 		 192 aa  98.6  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  37.5 
 
 		 197 aa  97.8  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5284  hypothetical protein  35.91 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.547725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0890  YceI  32.39 
 
 		 220 aa  97.4  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0834  YceI family protein  31.19 
 
 		 201 aa  97.8  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.929023  hitchhiker  0.00225936 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  35.23 
 
 		 192 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  35.23 
 
 		 204 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  35.67 
 
 		 192 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  35.67 
 
 		 192 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  35.67 
 
 		 192 aa  94  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  36.99 
 
 		 193 aa  93.6  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  34.66 
 
 		 192 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  32.74 
 
 		 219 aa  92.8  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  33.52 
 
 		 199 aa  92.4  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0950  hypothetical protein  35.63 
 
 		 190 aa  92  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000269923  normal  0.477847 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  34.09 
 
 		 192 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  34.09 
 
 		 192 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  33.52 
 
 		 192 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  34.46 
 
 		 183 aa  89  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  31.49 
 
 		 187 aa  88.6  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  30.94 
 
 		 188 aa  88.2  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1323  hypothetical protein  34.88 
 
 		 191 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00141701  normal  0.012746 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3055  hypothetical protein  34.88 
 
 		 191 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0011163  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1178  hypothetical protein  34.88 
 
 		 191 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000879388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1249  hypothetical protein  34.88 
 
 		 191 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00199018  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  36.72 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1179  hypothetical protein  34.88 
 
 		 191 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000115477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3198  hypothetical protein  34.88 
 
 		 191 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  32.18 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  33.9 
 
 		 192 aa  86.3  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3509  hypothetical protein  33.93 
 
 		 198 aa  86.7  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.137598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  34.46 
 
 		 183 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  35.03 
 
 		 183 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  33.16 
 
 		 209 aa  86.7  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3041  hypothetical protein  34.3 
 
 		 191 aa  86.3  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000749458  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03828  YceI  33.14 
 
 		 188 aa  85.9  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  30 
 
 		 193 aa  85.5  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  34.09 
 
 		 196 aa  85.5  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  31.71 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  33.12 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2359  YceI family protein  31.78 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  35.03 
 
 		 178 aa  84.3  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2702  hypothetical protein  34.3 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.120827  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  34.73 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  29.61 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  34.52 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7029  YceI family protein  32.02 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  28.49 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1121  hypothetical protein  34.3 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000345646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  34.62 
 
 		 183 aa  80.9  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>