More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2359 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2359  YceI family protein  100 
 
 		 193 aa  392  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0892  YceI family protein  38.3 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1047  YceI  37.76 
 
 		 191 aa  106  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151047 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1401  YceI family protein  37.57 
 
 		 190 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  37.87 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  34.41 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  36.07 
 
 		 205 aa  97.8  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  35.8 
 
 		 210 aa  97.8  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  34.21 
 
 		 191 aa  97.8  9e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  34.21 
 
 		 191 aa  97.8  9e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  34.21 
 
 		 191 aa  97.8  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  34.21 
 
 		 191 aa  97.8  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  34.21 
 
 		 191 aa  97.8  9e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  34.21 
 
 		 191 aa  97.8  9e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  34.21 
 
 		 191 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  33.68 
 
 		 191 aa  96.3  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  35.36 
 
 		 237 aa  96.7  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  33.68 
 
 		 191 aa  96.3  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  36.47 
 
 		 235 aa  95.1  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  36.09 
 
 		 212 aa  94.4  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  34.83 
 
 		 237 aa  94.4  9e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  38.1 
 
 		 254 aa  94.4  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  36.14 
 
 		 192 aa  92.8  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  33.91 
 
 		 191 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  35.2 
 
 		 192 aa  92.4  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  35.54 
 
 		 192 aa  92.4  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  33.91 
 
 		 191 aa  92  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  34.9 
 
 		 196 aa  91.7  7e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2185  hypothetical protein  35.48 
 
 		 194 aa  91.3  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  32.63 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  32.63 
 
 		 191 aa  89  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  32.63 
 
 		 191 aa  89  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  32.63 
 
 		 191 aa  89  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  32.63 
 
 		 191 aa  88.6  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  33.51 
 
 		 191 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  32.46 
 
 		 204 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  32.46 
 
 		 192 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  31.58 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  35.76 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4023  YceI family protein  31.03 
 
 		 242 aa  87.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  33.16 
 
 		 192 aa  87.8  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  32.46 
 
 		 192 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  34.36 
 
 		 182 aa  86.7  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  32.11 
 
 		 191 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  32.74 
 
 		 178 aa  87  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  32.94 
 
 		 202 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  31.58 
 
 		 197 aa  86.3  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  31.94 
 
 		 192 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  31.79 
 
 		 192 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  31.21 
 
 		 199 aa  84.7  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  32.18 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  33.11 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4488  YceI family protein  33.84 
 
 		 252 aa  83.2  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.644863  normal  0.336697 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  29.89 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  30.48 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1680  YceI family protein  31.69 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  30.73 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0469  hypothetical protein  29.69 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.189395  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2265  YceI  34.3 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1519  YceI family protein  30.05 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1317  hypothetical protein  30.69 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.269449  normal  0.532637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  33.15 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  30 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  30 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  30 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  31.18 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0443  hypothetical protein  29.69 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  28.95 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  31.46 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  30.65 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1217  hypothetical protein  29.41 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000670198  normal  0.302127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  30 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1536  hypothetical protein  29.69 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5284  hypothetical protein  30.96 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.547725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4161  YceI family protein  33.92 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  33.14 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  30.9 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  33.33 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  32.16 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  31.46 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1334  YceI  29.84 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000025527  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  30.9 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  32.76 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  31.46 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  28.98 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0976  YceI  33.72 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  32.29 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  30.99 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  32.14 
 
 		 174 aa  75.5  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3154  YceI  33.51 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0257242  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1739  hypothetical protein  29.71 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000033243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  32.6 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  30.64 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  29.38 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  32.54 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  34.64 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  30.11 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  33.33 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  29.94 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  32.95 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>