More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5284 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5284  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.547725  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  73.74 
 
 
192 aa  260  8e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  65.13 
 
 
191 aa  260  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  73.18 
 
 
192 aa  259  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  65.87 
 
 
204 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  67.86 
 
 
192 aa  241  7e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  67.68 
 
 
192 aa  237  9e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  66.67 
 
 
192 aa  235  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  66.16 
 
 
192 aa  234  6e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  58.16 
 
 
191 aa  218  7e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  55.05 
 
 
192 aa  217  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  57.14 
 
 
191 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  54.31 
 
 
191 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  54.31 
 
 
191 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  54.31 
 
 
191 aa  211  5.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  54.31 
 
 
191 aa  211  5.999999999999999e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  54.31 
 
 
191 aa  211  5.999999999999999e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  54.31 
 
 
191 aa  211  5.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  54.31 
 
 
191 aa  211  5.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  54.31 
 
 
191 aa  211  5.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1179  hypothetical protein  54.36 
 
 
191 aa  211  7e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000115477  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  53.81 
 
 
191 aa  210  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1178  hypothetical protein  54.87 
 
 
191 aa  210  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000879388  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  51.78 
 
 
192 aa  208  5e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1249  hypothetical protein  53.85 
 
 
191 aa  208  5e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00199018  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1323  hypothetical protein  53.33 
 
 
191 aa  207  7e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00141701  normal  0.012746 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3055  hypothetical protein  53.33 
 
 
191 aa  207  7e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0011163  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3041  hypothetical protein  53.85 
 
 
191 aa  207  7e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000749458  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  53.47 
 
 
191 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  53.47 
 
 
191 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  53.47 
 
 
191 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3198  hypothetical protein  53.33 
 
 
191 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  52.97 
 
 
191 aa  205  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  52.97 
 
 
191 aa  205  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2702  hypothetical protein  53.33 
 
 
191 aa  204  8e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.120827  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  50.51 
 
 
192 aa  203  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  50.51 
 
 
192 aa  203  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  50.51 
 
 
192 aa  203  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2890  hypothetical protein  54.19 
 
 
189 aa  202  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.11559  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  51.52 
 
 
192 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2875  hypothetical protein  52.31 
 
 
191 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367031  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2128  hypothetical protein  56.25 
 
 
191 aa  198  5e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000295006  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1217  hypothetical protein  52.04 
 
 
192 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000670198  normal  0.302127 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3370  hypothetical protein  52.82 
 
 
191 aa  191  6e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  49.49 
 
 
192 aa  191  6e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0950  hypothetical protein  48.21 
 
 
190 aa  191  7e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000269923  normal  0.477847 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  48.99 
 
 
192 aa  189  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03828  YceI  54.29 
 
 
188 aa  189  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1317  hypothetical protein  48.21 
 
 
191 aa  186  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.269449  normal  0.532637 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  50.79 
 
 
196 aa  186  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  48.22 
 
 
193 aa  186  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1121  hypothetical protein  50.83 
 
 
177 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000345646  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  45.95 
 
 
201 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  49.23 
 
 
189 aa  179  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3598  hypothetical protein  48.63 
 
 
199 aa  179  4e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05924  hypothetical protein  50.26 
 
 
189 aa  178  5.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  48 
 
 
198 aa  176  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  47.72 
 
 
189 aa  175  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000194  hypothetical protein  52.78 
 
 
176 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352716  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1739  hypothetical protein  43.9 
 
 
203 aa  157  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000033243  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  41.36 
 
 
179 aa  132  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  40.45 
 
 
213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  40.45 
 
 
213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  42.61 
 
 
196 aa  128  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  39.13 
 
 
202 aa  122  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  40.31 
 
 
201 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  41.38 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  38.8 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  35.6 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1831  YceI  38.18 
 
 
193 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.033679  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  37.43 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1026  YceI family protein  37.78 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  38.29 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  37.71 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  37.2 
 
 
214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  38.07 
 
 
212 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  37.43 
 
 
196 aa  109  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  39.22 
 
 
199 aa  109  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  37.28 
 
 
182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  34.94 
 
 
182 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  36.93 
 
 
186 aa  108  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  37.91 
 
 
196 aa  108  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  42.55 
 
 
219 aa  108  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  41.67 
 
 
195 aa  108  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  32.56 
 
 
182 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  38.6 
 
 
201 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  38.6 
 
 
201 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  38.6 
 
 
223 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  33.73 
 
 
183 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  40 
 
 
213 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  36.47 
 
 
182 aa  106  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  34.32 
 
 
183 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  36.18 
 
 
199 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  40.79 
 
 
195 aa  105  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1680  YceI family protein  37.16 
 
 
200 aa  105  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  33.93 
 
 
183 aa  104  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  29.28 
 
 
187 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  35.06 
 
 
177 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  39.43 
 
 
213 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  29.28 
 
 
188 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>