More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1821 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  392  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  392  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  392  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  80.63 
 
 		 192 aa  327  6e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  79.17 
 
 		 192 aa  324  4.0000000000000003e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  80.1 
 
 		 191 aa  323  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  80.1 
 
 		 191 aa  323  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  80.1 
 
 		 191 aa  323  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  79.58 
 
 		 191 aa  322  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  79.58 
 
 		 191 aa  321  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  78.53 
 
 		 191 aa  319  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  78.53 
 
 		 191 aa  319  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  78.53 
 
 		 191 aa  319  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  78.53 
 
 		 191 aa  319  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  78.53 
 
 		 191 aa  319  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  78.53 
 
 		 191 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  78.01 
 
 		 191 aa  318  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  78.01 
 
 		 191 aa  317  5e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  78.01 
 
 		 191 aa  317  5e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  77.6 
 
 		 192 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  77.08 
 
 		 192 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  77.89 
 
 		 191 aa  301  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  77.37 
 
 		 191 aa  300  8.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  72.4 
 
 		 192 aa  299  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  62.83 
 
 		 191 aa  254  6e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  64.92 
 
 		 192 aa  245  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1217  hypothetical protein  57.07 
 
 		 192 aa  221  6e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000670198  normal  0.302127 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1323  hypothetical protein  56.84 
 
 		 191 aa  220  8e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00141701  normal  0.012746 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3055  hypothetical protein  56.84 
 
 		 191 aa  220  8e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0011163  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1249  hypothetical protein  56.32 
 
 		 191 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00199018  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3041  hypothetical protein  56.84 
 
 		 191 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000749458  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3198  hypothetical protein  56.32 
 
 		 191 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1179  hypothetical protein  56.32 
 
 		 191 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000115477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1178  hypothetical protein  56.32 
 
 		 191 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000879388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1317  hypothetical protein  55.26 
 
 		 191 aa  216  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.269449  normal  0.532637 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2702  hypothetical protein  55.79 
 
 		 191 aa  216  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.120827  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03828  YceI  59.76 
 
 		 188 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  52.6 
 
 		 193 aa  212  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0950  hypothetical protein  56.52 
 
 		 190 aa  209  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000269923  normal  0.477847 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3598  hypothetical protein  54.34 
 
 		 199 aa  209  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1121  hypothetical protein  58.38 
 
 		 177 aa  208  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000345646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2875  hypothetical protein  53.16 
 
 		 191 aa  206  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367031  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5284  hypothetical protein  50.51 
 
 		 208 aa  203  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.547725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  53.89 
 
 		 192 aa  202  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3370  hypothetical protein  56.32 
 
 		 191 aa  201  4e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  53.37 
 
 		 192 aa  201  8e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2890  hypothetical protein  53.18 
 
 		 189 aa  199  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.11559  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2128  hypothetical protein  57.99 
 
 		 191 aa  198  5e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000295006  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  53.26 
 
 		 196 aa  197  6e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1739  hypothetical protein  51.27 
 
 		 203 aa  194  9e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000033243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  52.33 
 
 		 192 aa  193  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  49.47 
 
 		 189 aa  192  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  51.81 
 
 		 192 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  51.81 
 
 		 192 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  51.81 
 
 		 204 aa  191  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  48.95 
 
 		 189 aa  182  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05924  hypothetical protein  48.95 
 
 		 189 aa  181  4.0000000000000006e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  50 
 
 		 198 aa  181  4.0000000000000006e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000194  hypothetical protein  52.63 
 
 		 176 aa  180  9.000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352716  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  43.33 
 
 		 201 aa  170  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  43.41 
 
 		 179 aa  153  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  44.97 
 
 		 196 aa  141  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  38.65 
 
 		 183 aa  134  8e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  39.26 
 
 		 183 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  39.51 
 
 		 183 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  36.9 
 
 		 182 aa  128  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  37.32 
 
 		 182 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  38.07 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  38.07 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  40.32 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  38.82 
 
 		 187 aa  118  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  37.97 
 
 		 188 aa  117  7.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  40.61 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  41.18 
 
 		 183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  38.6 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  40 
 
 		 199 aa  115  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  39.52 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  39.6 
 
 		 196 aa  115  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  38.98 
 
 		 182 aa  114  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3514  YceI family protein  39.71 
 
 		 285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  40 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  41.43 
 
 		 182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  39.24 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  35.63 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  37.37 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1264  YceI family protein  37.24 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  37.59 
 
 		 182 aa  111  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  35.42 
 
 		 214 aa  111  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  41.3 
 
 		 177 aa  111  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  38.69 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  36.36 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  39.13 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  40.61 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  37.68 
 
 		 182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  38.3 
 
 		 189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  39.49 
 
 		 180 aa  108  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  33.73 
 
 		 177 aa  109  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  38.51 
 
 		 219 aa  108  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  37.35 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  37.35 
 
 		 201 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>