More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2128 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2128  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  386  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000295006  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2875  hypothetical protein  76.44 
 
 		 191 aa  307  5.9999999999999995e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367031  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1178  hypothetical protein  73.3 
 
 		 191 aa  295  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000879388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1179  hypothetical protein  73.3 
 
 		 191 aa  294  5e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000115477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3041  hypothetical protein  72.77 
 
 		 191 aa  292  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000749458  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1323  hypothetical protein  72.77 
 
 		 191 aa  292  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00141701  normal  0.012746 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3055  hypothetical protein  72.77 
 
 		 191 aa  292  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0011163  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1317  hypothetical protein  73.3 
 
 		 191 aa  291  3e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.269449  normal  0.532637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1249  hypothetical protein  72.77 
 
 		 191 aa  291  4e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00199018  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3198  hypothetical protein  72.25 
 
 		 191 aa  290  6e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2702  hypothetical protein  72.25 
 
 		 191 aa  290  1e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.120827  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1217  hypothetical protein  73.82 
 
 		 192 aa  288  3e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000670198  normal  0.302127 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3370  hypothetical protein  71.73 
 
 		 191 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1121  hypothetical protein  71.19 
 
 		 177 aa  264  7e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000345646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0950  hypothetical protein  63.35 
 
 		 190 aa  244  4.9999999999999997e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000269923  normal  0.477847 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  59.16 
 
 		 189 aa  239  2.9999999999999997e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03828  YceI  62.57 
 
 		 188 aa  234  7e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  58.12 
 
 		 189 aa  229  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05924  hypothetical protein  58.64 
 
 		 189 aa  225  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  66.67 
 
 		 191 aa  225  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  66.67 
 
 		 191 aa  224  6e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2890  hypothetical protein  62.35 
 
 		 189 aa  224  7e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.11559  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  59.16 
 
 		 191 aa  223  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  63.53 
 
 		 192 aa  220  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000194  hypothetical protein  60.11 
 
 		 176 aa  214  5.9999999999999996e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352716  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  56.54 
 
 		 192 aa  214  8e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  56.02 
 
 		 191 aa  213  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  56.02 
 
 		 191 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  56.02 
 
 		 191 aa  213  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  56.02 
 
 		 191 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  56.02 
 
 		 191 aa  213  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  56.02 
 
 		 191 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  56.02 
 
 		 191 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  56.02 
 
 		 191 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  56.02 
 
 		 191 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  56.02 
 
 		 191 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  56.02 
 
 		 191 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  55.5 
 
 		 191 aa  211  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  55.5 
 
 		 191 aa  211  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  55.5 
 
 		 191 aa  211  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  52.33 
 
 		 193 aa  210  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  54.64 
 
 		 196 aa  209  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5284  hypothetical protein  54.36 
 
 		 208 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.547725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  54.17 
 
 		 192 aa  205  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  54.74 
 
 		 192 aa  205  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  54.74 
 
 		 192 aa  205  4e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  54.74 
 
 		 192 aa  205  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  54.74 
 
 		 192 aa  203  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3598  hypothetical protein  51.14 
 
 		 199 aa  202  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  53.65 
 
 		 192 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  53.65 
 
 		 192 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  55.88 
 
 		 192 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  55.88 
 
 		 192 aa  193  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  54.71 
 
 		 204 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  54.71 
 
 		 192 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  54.12 
 
 		 192 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  50.28 
 
 		 198 aa  181  5.0000000000000004e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  53.53 
 
 		 192 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  44.57 
 
 		 201 aa  175  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1739  hypothetical protein  50.89 
 
 		 203 aa  163  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000033243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  45.41 
 
 		 179 aa  152  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  38.86 
 
 		 214 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  36 
 
 		 213 aa  117  7e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  36 
 
 		 213 aa  117  7e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  38.82 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  38.99 
 
 		 183 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  36.97 
 
 		 183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  38.13 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  37.58 
 
 		 183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  37.2 
 
 		 182 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  38.54 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3514  YceI family protein  40.51 
 
 		 285 aa  113  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3229  hypothetical protein  36.9 
 
 		 197 aa  112  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.474421  normal  0.780413 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  39.09 
 
 		 197 aa  112  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  38.64 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  38.8 
 
 		 201 aa  112  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  39.88 
 
 		 201 aa  111  6e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  37.95 
 
 		 195 aa  111  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  36.16 
 
 		 187 aa  110  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  39.26 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  36.16 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  37.68 
 
 		 186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  37.93 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  38.65 
 
 		 201 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  38.22 
 
 		 201 aa  108  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  37.79 
 
 		 196 aa  108  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  36.62 
 
 		 182 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  37.02 
 
 		 178 aa  107  9.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  38.22 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  33.71 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  36.87 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1026  YceI family protein  33.72 
 
 		 225 aa  106  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  40.58 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  38.46 
 
 		 182 aa  106  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  40.85 
 
 		 177 aa  105  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  34.78 
 
 		 182 aa  105  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  36.75 
 
 		 182 aa  105  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  37.5 
 
 		 181 aa  104  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  36.88 
 
 		 183 aa  104  8e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  35.09 
 
 		 186 aa  104  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>