More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4981 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  97.92 
 
 		 192 aa  359  2e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  97.4 
 
 		 192 aa  357  5e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  84.38 
 
 		 192 aa  308  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  83.85 
 
 		 192 aa  307  6.999999999999999e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5284  hypothetical protein  66.35 
 
 		 208 aa  266  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.547725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  67.19 
 
 		 191 aa  254  5e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  70.83 
 
 		 192 aa  243  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  58.33 
 
 		 191 aa  226  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  58.33 
 
 		 191 aa  226  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  58.33 
 
 		 191 aa  226  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  58.33 
 
 		 191 aa  226  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  58.33 
 
 		 191 aa  226  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  58.33 
 
 		 191 aa  226  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  58.33 
 
 		 191 aa  226  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  58.33 
 
 		 191 aa  226  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  57.81 
 
 		 191 aa  225  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  56.77 
 
 		 192 aa  222  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  56.25 
 
 		 191 aa  220  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  56.25 
 
 		 191 aa  220  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  56.25 
 
 		 191 aa  220  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  60.94 
 
 		 191 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  60.94 
 
 		 191 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  55.73 
 
 		 191 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  55.73 
 
 		 191 aa  218  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  56.99 
 
 		 192 aa  216  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  51.81 
 
 		 192 aa  205  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  51.81 
 
 		 192 aa  205  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  51.81 
 
 		 192 aa  205  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  53.37 
 
 		 192 aa  203  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  52.63 
 
 		 189 aa  199  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3198  hypothetical protein  52.08 
 
 		 191 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1323  hypothetical protein  50.79 
 
 		 191 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00141701  normal  0.012746 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3055  hypothetical protein  50.79 
 
 		 191 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0011163  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3041  hypothetical protein  50.79 
 
 		 191 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000749458  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1179  hypothetical protein  50.26 
 
 		 191 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000115477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  54.4 
 
 		 192 aa  195  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1178  hypothetical protein  50.26 
 
 		 191 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000879388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  51.58 
 
 		 189 aa  194  6e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1249  hypothetical protein  50.26 
 
 		 191 aa  194  6e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00199018  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2890  hypothetical protein  55.75 
 
 		 189 aa  193  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.11559  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03828  YceI  57.65 
 
 		 188 aa  194  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  53.89 
 
 		 192 aa  192  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2702  hypothetical protein  49.74 
 
 		 191 aa  189  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.120827  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  51.72 
 
 		 198 aa  187  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1217  hypothetical protein  49.48 
 
 		 192 aa  186  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000670198  normal  0.302127 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  48.19 
 
 		 193 aa  186  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05924  hypothetical protein  51.58 
 
 		 189 aa  186  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000194  hypothetical protein  55.56 
 
 		 176 aa  185  5e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352716  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0950  hypothetical protein  49.22 
 
 		 190 aa  185  5e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000269923  normal  0.477847 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2128  hypothetical protein  54.71 
 
 		 191 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000295006  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3598  hypothetical protein  48.94 
 
 		 199 aa  181  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2875  hypothetical protein  47.12 
 
 		 191 aa  181  6e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367031  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1121  hypothetical protein  54.6 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000345646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1317  hypothetical protein  46.6 
 
 		 191 aa  177  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.269449  normal  0.532637 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3370  hypothetical protein  50 
 
 		 191 aa  177  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  48.11 
 
 		 196 aa  174  8e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1739  hypothetical protein  45 
 
 		 203 aa  164  6.9999999999999995e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000033243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  40.96 
 
 		 201 aa  154  9e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  47.19 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  47.33 
 
 		 196 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  42.78 
 
 		 179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  42.2 
 
 		 213 aa  137  7e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  42.2 
 
 		 213 aa  137  7e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  38.79 
 
 		 183 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  39.39 
 
 		 183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  45.26 
 
 		 183 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  34.09 
 
 		 187 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  41.46 
 
 		 202 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  38.69 
 
 		 205 aa  118  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  34.09 
 
 		 188 aa  118  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  40.14 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  41.18 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  33.15 
 
 		 182 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  39.22 
 
 		 209 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  41.18 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  37.58 
 
 		 199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  38.82 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  34.94 
 
 		 177 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  41.78 
 
 		 182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  40.52 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  37.06 
 
 		 182 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  38.33 
 
 		 197 aa  111  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  36.94 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  38.33 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  36.41 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  29.73 
 
 		 184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  41.72 
 
 		 196 aa  109  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  39.29 
 
 		 189 aa  109  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1680  YceI family protein  33.91 
 
 		 200 aa  109  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4023  YceI family protein  38.51 
 
 		 242 aa  108  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  41.3 
 
 		 219 aa  107  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  37.27 
 
 		 182 aa  107  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  35.79 
 
 		 195 aa  107  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  36.91 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  35.48 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  30.95 
 
 		 182 aa  105  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1401  YceI family protein  37.28 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  36.99 
 
 		 175 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>