More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0081 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  100 
 
 		 188 aa  377  1e-104  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1334  YceI  48.11 
 
 		 189 aa  178  4e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000025527  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0443  hypothetical protein  46.32 
 
 		 190 aa  169  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0469  hypothetical protein  45.79 
 
 		 190 aa  167  7e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.189395  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1536  hypothetical protein  46.84 
 
 		 190 aa  166  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0727  conserved hypothetical protein, YceI family  44.62 
 
 		 190 aa  159  2e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0212414  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  41.07 
 
 		 177 aa  135  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  39.41 
 
 		 183 aa  132  3e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  44.24 
 
 		 174 aa  128  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  37.42 
 
 		 178 aa  127  7.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  42.08 
 
 		 196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  40.12 
 
 		 182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  40.64 
 
 		 191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  39.38 
 
 		 192 aa  125  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  37.87 
 
 		 187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  40.86 
 
 		 195 aa  125  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  40.11 
 
 		 191 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  40.11 
 
 		 191 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  40.11 
 
 		 191 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  41.42 
 
 		 175 aa  124  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  40.35 
 
 		 177 aa  124  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1264  YceI family protein  38.25 
 
 		 185 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  39.57 
 
 		 191 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  35.12 
 
 		 183 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  34.76 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  35.71 
 
 		 183 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  40.12 
 
 		 181 aa  122  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  36.31 
 
 		 183 aa  121  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  40.35 
 
 		 183 aa  121  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  39.18 
 
 		 187 aa  120  8e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  38.5 
 
 		 189 aa  120  8e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  37.78 
 
 		 198 aa  120  9e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  38.34 
 
 		 191 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  35.5 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  38.34 
 
 		 191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  38.34 
 
 		 191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  38.5 
 
 		 191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  38.34 
 
 		 191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  38.34 
 
 		 191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  38.5 
 
 		 191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  38.34 
 
 		 191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1711  YceI family protein  39.66 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  35.33 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  38.34 
 
 		 191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  36.53 
 
 		 182 aa  119  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  37.87 
 
 		 182 aa  119  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  38.6 
 
 		 182 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  38.6 
 
 		 182 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  38.6 
 
 		 182 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  39.16 
 
 		 175 aa  118  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  37.97 
 
 		 192 aa  117  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  37.97 
 
 		 192 aa  117  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  37.97 
 
 		 192 aa  117  7e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  39.16 
 
 		 182 aa  117  7.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  38.46 
 
 		 181 aa  117  7.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0195  YceI family protein  38.46 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  38.24 
 
 		 186 aa  115  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  36.87 
 
 		 201 aa  114  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  36.59 
 
 		 183 aa  114  6e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  36.09 
 
 		 181 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  38.92 
 
 		 193 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  34.76 
 
 		 195 aa  114  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4058  YceI family protein  40 
 
 		 176 aa  114  8.999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.675999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  37.21 
 
 		 195 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  37.71 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  37.04 
 
 		 177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  37.28 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  33.72 
 
 		 182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24290  hypothetical protein  35.93 
 
 		 176 aa  112  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0570577  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  35.16 
 
 		 190 aa  112  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  39.88 
 
 		 197 aa  112  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  33.66 
 
 		 213 aa  111  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  33.66 
 
 		 213 aa  111  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4627  YceI family protein  40.59 
 
 		 175 aa  111  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  39.88 
 
 		 197 aa  111  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  36.7 
 
 		 192 aa  111  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  36.99 
 
 		 196 aa  111  8.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  35.88 
 
 		 178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  34.34 
 
 		 182 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  36.9 
 
 		 192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  34.52 
 
 		 201 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  36.99 
 
 		 201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  33.93 
 
 		 184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  38.24 
 
 		 182 aa  108  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  34.73 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  34.73 
 
 		 223 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  36.53 
 
 		 177 aa  108  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  37.87 
 
 		 209 aa  107  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  36.47 
 
 		 212 aa  107  8.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2032  YceI  35.47 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.267829  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  33.73 
 
 		 180 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  36.97 
 
 		 175 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  36.96 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3656  YceI family protein  36.47 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0464334  normal  0.0393691 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  30.18 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0564  hypothetical protein  39.88 
 
 		 174 aa  105  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0475935  normal  0.512882 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  36.63 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  37.13 
 
 		 192 aa  105  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  33.54 
 
 		 181 aa  105  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  32.26 
 
 		 199 aa  104  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>