More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0892 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0892  YceI family protein  100 
 
 		 193 aa  387  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2185  hypothetical protein  47.85 
 
 		 194 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1401  YceI family protein  51.19 
 
 		 190 aa  174  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1047  YceI  48.19 
 
 		 191 aa  171  6.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151047 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  49.41 
 
 		 196 aa  152  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  48.8 
 
 		 254 aa  150  8.999999999999999e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  44.15 
 
 		 201 aa  149  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  47.56 
 
 		 235 aa  148  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  45.12 
 
 		 237 aa  147  6e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  45.12 
 
 		 237 aa  147  8e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  40.85 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  42.94 
 
 		 212 aa  139  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  44.64 
 
 		 205 aa  134  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0976  YceI  47.34 
 
 		 213 aa  133  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  39.49 
 
 		 202 aa  131  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1519  YceI family protein  39.06 
 
 		 191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  40.34 
 
 		 213 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  40.1 
 
 		 197 aa  123  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  39.34 
 
 		 206 aa  122  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  42.01 
 
 		 197 aa  121  5e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  40 
 
 		 205 aa  121  7e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  40.37 
 
 		 205 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  42.77 
 
 		 192 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  39.13 
 
 		 207 aa  118  6e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2265  YceI  42.01 
 
 		 219 aa  118  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  36.32 
 
 		 199 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  39.26 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  41.67 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  37.77 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  36.21 
 
 		 206 aa  115  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  39.38 
 
 		 207 aa  115  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3154  YceI  38.46 
 
 		 192 aa  115  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0257242  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  38.04 
 
 		 209 aa  115  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  38.65 
 
 		 213 aa  115  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  37.3 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  39.18 
 
 		 200 aa  111  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  40.31 
 
 		 191 aa  110  9e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  40.31 
 
 		 191 aa  110  9e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  39.47 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  39.47 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  39.47 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  39.47 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  39.47 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  39.47 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2359  YceI family protein  38.3 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  38.95 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  40.78 
 
 		 214 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3043  YceI family protein  32.98 
 
 		 210 aa  108  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  36.57 
 
 		 182 aa  108  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  35.42 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  38.42 
 
 		 191 aa  104  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  38.42 
 
 		 191 aa  104  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  38.42 
 
 		 191 aa  104  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  38.42 
 
 		 191 aa  104  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3333  YceI  39.77 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0687  hypothetical protein  34.13 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1273  YceI-like family protein  40.23 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  40 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  40 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4023  YceI family protein  40.7 
 
 		 242 aa  102  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2382  YceI-like family protein  39.66 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3377  YceI-like family protein  39.66 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  40 
 
 		 223 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2568  hypothetical protein  39.66 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0298  hypothetical protein  39.66 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  37.02 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1160  YceI-like family protein  39.66 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3367  hypothetical protein  39.66 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  38.98 
 
 		 201 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  37.89 
 
 		 191 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2669  YceI family protein  38.98 
 
 		 193 aa  102  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0604  YceI family protein  34.13 
 
 		 234 aa  101  6e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  34.81 
 
 		 187 aa  101  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  39.16 
 
 		 179 aa  99.8  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  39.55 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  34.74 
 
 		 195 aa  99.8  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  33.51 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  40.8 
 
 		 201 aa  99.8  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  36.32 
 
 		 192 aa  99.4  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  36.46 
 
 		 192 aa  99  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3804  hypothetical protein  37.85 
 
 		 211 aa  98.6  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4161  YceI family protein  32.53 
 
 		 211 aa  98.6  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  34.38 
 
 		 191 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3509  hypothetical protein  32.74 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.137598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  34.86 
 
 		 177 aa  97.8  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  35.79 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  35.79 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  35.79 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  35.42 
 
 		 192 aa  96.3  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  34.39 
 
 		 189 aa  96.7  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  31.79 
 
 		 216 aa  95.9  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2717  signal peptide protein  36.21 
 
 		 198 aa  95.5  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.999831  normal  0.128957 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  31.95 
 
 		 216 aa  95.5  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1334  YceI  37.56 
 
 		 189 aa  95.5  4e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000025527  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  35.39 
 
 		 191 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  36.31 
 
 		 191 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0683  YceI family protein  36.72 
 
 		 193 aa  94.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0232  YceI  36.72 
 
 		 193 aa  94.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0716  YceI family protein  36.72 
 
 		 193 aa  94.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.943663  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  38.69 
 
 		 192 aa  94.7  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>