More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1371 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  100 
 
 		 212 aa  427  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  72.38 
 
 		 209 aa  279  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  68.59 
 
 		 213 aa  272  3e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  68.39 
 
 		 213 aa  271  7e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  66.67 
 
 		 210 aa  248  6e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  47.73 
 
 		 206 aa  185  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  44.5 
 
 		 202 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  43.06 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  40.93 
 
 		 205 aa  165  5e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  43.22 
 
 		 205 aa  165  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  40.28 
 
 		 199 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  40.54 
 
 		 213 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  41.46 
 
 		 196 aa  155  6e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  39.61 
 
 		 205 aa  152  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  42.07 
 
 		 201 aa  143  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  38.24 
 
 		 237 aa  141  8e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0892  YceI family protein  42.94 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  38.24 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  42.5 
 
 		 197 aa  139  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  42.5 
 
 		 197 aa  138  6e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1401  YceI family protein  41.98 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2265  YceI  40.88 
 
 		 219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  39.63 
 
 		 207 aa  135  5e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  39.02 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  39.29 
 
 		 254 aa  132  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  34.76 
 
 		 216 aa  132  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0976  YceI  41.76 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  36.97 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  34.29 
 
 		 216 aa  125  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4023  YceI family protein  41.34 
 
 		 242 aa  125  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5437  YceI family protein  36.93 
 
 		 193 aa  124  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  42.33 
 
 		 201 aa  124  8.000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0890  YceI  33.15 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4161  YceI family protein  36.31 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1047  YceI  38.04 
 
 		 191 aa  123  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151047 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  40.85 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2185  hypothetical protein  39.62 
 
 		 194 aa  120  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  35.78 
 
 		 191 aa  115  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  38.96 
 
 		 192 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  38.96 
 
 		 192 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0834  YceI family protein  36.72 
 
 		 201 aa  114  7.999999999999999e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.929023  hitchhiker  0.00225936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  38.82 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  38.82 
 
 		 192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  31.28 
 
 		 213 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  31.28 
 
 		 213 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  38.82 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  38.16 
 
 		 192 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4488  YceI family protein  36.32 
 
 		 252 aa  112  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.644863  normal  0.336697 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  36.31 
 
 		 200 aa  111  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0007  YceI like family protein  36 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5284  hypothetical protein  38.07 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.547725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1154  putative lipoprotein  36 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1434  YceI like family protein  36.69 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.311091  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  37.65 
 
 		 192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0008  putative lipoprotein  36 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0009  putative lipoprotein  36.69 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.686573  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0008  YceI like family protein  36.69 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1680  YceI family protein  34.97 
 
 		 200 aa  109  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0009  YceI like family protein  33.91 
 
 		 216 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  35.8 
 
 		 189 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1513  YceI-like family protein  36.09 
 
 		 185 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.137036  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  39.33 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  37.95 
 
 		 196 aa  105  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  37.95 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0604  YceI family protein  36.59 
 
 		 234 aa  105  4e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  37.65 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3509  hypothetical protein  39.26 
 
 		 198 aa  105  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.137598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  37.65 
 
 		 191 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2875  hypothetical protein  35.26 
 
 		 191 aa  105  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367031  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0765  YceI family protein  33.91 
 
 		 204 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3043  YceI family protein  34.68 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2890  hypothetical protein  37.5 
 
 		 189 aa  104  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.11559  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  35.75 
 
 		 182 aa  104  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  35.19 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  34.52 
 
 		 177 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  34.46 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0687  hypothetical protein  35.37 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  28.57 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1179  hypothetical protein  35.84 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000115477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1249  hypothetical protein  35.84 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00199018  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  35.26 
 
 		 198 aa  102  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1178  hypothetical protein  35.84 
 
 		 191 aa  102  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000879388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  36.09 
 
 		 195 aa  102  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  33.9 
 
 		 201 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  33.9 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  31.61 
 
 		 182 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2702  hypothetical protein  36.36 
 
 		 191 aa  99.8  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.120827  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2128  hypothetical protein  37.66 
 
 		 191 aa  99.8  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000295006  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  31.18 
 
 		 187 aa  99.4  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  37.5 
 
 		 192 aa  99.8  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  37.5 
 
 		 192 aa  99.8  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  37.5 
 
 		 192 aa  99.8  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  37.5 
 
 		 192 aa  99.8  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  35.38 
 
 		 199 aa  99.8  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3041  hypothetical protein  33.73 
 
 		 191 aa  99.4  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000749458  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  35.23 
 
 		 183 aa  99.4  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  36.21 
 
 		 182 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  38.06 
 
 		 181 aa  99.4  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  36.21 
 
 		 182 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  36.21 
 
 		 182 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>