More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1917 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  423  1e-118  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  96.45 
 
 		 207 aa  396  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1848  YceI  49.12 
 
 		 200 aa  181  7e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.735332 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1515  YceI family protein  37.89 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.601487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  43.11 
 
 		 196 aa  143  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  39.63 
 
 		 212 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  43.11 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  40.12 
 
 		 237 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  39.08 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  38.71 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1047  YceI  33.86 
 
 		 191 aa  123  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151047 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  39.75 
 
 		 202 aa  121  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  38.36 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0765  YceI family protein  35.88 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  38.36 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  36.68 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  34.34 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  37.2 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0892  YceI family protein  39.13 
 
 		 193 aa  118  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1401  YceI family protein  36.53 
 
 		 190 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  39.39 
 
 		 254 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  35.56 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  34.01 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1680  YceI family protein  34.88 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  38.51 
 
 		 205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  39.89 
 
 		 201 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  39.89 
 
 		 223 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  35.37 
 
 		 209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  37.87 
 
 		 235 aa  115  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  38.25 
 
 		 179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  34.36 
 
 		 189 aa  115  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  38.69 
 
 		 177 aa  115  6.9999999999999995e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  39.33 
 
 		 201 aa  114  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  38.36 
 
 		 205 aa  111  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  37.87 
 
 		 189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  33.5 
 
 		 199 aa  109  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  32.37 
 
 		 193 aa  109  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  37.93 
 
 		 201 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2185  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  108  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0443  hypothetical protein  32.26 
 
 		 190 aa  108  6e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3598  hypothetical protein  38.42 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0469  hypothetical protein  31.72 
 
 		 190 aa  107  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.189395  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3995  hypothetical protein  34.05 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645736  normal  0.347265 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  30.23 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  34.02 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  38.04 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  35.06 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  30.23 
 
 		 216 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03828  YceI  39.39 
 
 		 188 aa  105  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  33.72 
 
 		 182 aa  105  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  35.05 
 
 		 192 aa  105  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  35.9 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  34.67 
 
 		 191 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  35.79 
 
 		 197 aa  105  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  34.67 
 
 		 191 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  34.67 
 
 		 191 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  37.27 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  32.82 
 
 		 193 aa  105  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1536  hypothetical protein  31.72 
 
 		 190 aa  105  7e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  35.76 
 
 		 192 aa  104  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  32.96 
 
 		 201 aa  104  8e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  36.31 
 
 		 187 aa  104  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1519  YceI family protein  32.64 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  35.6 
 
 		 192 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  35.6 
 
 		 192 aa  104  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  37.04 
 
 		 201 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  35.6 
 
 		 192 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  37.17 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0704  YceI family protein  33.51 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  normal  0.494453 
 
 
-
 
NC_003296  RS03182  signal peptide protein  33.13 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  36.13 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  36.07 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  34.03 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2217  YceI family protein  33.16 
 
 		 199 aa  102  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275332  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  34.87 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  34.87 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  34.87 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  34.87 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  36.96 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  34.87 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  36.79 
 
 		 192 aa  102  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  34.87 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  36.02 
 
 		 196 aa  102  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  34.87 
 
 		 184 aa  102  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  34.48 
 
 		 188 aa  102  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  34.64 
 
 		 181 aa  101  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  34.36 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3736  YceI  30.95 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.192641 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  34.36 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2451  YceI family protein  33.53 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  33.51 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  34.36 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  35.08 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  29.84 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  31.64 
 
 		 196 aa  99.8  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  36.22 
 
 		 192 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3229  hypothetical protein  31.89 
 
 		 197 aa  99.4  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.474421  normal  0.780413 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  32.42 
 
 		 181 aa  99.8  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0727  conserved hypothetical protein, YceI family  32.12 
 
 		 190 aa  99.4  3e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0212414  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  32.18 
 
 		 213 aa  99  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>