298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1515 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1515  YceI family protein  100 
 
 		 202 aa  413  1e-114  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.601487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1848  YceI  50.56 
 
 		 200 aa  185  4e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.735332 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  37.89 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  38.2 
 
 		 207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  29.27 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  32.37 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  30.89 
 
 		 214 aa  84.7  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  31.11 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  31.11 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0765  YceI family protein  29.55 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  28.04 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0067  YceI family protein  25.93 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  28.86 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  27.49 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  27.7 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  28.3 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  25.6 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  27.37 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  29.63 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  28.21 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1680  YceI family protein  29.94 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03182  signal peptide protein  26.83 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2451  YceI family protein  27.5 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  27.89 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1026  YceI family protein  30.64 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  31.25 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  31.09 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  31.22 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  25.13 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  27.27 
 
 		 186 aa  74.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  29.7 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  29.7 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  26.32 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  29.7 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  29.41 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  29.41 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  29.03 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  33.58 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  29.41 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  29.41 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  29.09 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  29.03 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  29.03 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  34.62 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  34.62 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  29.09 
 
 		 192 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  34.62 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  34.62 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  34.62 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  29.09 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  34.62 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  34.62 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  34.62 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  27.67 
 
 		 182 aa  72  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  29.19 
 
 		 191 aa  72  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  29.66 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  29.66 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  29.66 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  26.62 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  28.08 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  27.89 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2505  YceI family protein  26.53 
 
 		 179 aa  70.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0958427 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  25.15 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  33.85 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2702  hypothetical protein  31.34 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.120827  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  31.76 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  27.37 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  23.7 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  28.48 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3297  hypothetical protein  28.28 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.019174  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  27.38 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2128  hypothetical protein  31.07 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000295006  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  24.83 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  27.06 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1323  hypothetical protein  27.98 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00141701  normal  0.012746 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3198  hypothetical protein  27.98 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3055  hypothetical protein  27.98 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0011163  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  24.6 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4627  YceI family protein  27.33 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  25.4 
 
 		 191 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5284  hypothetical protein  28.14 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.547725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  27.92 
 
 		 181 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  26.7 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  27.57 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  26.7 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  20.83 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2851  YceI family protein  24.87 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344848  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  25.5 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  26.7 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  28.4 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1217  hypothetical protein  29.1 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000670198  normal  0.302127 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  28.28 
 
 		 177 aa  67.8  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3043  YceI family protein  25.54 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  28.4 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  25.52 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3514  YceI family protein  27.91 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  25.33 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  27.59 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0950  hypothetical protein  28.46 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000269923  normal  0.477847 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  31.88 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>