More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0607 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0607  YceI family protein  100 
 
 		 195 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0631  YceI family protein  98.96 
 
 		 193 aa  394  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0683  YceI family protein  96.37 
 
 		 193 aa  358  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0232  YceI  96.37 
 
 		 193 aa  358  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0716  YceI family protein  96.37 
 
 		 193 aa  358  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.943663  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2669  YceI family protein  91.71 
 
 		 193 aa  352  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3804  hypothetical protein  92.78 
 
 		 211 aa  347  6e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7381  YceI  92.94 
 
 		 187 aa  333  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398085  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3333  YceI  85.94 
 
 		 192 aa  330  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3367  hypothetical protein  86.46 
 
 		 192 aa  323  8.000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2568  hypothetical protein  86.46 
 
 		 192 aa  323  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1160  YceI-like family protein  86.46 
 
 		 192 aa  323  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0298  hypothetical protein  86.46 
 
 		 192 aa  323  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1273  YceI-like family protein  88.89 
 
 		 187 aa  320  8e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2382  YceI-like family protein  88.3 
 
 		 187 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3377  YceI-like family protein  88.3 
 
 		 187 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0704  YceI family protein  72.54 
 
 		 193 aa  292  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  normal  0.494453 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  70.98 
 
 		 192 aa  278  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3995  hypothetical protein  68.78 
 
 		 189 aa  276  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645736  normal  0.347265 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  68.62 
 
 		 189 aa  269  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2066  hypothetical protein  67.88 
 
 		 192 aa  258  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0648985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5860  YceI family protein  68.91 
 
 		 192 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2961  YceI family protein  67.86 
 
 		 198 aa  240  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2717  signal peptide protein  67.26 
 
 		 198 aa  237  9e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.999831  normal  0.128957 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2551  YceI family protein  66.67 
 
 		 198 aa  236  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.298445 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2953  hypothetical protein  62.35 
 
 		 196 aa  224  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2816  YceI  60.57 
 
 		 196 aa  223  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3505  YceI family protein  53.8 
 
 		 191 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.781833 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1028  YceI family protein  52.33 
 
 		 191 aa  177  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3578  YceI family protein  50.58 
 
 		 192 aa  174  6e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0457  YceI family protein  47.94 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1463  putative signal peptide protein  52.35 
 
 		 151 aa  159  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.036668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2226  YceI family protein  44.44 
 
 		 192 aa  157  9e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000678562  decreased coverage  0.00447323 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  43.68 
 
 		 196 aa  156  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  51.39 
 
 		 192 aa  150  8.999999999999999e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3508  periplasmic protein  46.51 
 
 		 196 aa  148  6e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.234261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  48.97 
 
 		 189 aa  147  7e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0469  YceI family protein  41.52 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730302  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1519  YceI family protein  39.49 
 
 		 191 aa  140  8e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3154  YceI  41.28 
 
 		 192 aa  134  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0257242  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  44.24 
 
 		 201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  42.26 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3509  hypothetical protein  36.75 
 
 		 198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.137598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3992  YceI family protein  38.46 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1536  YceI family protein  35.9 
 
 		 191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1738  YceI family protein  36.31 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1721  YceI family protein  35.75 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3736  YceI  35.5 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.192641 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1735  hypothetical protein  37.13 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1799  hypothetical protein  37.13 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  39.18 
 
 		 237 aa  105  5e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  38.6 
 
 		 237 aa  103  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  38.82 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2217  YceI family protein  35.79 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0912  YceI  36.47 
 
 		 188 aa  102  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580537  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  38.26 
 
 		 205 aa  101  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  37.36 
 
 		 200 aa  99  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0815  hypothetical protein  38.78 
 
 		 197 aa  98.6  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  38.67 
 
 		 196 aa  98.6  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  37.91 
 
 		 195 aa  97.8  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  38.95 
 
 		 254 aa  96.7  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  35.4 
 
 		 205 aa  95.9  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  37.11 
 
 		 196 aa  95.1  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0830  YceI  38.1 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0387934  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0892  YceI family protein  36.72 
 
 		 193 aa  94  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0806  YceI family protein  39.13 
 
 		 187 aa  94  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  35.16 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  35.26 
 
 		 235 aa  92  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  36.11 
 
 		 207 aa  92  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  32.45 
 
 		 212 aa  91.3  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  32.74 
 
 		 195 aa  90.9  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1334  YceI  38.97 
 
 		 189 aa  90.5  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000025527  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  35.85 
 
 		 201 aa  89.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  33.84 
 
 		 213 aa  89.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  33.84 
 
 		 213 aa  89.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  38.46 
 
 		 183 aa  89.7  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  36.2 
 
 		 201 aa  89.4  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0790  signal peptide protein  38.51 
 
 		 189 aa  89  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  35.8 
 
 		 188 aa  89  4e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  34.68 
 
 		 214 aa  88.6  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  37.64 
 
 		 182 aa  87.8  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  37.64 
 
 		 182 aa  87.8  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  37.64 
 
 		 182 aa  87.8  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  36 
 
 		 216 aa  87.8  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  34.09 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  35.62 
 
 		 202 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0736  YceI family protein  38.71 
 
 		 187 aa  87  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.193865  normal  0.716983 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  36.24 
 
 		 213 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  35.76 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  33.87 
 
 		 195 aa  86.3  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  36.3 
 
 		 206 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  36.67 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  33.73 
 
 		 197 aa  85.9  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  33.73 
 
 		 197 aa  85.5  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  32.53 
 
 		 178 aa  85.5  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  34.93 
 
 		 183 aa  85.9  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  34.97 
 
 		 206 aa  85.5  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  35.63 
 
 		 182 aa  85.5  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  33.33 
 
 		 207 aa  84.7  7e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  33.33 
 
 		 186 aa  84.7  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>