More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5860 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5860  YceI family protein  100 
 
 		 192 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2066  hypothetical protein  96.35 
 
 		 192 aa  364  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0648985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  81.25 
 
 		 192 aa  337  4e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0704  YceI family protein  72.54 
 
 		 193 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  normal  0.494453 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3995  hypothetical protein  73.54 
 
 		 189 aa  293  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645736  normal  0.347265 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  72.19 
 
 		 189 aa  286  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2669  YceI family protein  68.91 
 
 		 193 aa  262  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3333  YceI  68.91 
 
 		 192 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0631  YceI family protein  69.43 
 
 		 193 aa  257  8e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0683  YceI family protein  68.91 
 
 		 193 aa  256  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0232  YceI  68.91 
 
 		 193 aa  256  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0716  YceI family protein  68.91 
 
 		 193 aa  256  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.943663  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0607  YceI family protein  68.91 
 
 		 195 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3367  hypothetical protein  68.91 
 
 		 192 aa  254  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1160  YceI-like family protein  68.91 
 
 		 192 aa  254  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0298  hypothetical protein  68.91 
 
 		 192 aa  254  4e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2568  hypothetical protein  68.91 
 
 		 192 aa  254  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1273  YceI-like family protein  68.42 
 
 		 187 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2382  YceI-like family protein  67.84 
 
 		 187 aa  251  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3377  YceI-like family protein  67.84 
 
 		 187 aa  251  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3804  hypothetical protein  66.84 
 
 		 211 aa  249  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7381  YceI  67.86 
 
 		 187 aa  246  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398085  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2551  YceI family protein  62.5 
 
 		 198 aa  234  6e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.298445 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2961  YceI family protein  62.5 
 
 		 198 aa  234  6e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2717  signal peptide protein  61.9 
 
 		 198 aa  230  8.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.999831  normal  0.128957 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2953  hypothetical protein  58.58 
 
 		 196 aa  218  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2816  YceI  59.28 
 
 		 196 aa  214  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3505  YceI family protein  47.02 
 
 		 191 aa  164  5.9999999999999996e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.781833 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0457  YceI family protein  45.79 
 
 		 189 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3578  YceI family protein  48.21 
 
 		 192 aa  163  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1028  YceI family protein  47.62 
 
 		 191 aa  161  7e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1463  putative signal peptide protein  47.33 
 
 		 151 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.036668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  45.12 
 
 		 192 aa  145  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0469  YceI family protein  36.07 
 
 		 211 aa  143  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730302  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2226  YceI family protein  43.09 
 
 		 192 aa  142  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000678562  decreased coverage  0.00447323 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  40.31 
 
 		 196 aa  141  6e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  46.21 
 
 		 189 aa  141  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3508  periplasmic protein  43.45 
 
 		 196 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.234261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1519  YceI family protein  36.17 
 
 		 191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  41.49 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3992  YceI family protein  39.78 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3154  YceI  36.6 
 
 		 192 aa  125  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0257242  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3509  hypothetical protein  35.54 
 
 		 198 aa  122  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.137598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1536  YceI family protein  35.94 
 
 		 191 aa  121  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1738  YceI family protein  35.94 
 
 		 188 aa  121  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  42.94 
 
 		 205 aa  121  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1721  YceI family protein  35.94 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3736  YceI  36.69 
 
 		 218 aa  118  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.192641 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1735  hypothetical protein  36.42 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0912  YceI  36.09 
 
 		 188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580537  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1799  hypothetical protein  36.47 
 
 		 188 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  37.43 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0815  hypothetical protein  37.41 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2217  YceI family protein  35.94 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  37.09 
 
 		 205 aa  102  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  36.47 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0830  YceI  37.41 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0387934  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  38.86 
 
 		 183 aa  99  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  36.6 
 
 		 205 aa  99  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  35.88 
 
 		 201 aa  98.6  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  35.84 
 
 		 200 aa  98.2  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  32.65 
 
 		 193 aa  97.8  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  36.47 
 
 		 206 aa  97.8  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  37.25 
 
 		 201 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  36.84 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  37.84 
 
 		 187 aa  96.3  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  34.41 
 
 		 195 aa  96.3  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  39.73 
 
 		 237 aa  95.9  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1150  periplasmic protein  31.44 
 
 		 206 aa  95.9  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.138125  normal  0.79265 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  36.36 
 
 		 182 aa  95.1  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  36.36 
 
 		 182 aa  95.1  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  36.36 
 
 		 182 aa  95.1  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  37.08 
 
 		 201 aa  94.7  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  39.04 
 
 		 237 aa  94.7  7e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1782  YceI  29.69 
 
 		 204 aa  94.7  8e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0100028 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  36.87 
 
 		 181 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  36.05 
 
 		 214 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  31.82 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  35.1 
 
 		 195 aa  92.8  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  35.58 
 
 		 213 aa  91.3  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  37.08 
 
 		 181 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  36.69 
 
 		 201 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  37.65 
 
 		 223 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  33.75 
 
 		 197 aa  89  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  32.97 
 
 		 207 aa  89  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  39.33 
 
 		 254 aa  89.4  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  33.75 
 
 		 197 aa  88.6  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  37.06 
 
 		 201 aa  88.6  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  30.72 
 
 		 195 aa  88.2  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  34.87 
 
 		 201 aa  88.2  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  31.12 
 
 		 213 aa  87.8  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  31.12 
 
 		 213 aa  87.8  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0806  YceI family protein  32.75 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  32.43 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  39.04 
 
 		 235 aa  87  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1334  YceI  40.15 
 
 		 189 aa  86.7  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000025527  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  30.43 
 
 		 186 aa  87  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  30.77 
 
 		 212 aa  85.9  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  33.72 
 
 		 186 aa  85.9  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  34.87 
 
 		 201 aa  85.9  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>