More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0815 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0815  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  396  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0830  YceI  76 
 
 		 199 aa  280  9e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0387934  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0736  YceI family protein  59.57 
 
 		 187 aa  229  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.193865  normal  0.716983 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0806  YceI family protein  57.98 
 
 		 187 aa  225  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0790  signal peptide protein  57.98 
 
 		 189 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1028  YceI family protein  44 
 
 		 191 aa  137  8.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3508  periplasmic protein  40.83 
 
 		 196 aa  134  9e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.234261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0457  YceI family protein  39.76 
 
 		 189 aa  132  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3992  YceI family protein  34.41 
 
 		 188 aa  128  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3736  YceI  38.46 
 
 		 218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.192641 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  40.94 
 
 		 192 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3505  YceI family protein  40.14 
 
 		 191 aa  119  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.781833 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1519  YceI family protein  33.89 
 
 		 191 aa  118  4.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0704  YceI family protein  40.12 
 
 		 193 aa  118  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  normal  0.494453 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3509  hypothetical protein  39.63 
 
 		 198 aa  118  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.137598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3154  YceI  35.64 
 
 		 192 aa  117  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0257242  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2226  YceI family protein  35.85 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000678562  decreased coverage  0.00447323 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0469  YceI family protein  37.91 
 
 		 211 aa  115  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730302  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0912  YceI  30.98 
 
 		 188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580537  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3578  YceI family protein  36.05 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1782  YceI  31.98 
 
 		 204 aa  108  7.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0100028 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5860  YceI family protein  37.91 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  36.98 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2066  hypothetical protein  36.42 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0648985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0683  YceI family protein  40.52 
 
 		 193 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0232  YceI  40.52 
 
 		 193 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0716  YceI family protein  40.52 
 
 		 193 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.943663  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  30.54 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3995  hypothetical protein  36.31 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645736  normal  0.347265 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2961  YceI family protein  38.1 
 
 		 198 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  34.62 
 
 		 179 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  35.88 
 
 		 189 aa  102  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0607  YceI family protein  39.22 
 
 		 195 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  32.14 
 
 		 192 aa  102  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0631  YceI family protein  39.22 
 
 		 193 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  33.72 
 
 		 201 aa  102  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2551  YceI family protein  37.41 
 
 		 198 aa  101  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.298445 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3333  YceI  37.66 
 
 		 192 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3804  hypothetical protein  39.61 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2669  YceI family protein  38.56 
 
 		 193 aa  99.8  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1536  YceI family protein  28.48 
 
 		 191 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1738  YceI family protein  28.66 
 
 		 188 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1735  hypothetical protein  28.48 
 
 		 188 aa  98.6  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1273  YceI-like family protein  37.75 
 
 		 187 aa  98.6  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1721  YceI family protein  28.48 
 
 		 188 aa  98.6  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1799  hypothetical protein  28.48 
 
 		 188 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2717  signal peptide protein  34.23 
 
 		 198 aa  97.8  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.999831  normal  0.128957 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7381  YceI  39.86 
 
 		 187 aa  98.2  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398085  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2382  YceI-like family protein  37.09 
 
 		 187 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3377  YceI-like family protein  37.09 
 
 		 187 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1160  YceI-like family protein  37.09 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3367  hypothetical protein  37.09 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2568  hypothetical protein  37.09 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0298  hypothetical protein  37.09 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1150  periplasmic protein  28.65 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.138125  normal  0.79265 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  29.24 
 
 		 196 aa  95.9  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2953  hypothetical protein  35.81 
 
 		 196 aa  95.9  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  31.46 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2217  YceI family protein  27.51 
 
 		 199 aa  92.8  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2816  YceI  35.29 
 
 		 196 aa  92.4  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  30.99 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  28.65 
 
 		 237 aa  92  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  28.26 
 
 		 237 aa  91.7  6e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  31.64 
 
 		 213 aa  91.3  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  32.04 
 
 		 197 aa  89.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  32.28 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  32.04 
 
 		 197 aa  89.4  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  32.77 
 
 		 201 aa  88.2  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0890  YceI  31.07 
 
 		 220 aa  86.7  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  30.94 
 
 		 182 aa  86.3  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3043  YceI family protein  31.22 
 
 		 210 aa  85.5  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  29.08 
 
 		 214 aa  85.5  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  30.9 
 
 		 177 aa  84.7  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  29.05 
 
 		 207 aa  84.7  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  29.59 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  31.25 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  28.26 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  30.6 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1334  YceI  33.85 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000025527  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  30.41 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  33.15 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  28.33 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  32.68 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  30.17 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  34.09 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  34.23 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  27.84 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  29.41 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  27.98 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  32.78 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  31.91 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  29.05 
 
 		 209 aa  77.8  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  32.56 
 
 		 181 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1513  YceI-like family protein  28.26 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.137036  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  33.33 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  29.34 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  31.58 
 
 		 181 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0008  YceI like family protein  28.21 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  31.46 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  26.84 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>