More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0232 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0683  YceI family protein  100 
 
 		 193 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0232  YceI  100 
 
 		 193 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0716  YceI family protein  100 
 
 		 193 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.943663  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2669  YceI family protein  95.34 
 
 		 193 aa  361  3e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0631  YceI family protein  97.41 
 
 		 193 aa  361  4e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0607  YceI family protein  96.37 
 
 		 195 aa  359  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3804  hypothetical protein  94.3 
 
 		 211 aa  350  7e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7381  YceI  95.29 
 
 		 187 aa  339  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398085  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3333  YceI  86.98 
 
 		 192 aa  333  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3367  hypothetical protein  87.5 
 
 		 192 aa  327  8e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2568  hypothetical protein  87.5 
 
 		 192 aa  327  8e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1160  YceI-like family protein  87.5 
 
 		 192 aa  327  8e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0298  hypothetical protein  87.5 
 
 		 192 aa  327  8e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1273  YceI-like family protein  89.47 
 
 		 187 aa  322  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2382  YceI-like family protein  88.89 
 
 		 187 aa  322  3e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3377  YceI-like family protein  88.89 
 
 		 187 aa  322  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0704  YceI family protein  73.58 
 
 		 193 aa  296  9e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  normal  0.494453 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  72.02 
 
 		 192 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3995  hypothetical protein  69.31 
 
 		 189 aa  280  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645736  normal  0.347265 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  67.55 
 
 		 189 aa  268  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2066  hypothetical protein  67.88 
 
 		 192 aa  259  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0648985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5860  YceI family protein  68.91 
 
 		 192 aa  259  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2961  YceI family protein  69.05 
 
 		 198 aa  243  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2551  YceI family protein  67.86 
 
 		 198 aa  239  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.298445 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2717  signal peptide protein  66.86 
 
 		 198 aa  238  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.999831  normal  0.128957 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2953  hypothetical protein  62.35 
 
 		 196 aa  225  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2816  YceI  60.57 
 
 		 196 aa  223  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3505  YceI family protein  53.8 
 
 		 191 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.781833 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1028  YceI family protein  52.91 
 
 		 191 aa  181  7e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3578  YceI family protein  50.58 
 
 		 192 aa  176  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0457  YceI family protein  49.48 
 
 		 189 aa  173  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1463  putative signal peptide protein  53.02 
 
 		 151 aa  161  7e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.036668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2226  YceI family protein  44.97 
 
 		 192 aa  160  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000678562  decreased coverage  0.00447323 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  44.21 
 
 		 196 aa  159  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3508  periplasmic protein  47.67 
 
 		 196 aa  152  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.234261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  50.69 
 
 		 192 aa  151  7e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  48.28 
 
 		 189 aa  148  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0469  YceI family protein  40.46 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730302  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1519  YceI family protein  39.49 
 
 		 191 aa  141  7e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3154  YceI  41.52 
 
 		 192 aa  134  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0257242  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  42.86 
 
 		 205 aa  123  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3509  hypothetical protein  38.55 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.137598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  44.85 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3992  YceI family protein  39.56 
 
 		 188 aa  122  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1536  YceI family protein  36.31 
 
 		 191 aa  114  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1721  YceI family protein  36.27 
 
 		 188 aa  114  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1738  YceI family protein  36.31 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3736  YceI  35.5 
 
 		 218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.192641 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1735  hypothetical protein  36.63 
 
 		 188 aa  111  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1799  hypothetical protein  37.13 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  39.77 
 
 		 237 aa  108  6e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  37.57 
 
 		 199 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  39.18 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0912  YceI  37.65 
 
 		 188 aa  106  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580537  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  37.75 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2217  YceI family protein  35.79 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0815  hypothetical protein  40.14 
 
 		 197 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  38.67 
 
 		 196 aa  99.8  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  36.78 
 
 		 200 aa  99  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  36.02 
 
 		 205 aa  99  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  36.81 
 
 		 193 aa  97.4  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0830  YceI  39.46 
 
 		 199 aa  97.1  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0387934  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  37.11 
 
 		 196 aa  97.1  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  37.25 
 
 		 195 aa  97.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  38.95 
 
 		 254 aa  96.7  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  36.42 
 
 		 235 aa  95.9  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  37.5 
 
 		 207 aa  95.5  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0892  YceI family protein  36.72 
 
 		 193 aa  95.1  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0806  YceI family protein  36.05 
 
 		 187 aa  93.6  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  36.48 
 
 		 201 aa  93.2  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  32.03 
 
 		 212 aa  92.4  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  36.81 
 
 		 201 aa  92.8  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  32.74 
 
 		 195 aa  92  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  33.84 
 
 		 213 aa  91.7  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1334  YceI  40.14 
 
 		 189 aa  91.7  6e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000025527  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  33.84 
 
 		 213 aa  91.7  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  35.26 
 
 		 214 aa  91.3  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  38.01 
 
 		 183 aa  91.3  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  37.99 
 
 		 182 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  37.99 
 
 		 182 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  37.99 
 
 		 182 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  37.58 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  35.5 
 
 		 191 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  35.5 
 
 		 191 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  35.5 
 
 		 191 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  34.42 
 
 		 201 aa  89  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  34.9 
 
 		 202 aa  89  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  33.52 
 
 		 201 aa  89  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  35.5 
 
 		 191 aa  88.6  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0736  YceI family protein  36.05 
 
 		 187 aa  88.6  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.193865  normal  0.716983 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0790  signal peptide protein  37.89 
 
 		 189 aa  88.2  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  35.19 
 
 		 188 aa  88.2  7e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  32.12 
 
 		 210 aa  88.2  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  34.32 
 
 		 197 aa  87.8  8e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  34.32 
 
 		 197 aa  87.8  9e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  36.11 
 
 		 201 aa  87.8  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  36.13 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  36.13 
 
 		 197 aa  87  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  35.57 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  36.63 
 
 		 189 aa  87.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>