More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3992 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3992  YceI family protein  100 
 
 
188 aa  388  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1738  YceI family protein  61.17 
 
 
188 aa  242  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1721  YceI family protein  60.64 
 
 
188 aa  242  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1536  YceI family protein  60.64 
 
 
191 aa  241  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1735  hypothetical protein  63.37 
 
 
188 aa  237  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282306  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1799  hypothetical protein  64.46 
 
 
188 aa  235  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2217  YceI family protein  50.81 
 
 
199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275332  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1028  YceI family protein  50.88 
 
 
191 aa  184  7e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0457  YceI family protein  48.68 
 
 
189 aa  182  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3578  YceI family protein  50 
 
 
192 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728206  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3505  YceI family protein  49.41 
 
 
191 aa  177  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.781833 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1150  periplasmic protein  46.52 
 
 
206 aa  173  9.999999999999999e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.138125  normal  0.79265 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1782  YceI  44.44 
 
 
204 aa  167  6e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0100028 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2226  YceI family protein  45.03 
 
 
192 aa  158  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000678562  decreased coverage  0.00447323 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3508  periplasmic protein  44.44 
 
 
196 aa  154  6e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.234261  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0469  YceI family protein  34.95 
 
 
211 aa  147  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730302  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3509  hypothetical protein  37.58 
 
 
198 aa  139  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.137598  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  38.1 
 
 
189 aa  134  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3995  hypothetical protein  39.56 
 
 
189 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645736  normal  0.347265 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0704  YceI family protein  40.11 
 
 
193 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  normal  0.494453 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  37.5 
 
 
192 aa  125  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2717  signal peptide protein  36.53 
 
 
198 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.999831  normal  0.128957 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2066  hypothetical protein  38.07 
 
 
192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0648985  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5860  YceI family protein  39.2 
 
 
192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2816  YceI  36.36 
 
 
196 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2953  hypothetical protein  37.06 
 
 
196 aa  118  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386991  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3736  YceI  37.57 
 
 
218 aa  117  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.192641 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0815  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0232  YceI  38.37 
 
 
193 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145864  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0683  YceI family protein  38.37 
 
 
193 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246292  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0716  YceI family protein  38.37 
 
 
193 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.943663  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2669  YceI family protein  37.21 
 
 
193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3804  hypothetical protein  36.63 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0830  YceI  34.34 
 
 
199 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0387934  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0631  YceI family protein  37.21 
 
 
193 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3154  YceI  33.16 
 
 
192 aa  112  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0257242  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0607  YceI family protein  37.21 
 
 
195 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  35.11 
 
 
196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2551  YceI family protein  35.33 
 
 
198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.298445 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0736  YceI family protein  34.74 
 
 
187 aa  111  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.193865  normal  0.716983 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7381  YceI  36.26 
 
 
187 aa  111  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398085  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2961  YceI family protein  34.73 
 
 
198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0806  YceI family protein  34.21 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  35.54 
 
 
192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1273  YceI-like family protein  36.05 
 
 
187 aa  108  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2382  YceI-like family protein  35.47 
 
 
187 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3377  YceI-like family protein  35.47 
 
 
187 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2568  hypothetical protein  35.47 
 
 
192 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1160  YceI-like family protein  35.47 
 
 
192 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3367  hypothetical protein  35.47 
 
 
192 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3333  YceI  35.47 
 
 
192 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0298  hypothetical protein  35.47 
 
 
192 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  36.14 
 
 
189 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0790  signal peptide protein  34.22 
 
 
189 aa  101  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534784  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  33.16 
 
 
179 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  34.32 
 
 
237 aa  99.8  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  34.32 
 
 
237 aa  99.4  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0912  YceI  30.49 
 
 
188 aa  97.1  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580537  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1519  YceI family protein  30.91 
 
 
191 aa  95.5  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  34.73 
 
 
235 aa  93.6  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  33.73 
 
 
254 aa  92  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  30.51 
 
 
206 aa  92.4  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  33.52 
 
 
201 aa  91.7  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  31.14 
 
 
182 aa  91.3  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  28.9 
 
 
213 aa  90.9  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0009  putative lipoprotein  32.98 
 
 
199 aa  91.3  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.686573  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1434  YceI like family protein  32.98 
 
 
199 aa  91.3  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.311091  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0008  YceI like family protein  32.98 
 
 
199 aa  90.9  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  28.9 
 
 
213 aa  90.9  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0007  YceI like family protein  32.98 
 
 
217 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1154  putative lipoprotein  32.98 
 
 
217 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0008  putative lipoprotein  32.98 
 
 
217 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  36.91 
 
 
196 aa  90.1  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  32.89 
 
 
202 aa  88.2  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  29.89 
 
 
207 aa  87.4  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4161  YceI family protein  29.57 
 
 
211 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  33.11 
 
 
205 aa  87.4  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  32.89 
 
 
206 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  28.83 
 
 
199 aa  85.9  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  33.68 
 
 
190 aa  85.5  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  29.02 
 
 
189 aa  85.1  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3043  YceI family protein  33.16 
 
 
210 aa  85.1  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  29.48 
 
 
207 aa  84.7  7e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  26.95 
 
 
210 aa  84.7  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1513  YceI-like family protein  31.43 
 
 
185 aa  84.7  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.137036  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  30 
 
 
205 aa  84.3  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  31.08 
 
 
205 aa  84  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0009  YceI like family protein  30.48 
 
 
216 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1317  hypothetical protein  33.51 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.269449  normal  0.532637 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  29.88 
 
 
212 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  36.59 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  29.03 
 
 
216 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  28.92 
 
 
216 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  30.48 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  32.77 
 
 
196 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  30.99 
 
 
213 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  32.11 
 
 
219 aa  79  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  32.88 
 
 
177 aa  79  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0892  YceI family protein  29.69 
 
 
193 aa  79  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0604  YceI family protein  29.38 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>