More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2226 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2226  YceI family protein  100 
 
 		 192 aa  394  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000678562  decreased coverage  0.00447323 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1028  YceI family protein  70.69 
 
 		 191 aa  257  8e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3578  YceI family protein  67.65 
 
 		 192 aa  248  5e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0457  YceI family protein  57.07 
 
 		 189 aa  229  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3505  YceI family protein  62.13 
 
 		 191 aa  227  8e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.781833 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3508  periplasmic protein  61.85 
 
 		 196 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.234261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0469  YceI family protein  42.94 
 
 		 211 aa  179  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730302  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2217  YceI family protein  49.16 
 
 		 199 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2669  YceI family protein  48.28 
 
 		 193 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3804  hypothetical protein  47.13 
 
 		 211 aa  160  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7381  YceI  47.93 
 
 		 187 aa  159  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398085  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0683  YceI family protein  47.13 
 
 		 193 aa  158  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3992  YceI family protein  45.03 
 
 		 188 aa  158  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0232  YceI  47.13 
 
 		 193 aa  158  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0716  YceI family protein  47.13 
 
 		 193 aa  158  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.943663  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1273  YceI-like family protein  45.98 
 
 		 187 aa  157  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2382  YceI-like family protein  45.4 
 
 		 187 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3367  hypothetical protein  45.4 
 
 		 192 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3377  YceI-like family protein  45.4 
 
 		 187 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3333  YceI  45.4 
 
 		 192 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0298  hypothetical protein  45.4 
 
 		 192 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1160  YceI-like family protein  45.4 
 
 		 192 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2568  hypothetical protein  45.4 
 
 		 192 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0631  YceI family protein  46.55 
 
 		 193 aa  155  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0607  YceI family protein  46.55 
 
 		 195 aa  155  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0704  YceI family protein  41.24 
 
 		 193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  normal  0.494453 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3995  hypothetical protein  41.85 
 
 		 189 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645736  normal  0.347265 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  42.08 
 
 		 192 aa  144  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  41.49 
 
 		 189 aa  143  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2961  YceI family protein  43.79 
 
 		 198 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2717  signal peptide protein  40.94 
 
 		 198 aa  142  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.999831  normal  0.128957 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2551  YceI family protein  43.2 
 
 		 198 aa  142  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.298445 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2066  hypothetical protein  43.35 
 
 		 192 aa  140  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0648985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5860  YceI family protein  44.19 
 
 		 192 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2953  hypothetical protein  42.6 
 
 		 196 aa  140  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3509  hypothetical protein  39.16 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.137598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2816  YceI  40.57 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  36.65 
 
 		 196 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1536  YceI family protein  40.72 
 
 		 191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1738  YceI family protein  40.12 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1735  hypothetical protein  40.12 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1799  hypothetical protein  40.12 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  39.05 
 
 		 192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1721  YceI family protein  39.52 
 
 		 188 aa  124  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3736  YceI  39.05 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.192641 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1782  YceI  36.07 
 
 		 204 aa  122  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0100028 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1519  YceI family protein  35.98 
 
 		 191 aa  120  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1150  periplasmic protein  34.92 
 
 		 206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.138125  normal  0.79265 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  37.06 
 
 		 189 aa  119  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0830  YceI  34.71 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0387934  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0806  YceI family protein  36.7 
 
 		 187 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3154  YceI  35.42 
 
 		 192 aa  108  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0257242  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0736  YceI family protein  37.31 
 
 		 187 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.193865  normal  0.716983 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0912  YceI  36.81 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580537  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0815  hypothetical protein  34.25 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0790  signal peptide protein  32.99 
 
 		 189 aa  95.1  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  37.24 
 
 		 191 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  35.33 
 
 		 205 aa  94.7  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  37.24 
 
 		 191 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  37.24 
 
 		 191 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  36.18 
 
 		 191 aa  94.4  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  36.18 
 
 		 191 aa  94.4  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  37.24 
 
 		 191 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  37.24 
 
 		 191 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  36.18 
 
 		 191 aa  94.4  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  37.24 
 
 		 191 aa  94.4  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  37.24 
 
 		 191 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  37.24 
 
 		 191 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  37.24 
 
 		 191 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  38.29 
 
 		 201 aa  93.2  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  36.18 
 
 		 191 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  36.84 
 
 		 196 aa  92.4  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  35.68 
 
 		 191 aa  91.7  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  35.71 
 
 		 192 aa  92  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  37.42 
 
 		 237 aa  90.1  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  36.77 
 
 		 237 aa  89  4e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  36.57 
 
 		 188 aa  87.8  9e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1463  putative signal peptide protein  35.1 
 
 		 151 aa  87.4  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.036668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1680  YceI family protein  33.52 
 
 		 200 aa  87.8  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03828  YceI  34.66 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  31.28 
 
 		 213 aa  85.9  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  31.28 
 
 		 213 aa  85.9  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  32.47 
 
 		 210 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  32.28 
 
 		 179 aa  85.5  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1739  hypothetical protein  32.63 
 
 		 203 aa  85.1  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000033243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  32.45 
 
 		 216 aa  84.7  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  36.76 
 
 		 191 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  32.2 
 
 		 195 aa  84.3  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  34.81 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  36.76 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  31.79 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  35.26 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  34.52 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  34.52 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  32.2 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  34.52 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2451  YceI family protein  31.28 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  35.14 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  34.46 
 
 		 254 aa  81.3  0.000000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  35.63 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>