More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_2669 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_2669  YceI family protein  100 
 
 
193 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0683  YceI family protein  95.34 
 
 
193 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246292  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0232  YceI  95.34 
 
 
193 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0716  YceI family protein  95.34 
 
 
193 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.943663  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0631  YceI family protein  92.75 
 
 
193 aa  348  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0607  YceI family protein  91.71 
 
 
195 aa  347  8e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3804  hypothetical protein  90.16 
 
 
211 aa  339  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3333  YceI  88.02 
 
 
192 aa  337  5e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3367  hypothetical protein  88.54 
 
 
192 aa  331  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2568  hypothetical protein  88.54 
 
 
192 aa  331  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1160  YceI-like family protein  88.54 
 
 
192 aa  331  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0298  hypothetical protein  88.54 
 
 
192 aa  331  4e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7381  YceI  91.18 
 
 
187 aa  328  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398085  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1273  YceI-like family protein  90.06 
 
 
187 aa  325  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2382  YceI-like family protein  89.47 
 
 
187 aa  324  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3377  YceI-like family protein  89.47 
 
 
187 aa  324  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0704  YceI family protein  71.5 
 
 
193 aa  292  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  normal  0.494453 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3995  hypothetical protein  68.78 
 
 
189 aa  279  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645736  normal  0.347265 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  69.95 
 
 
192 aa  278  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  68.09 
 
 
189 aa  270  7e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2066  hypothetical protein  67.88 
 
 
192 aa  260  6.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0648985  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5860  YceI family protein  68.91 
 
 
192 aa  259  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2717  signal peptide protein  68.64 
 
 
198 aa  244  4.9999999999999997e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.999831  normal  0.128957 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2961  YceI family protein  67.86 
 
 
198 aa  241  6e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2551  YceI family protein  66.67 
 
 
198 aa  236  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.298445 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2816  YceI  60 
 
 
196 aa  223  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2953  hypothetical protein  60.59 
 
 
196 aa  221  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386991  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1028  YceI family protein  53.49 
 
 
191 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3505  YceI family protein  53.8 
 
 
191 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.781833 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3578  YceI family protein  52.33 
 
 
192 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728206  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0457  YceI family protein  47.94 
 
 
189 aa  170  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1463  putative signal peptide protein  55.03 
 
 
151 aa  169  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.036668  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2226  YceI family protein  46.03 
 
 
192 aa  165  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000678562  decreased coverage  0.00447323 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  45.79 
 
 
196 aa  164  9e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  52.78 
 
 
192 aa  156  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3508  periplasmic protein  48.26 
 
 
196 aa  156  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.234261  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  48.28 
 
 
189 aa  148  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0469  YceI family protein  39.31 
 
 
211 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730302  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1519  YceI family protein  38.97 
 
 
191 aa  140  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3154  YceI  42.11 
 
 
192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0257242  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  44.85 
 
 
201 aa  124  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3509  hypothetical protein  37.95 
 
 
198 aa  124  9e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.137598  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  42.26 
 
 
205 aa  122  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1721  YceI family protein  37.31 
 
 
188 aa  121  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1536  YceI family protein  37.31 
 
 
191 aa  121  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1738  YceI family protein  37.31 
 
 
188 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3992  YceI family protein  38.46 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1735  hypothetical protein  37.79 
 
 
188 aa  118  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282306  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1799  hypothetical protein  38.32 
 
 
188 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3736  YceI  34.91 
 
 
218 aa  114  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.192641 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  40 
 
 
237 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  39.41 
 
 
237 aa  109  3e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2217  YceI family protein  36.84 
 
 
199 aa  109  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275332  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  39.07 
 
 
205 aa  106  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  36.46 
 
 
199 aa  104  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  37.93 
 
 
200 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  36.65 
 
 
205 aa  102  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0892  YceI family protein  38.98 
 
 
193 aa  102  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  38.67 
 
 
196 aa  101  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  38.36 
 
 
196 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  37.91 
 
 
195 aa  99.4  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  36.81 
 
 
193 aa  97.4  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  38.37 
 
 
254 aa  96.3  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0912  YceI  34.71 
 
 
188 aa  96.3  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580537  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  37.74 
 
 
201 aa  96.3  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0815  hypothetical protein  38.1 
 
 
197 aa  95.9  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  38.04 
 
 
201 aa  95.9  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  36.42 
 
 
235 aa  95.5  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  33.93 
 
 
195 aa  94.4  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  32.03 
 
 
212 aa  94  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  36.42 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  35.56 
 
 
201 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1334  YceI  40.14 
 
 
189 aa  94  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000025527  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  35.4 
 
 
207 aa  93.2  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  36.91 
 
 
202 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  36.36 
 
 
201 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  33.17 
 
 
213 aa  92.4  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  37.78 
 
 
201 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  37.99 
 
 
182 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  37.99 
 
 
182 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  37.99 
 
 
182 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  33.17 
 
 
213 aa  92.4  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  37.58 
 
 
213 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0830  YceI  38.1 
 
 
199 aa  91.7  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0387934  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  37.43 
 
 
183 aa  92  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0976  YceI  38.99 
 
 
213 aa  91.3  8e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  37.42 
 
 
197 aa  90.9  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  37.42 
 
 
197 aa  90.9  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  34.34 
 
 
178 aa  90.5  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  34.57 
 
 
207 aa  89.4  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  37.21 
 
 
189 aa  89.4  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  32.73 
 
 
210 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  36.24 
 
 
206 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  37.64 
 
 
181 aa  88.6  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  36 
 
 
191 aa  87.8  8e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  36 
 
 
191 aa  87.8  8e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  36 
 
 
191 aa  87.8  8e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  36 
 
 
191 aa  87.8  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  36 
 
 
191 aa  87.8  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  36 
 
 
191 aa  87.8  8e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>