More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1721 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1721  YceI family protein  100 
 
 		 188 aa  393  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1735  hypothetical protein  98.4 
 
 		 188 aa  387  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1536  YceI family protein  97.87 
 
 		 191 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1738  YceI family protein  97.87 
 
 		 188 aa  384  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1799  hypothetical protein  97.87 
 
 		 188 aa  358  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3992  YceI family protein  60.64 
 
 		 188 aa  242  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2217  YceI family protein  50.83 
 
 		 199 aa  191  7e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1782  YceI  40.96 
 
 		 204 aa  157  6e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0100028 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1150  periplasmic protein  42.37 
 
 		 206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.138125  normal  0.79265 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0457  YceI family protein  41.27 
 
 		 189 aa  153  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1028  YceI family protein  45.03 
 
 		 191 aa  153  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3578  YceI family protein  45.78 
 
 		 192 aa  151  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3505  YceI family protein  44.58 
 
 		 191 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.781833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0469  YceI family protein  34.15 
 
 		 211 aa  128  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730302  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  35.94 
 
 		 192 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  35.98 
 
 		 189 aa  124  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2226  YceI family protein  39.52 
 
 		 192 aa  124  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000678562  decreased coverage  0.00447323 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3508  periplasmic protein  36.21 
 
 		 196 aa  123  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.234261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3509  hypothetical protein  32.73 
 
 		 198 aa  120  8e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.137598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0704  YceI family protein  34.24 
 
 		 193 aa  118  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  normal  0.494453 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3995  hypothetical protein  33.7 
 
 		 189 aa  118  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645736  normal  0.347265 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2669  YceI family protein  37.79 
 
 		 193 aa  118  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2066  hypothetical protein  35.43 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0648985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5860  YceI family protein  36 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  35.98 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1273  YceI-like family protein  38.32 
 
 		 187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3333  YceI  37.93 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2568  hypothetical protein  37.72 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2382  YceI-like family protein  37.72 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3377  YceI-like family protein  37.72 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1160  YceI-like family protein  37.72 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3367  hypothetical protein  37.72 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0298  hypothetical protein  37.72 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2953  hypothetical protein  34.12 
 
 		 196 aa  111  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0232  YceI  36.63 
 
 		 193 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145864  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0683  YceI family protein  36.63 
 
 		 193 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0716  YceI family protein  36.63 
 
 		 193 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.943663  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0607  YceI family protein  37.14 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0631  YceI family protein  37.71 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  40.43 
 
 		 192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2816  YceI  32.18 
 
 		 196 aa  108  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3804  hypothetical protein  35.47 
 
 		 211 aa  108  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7381  YceI  35.93 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398085  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1519  YceI family protein  31.55 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  35.37 
 
 		 189 aa  102  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2717  signal peptide protein  32.14 
 
 		 198 aa  102  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.999831  normal  0.128957 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3154  YceI  32.63 
 
 		 192 aa  102  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0257242  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2961  YceI family protein  33.53 
 
 		 198 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3736  YceI  30.18 
 
 		 218 aa  101  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.192641 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2551  YceI family protein  33.33 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.298445 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0815  hypothetical protein  29.52 
 
 		 197 aa  98.6  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  33.53 
 
 		 213 aa  98.2  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  33.53 
 
 		 213 aa  98.2  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  33.73 
 
 		 237 aa  97.8  8e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  33.73 
 
 		 237 aa  97.4  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0736  YceI family protein  33.7 
 
 		 187 aa  95.9  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.193865  normal  0.716983 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  34.73 
 
 		 235 aa  94.4  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0790  signal peptide protein  31.67 
 
 		 189 aa  92.8  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0806  YceI family protein  32.61 
 
 		 187 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  33.73 
 
 		 179 aa  91.7  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  31.35 
 
 		 201 aa  91.7  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  31.77 
 
 		 207 aa  91.3  7e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0830  YceI  29.27 
 
 		 199 aa  90.1  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0387934  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  32.26 
 
 		 207 aa  89.7  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  33.33 
 
 		 205 aa  89  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  33.92 
 
 		 196 aa  88.2  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  33.12 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  33.14 
 
 		 182 aa  85.5  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  33.13 
 
 		 254 aa  84.7  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  31.14 
 
 		 182 aa  84.3  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0912  YceI  27.87 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580537  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0469  hypothetical protein  35.07 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.189395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  30.86 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0443  hypothetical protein  34.56 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  31.21 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  30.99 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3043  YceI family protein  30.98 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1536  hypothetical protein  34.56 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  30.43 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4161  YceI family protein  29.52 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1463  putative signal peptide protein  29.93 
 
 		 151 aa  80.9  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.036668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  30.32 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  32.47 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  28.65 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  32.04 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7583  YceI-like family protein  27.12 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.94246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  32.39 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  31.33 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  31.36 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0892  YceI family protein  30.89 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  32.57 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  29.17 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  32.74 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  29.52 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  31.33 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  28.92 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  28.31 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  30.56 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  30.99 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  27.13 
 
 		 197 aa  77.8  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>