38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1295 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1295  YceI  100 
 
 		 196 aa  394  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.018481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4045  YceI  73.91 
 
 		 193 aa  286  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.033044  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4350  YceI-like family protein  70.11 
 
 		 193 aa  272  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4910  hypothetical protein  67.98 
 
 		 190 aa  251  6e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.372677  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4460  YceI family protein  70.11 
 
 		 193 aa  250  7e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111755 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0930  YceI family protein  68.97 
 
 		 193 aa  247  9e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0891  YceI family protein  69.77 
 
 		 193 aa  246  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.13317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56420  hypothetical protein  66.29 
 
 		 190 aa  245  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0994  YceI family protein  68.02 
 
 		 193 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000032385 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1131  YceI family protein  63.48 
 
 		 208 aa  225  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1959  hypothetical protein  40.84 
 
 		 191 aa  145  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1183  YceI family protein  42.01 
 
 		 195 aa  141  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.123234  normal  0.710564 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56510  hypothetical protein  42.35 
 
 		 196 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.844348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1651  YceI family protein  34.39 
 
 		 191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2893  hypothetical protein  36.36 
 
 		 191 aa  135  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4915  hypothetical protein  40.33 
 
 		 195 aa  135  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.524381  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1628  YceI family protein  35.48 
 
 		 191 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.390594  normal  0.0802652 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1636  YceI family protein  34.95 
 
 		 191 aa  132  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.431474  normal  0.0372178 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1561  YceI family protein  34.95 
 
 		 191 aa  132  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1772  YceI family protein  34.46 
 
 		 191 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1809  YceI family protein  34.46 
 
 		 191 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.712609  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1704  YceI family protein  35.33 
 
 		 192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.356687  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2513  YceI family protein  33.9 
 
 		 191 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1765  YceI family protein  33.9 
 
 		 191 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.039857  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0136  YceI  37.3 
 
 		 198 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2061  YceI family protein  34.78 
 
 		 191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1182  hypothetical protein  39.41 
 
 		 371 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.104267 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2223  YceI family protein  33.71 
 
 		 195 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.128547  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2275  YceI  35.06 
 
 		 213 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000110231  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03973  YceI family protein  35.26 
 
 		 194 aa  117  9e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000954749  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2605  YceI family protein  30.39 
 
 		 191 aa  115  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.911496 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2476  YceI family protein  31.4 
 
 		 191 aa  115  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00617169  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3983  YceI family protein  34.34 
 
 		 198 aa  112  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  38.82 
 
 		 1042 aa  107  9.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1355  YceI  37.3 
 
 		 193 aa  105  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05610  hypothetical protein  30.46 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3229  hypothetical protein  27.33 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.474421  normal  0.780413 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3103  hypothetical protein  29.76 
 
 		 192 aa  41.2  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>